RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215570.7

TIMM13-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM13, Length 1,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM13-201ENST00000215570 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.88■■■■□ 3.82
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TIMM13-201ENST00000215570 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.85■■■□□ 2.85
TIMM13-201ENST00000215570 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
TIMM13-201ENST00000215570 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.07■■■□□ 2.72
TIMM13-201ENST00000215570 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.99■■■□□ 2.71
TIMM13-201ENST00000215570 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.51■■■□□ 2.63
TIMM13-201ENST00000215570 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.25■■■□□ 2.59
TIMM13-201ENST00000215570 ABCC9O60706 1549 aa31.04■■■□□ 2.56
TIMM13-201ENST00000215570 SCRIBQ14160 1630 aa30.86■■■□□ 2.53
TIMM13-201ENST00000215570 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
TIMM13-201ENST00000215570 NACADO15069 1562 aa30.67■■■□□ 2.5
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TIMM13-201ENST00000215570 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.47■■■□□ 2.47
TIMM13-201ENST00000215570 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.46■■■□□ 2.47
TIMM13-201ENST00000215570 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.43■■■□□ 2.46
TIMM13-201ENST00000215570 TRIM41Q8WV44 630 aa30.23■■■□□ 2.43
TIMM13-201ENST00000215570 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.16■■■□□ 2.42
TIMM13-201ENST00000215570 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.12■■■□□ 2.41
TIMM13-201ENST00000215570 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
TIMM13-201ENST00000215570 WIZO95785 1651 aa29.94■■■□□ 2.38
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TIMM13-201ENST00000215570 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
TIMM13-201ENST00000215570 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
TIMM13-201ENST00000215570 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
TIMM13-201ENST00000215570 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
TIMM13-201ENST00000215570 SMARCA4P51532 1647 aa29.59■■■□□ 2.33
TIMM13-201ENST00000215570 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
TIMM13-201ENST00000215570 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.49■■■□□ 2.31
TIMM13-201ENST00000215570 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.41■■■□□ 2.3
TIMM13-201ENST00000215570 SMARCA2P51531 1590 aa29.39■■■□□ 2.29
TIMM13-201ENST00000215570 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.38■■■□□ 2.29
TIMM13-201ENST00000215570 ABCC8Q09428 1581 aa29.22■■■□□ 2.27
TIMM13-201ENST00000215570 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.17■■■□□ 2.26
TIMM13-201ENST00000215570 EEA1Q15075 1411 aa29.14■■■□□ 2.26
TIMM13-201ENST00000215570 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.11■■■□□ 2.25
TIMM13-201ENST00000215570 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
TIMM13-201ENST00000215570 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.24
TIMM13-201ENST00000215570 TNIKQ9UKE5 1360 aa29■■■□□ 2.23
TIMM13-201ENST00000215570 SOGA1O94964 1423 aa28.98■■■□□ 2.23
TIMM13-201ENST00000215570 CEP162Q5TB80 1403 aa28.95■■■□□ 2.22
TIMM13-201ENST00000215570 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.95■■■□□ 2.22
TIMM13-201ENST00000215570 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.83■■■□□ 2.21
TIMM13-201ENST00000215570 GOLGA3Q08378 1498 aa28.82■■■□□ 2.2
TIMM13-201ENST00000215570 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
TIMM13-201ENST00000215570 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.77■■■□□ 2.2
TIMM13-201ENST00000215570 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
TIMM13-201ENST00000215570 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
TIMM13-201ENST00000215570 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.68■■■□□ 2.18
TIMM13-201ENST00000215570 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
TIMM13-201ENST00000215570 SYNJ1O43426 1573 aa28.66■■■□□ 2.18
TIMM13-201ENST00000215570 KIF21BO75037 1637 aa28.64■■■□□ 2.18
TIMM13-201ENST00000215570 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
TIMM13-201ENST00000215570 CLIP1P30622 1438 aa28.44■■■□□ 2.14
TIMM13-201ENST00000215570 TOP2BQ02880 1626 aa28.43■■■□□ 2.14
TIMM13-201ENST00000215570 HMGXB3Q12766 1538 aa28.36■■■□□ 2.13
TIMM13-201ENST00000215570 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.35■■■□□ 2.13
TIMM13-201ENST00000215570 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.33■■■□□ 2.13
TIMM13-201ENST00000215570 NCAPD3P42695 1498 aa28.33■■■□□ 2.13
TIMM13-201ENST00000215570 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.31■■■□□ 2.12
TIMM13-201ENST00000215570 APLP2Q06481 763 aa28.28■■■□□ 2.12
TIMM13-201ENST00000215570 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.22■■■□□ 2.11
TIMM13-201ENST00000215570 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TIMM13-201ENST00000215570 PRXQ9BXM0 1461 aa28.14■■■□□ 2.1
TIMM13-201ENST00000215570 CFTRP13569 1480 aa28.08■■■□□ 2.09
TIMM13-201ENST00000215570 CUX1P39880 1505 aa28.07■■■□□ 2.08
TIMM13-201ENST00000215570 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TIMM13-201ENST00000215570 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TIMM13-201ENST00000215570 KIF27Q86VH2 1401 aa28.05■■■□□ 2.08
TIMM13-201ENST00000215570 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
TIMM13-201ENST00000215570 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
TIMM13-201ENST00000215570 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
TIMM13-201ENST00000215570 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
TIMM13-201ENST00000215570 ARAP1Q96P48 1450 aa27.93■■■□□ 2.06
TIMM13-201ENST00000215570 PRDM2Q13029 1718 aa27.88■■■□□ 2.05
TIMM13-201ENST00000215570 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
TIMM13-201ENST00000215570 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.81■■■□□ 2.04
TIMM13-201ENST00000215570 NEUROD1Q13562 356 aa27.78■■■□□ 2.04
TIMM13-201ENST00000215570 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.76■■■□□ 2.03
TIMM13-201ENST00000215570 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
TIMM13-201ENST00000215570 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.7■■■□□ 2.02
TIMM13-201ENST00000215570 CUX2O14529 1486 aa27.7■■■□□ 2.02
TIMM13-201ENST00000215570 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
TIMM13-201ENST00000215570 IGF1RP08069 1367 aa27.67■■■□□ 2.02
TIMM13-201ENST00000215570 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
TIMM13-201ENST00000215570 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.58■■■□□ 2.01
TIMM13-201ENST00000215570 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.58■■■□□ 2.01
TIMM13-201ENST00000215570 MAP3K1Q13233 1512 aa27.57■■■□□ 2
TIMM13-201ENST00000215570 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.56■■■□□ 2
TIMM13-201ENST00000215570 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.55■■■□□ 2
TIMM13-201ENST00000215570 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.54■■■□□ 2
TIMM13-201ENST00000215570 MIER1Q8N108 512 aa27.48■■□□□ 1.99
TIMM13-201ENST00000215570 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.46■■□□□ 1.99
TIMM13-201ENST00000215570 TIAM1Q13009 1591 aa27.45■■□□□ 1.99
TIMM13-201ENST00000215570 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.43■■□□□ 1.98
TIMM13-201ENST00000215570 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.39■■□□□ 1.98
TIMM13-201ENST00000215570 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.35■■□□□ 1.97
TIMM13-201ENST00000215570 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TIMM13-201ENST00000215570 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.34■■□□□ 1.97
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