RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381765.7

HPCAL1-202, Transcript of hippocalcin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HPCAL1, Length 1,904 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1-202ENST00000381765 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.75■■■■□ 3.31
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HPCAL1-202ENST00000381765 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.58■■■□□ 2.33
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HPCAL1-202ENST00000381765 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.45■■■□□ 2.3
HPCAL1-202ENST00000381765 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.31■■■□□ 2.28
HPCAL1-202ENST00000381765 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.3■■■□□ 2.28
HPCAL1-202ENST00000381765 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.99■■■□□ 2.23
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HPCAL1-202ENST00000381765 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.85■■■□□ 2.05
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HPCAL1-202ENST00000381765 WIZO95785 1651 aa27.48■■□□□ 1.99
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HPCAL1-202ENST00000381765 NCAPD3P42695 1498 aa27.25■■□□□ 1.95
HPCAL1-202ENST00000381765 SMARCA2P51531 1590 aa27.23■■□□□ 1.95
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HPCAL1-202ENST00000381765 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.36■■□□□ 1.81
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HPCAL1-202ENST00000381765 ABCC8Q09428 1581 aa26.35■■□□□ 1.81
HPCAL1-202ENST00000381765 CFTRP13569 1480 aa26.3■■□□□ 1.8
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HPCAL1-202ENST00000381765 PRDM2Q13029 1718 aa26.14■■□□□ 1.78
HPCAL1-202ENST00000381765 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.14■■□□□ 1.77
HPCAL1-202ENST00000381765 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.1■■□□□ 1.77
HPCAL1-202ENST00000381765 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
HPCAL1-202ENST00000381765 SYNJ1O43426 1573 aa26.04■■□□□ 1.76
HPCAL1-202ENST00000381765 WDR62O43379 1518 aa26.01■■□□□ 1.75
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HPCAL1-202ENST00000381765 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.85■■□□□ 1.73
HPCAL1-202ENST00000381765 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.84■■□□□ 1.73
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HPCAL1-202ENST00000381765 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.55■■□□□ 1.68
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HPCAL1-202ENST00000381765 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.45■■□□□ 1.67
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HPCAL1-202ENST00000381765 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.15■■□□□ 1.62
HPCAL1-202ENST00000381765 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.15■■□□□ 1.62
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HPCAL1-202ENST00000381765 PBRM1Q86U86 1689 aa25.11■■□□□ 1.61
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HPCAL1-202ENST00000381765 CEP162Q5TB80 1403 aa25.11■■□□□ 1.61
HPCAL1-202ENST00000381765 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.1■■□□□ 1.61
HPCAL1-202ENST00000381765 FBLN2P98095 1184 aa25.08■■□□□ 1.6
HPCAL1-202ENST00000381765 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
HPCAL1-202ENST00000381765 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
HPCAL1-202ENST00000381765 CUL7Q14999 1698 aa25.02■■□□□ 1.6
HPCAL1-202ENST00000381765 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
HPCAL1-202ENST00000381765 SYNJ2O15056 1496 aa24.96■■□□□ 1.59
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