Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 32.7
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 32.7
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 32.7
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-206ENST00000587730 1813 ntTSL 1 (best)19.69■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 32.7
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-208ENST00000588692 1478 ntTSL 515.31■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 32.7
UTP3Q9NQZ2 MED15-210ENST00000432052 598 ntTSL 422.59■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 32.7
UTP3Q9NQZ2 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.132e-9■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 DGCR8-205ENST00000475941 2669 ntTSL 217.54■□□□□ 0.47e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 UBXN4-204ENST00000426921 568 ntTSL 422■■□□□ 1.114e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.935e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 UBXN4-202ENST00000415164 548 ntTSL 420.47■□□□□ 0.874e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AURKA-213ENST00000456249 810 ntTSL 219.95■□□□□ 0.785e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AURKA-210ENST00000422322 744 ntTSL 319.72■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 PCNP-207ENST00000498274 786 ntTSL 219.62■□□□□ 0.734e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG16-203ENST00000586846 582 ntTSL 418.84■□□□□ 0.617e-15■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.354e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG16-205ENST00000587743 2665 nt17.17■□□□□ 0.347e-15■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 RPS18-236ENST00000490191 996 ntTSL 216.86■□□□□ 0.294e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 UBXN4-203ENST00000416538 1255 ntTSL 516.09■□□□□ 0.174e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AURKA-211ENST00000441357 991 ntTSL 315.72■□□□□ 0.115e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 PCNP-202ENST00000460231 2165 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.14e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 07e-15■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.134e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.164e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 SRSF3-203ENST00000477442 1095 ntTSL 513.93□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 SRSF3-201ENST00000339436 1518 ntTSL 213.75□□□□□ -0.214e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AURKA-212ENST00000451915 584 ntTSL 313.64□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 PCNP-205ENST00000470490 589 ntTSL 513.42□□□□□ -0.264e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AURKA-207ENST00000395914 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.434e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.434e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 RPS18-234ENST00000476222 685 ntTSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.434e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 USO1-204ENST00000514213 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.457e-15■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG16-208ENST00000591956 556 ntTSL 212.03□□□□□ -0.487e-15■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 PCNP-204ENST00000469941 2028 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.494e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 PCNP-206ENST00000486406 742 ntTSL 211.29□□□□□ -0.64e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AURKA-209ENST00000420474 879 ntTSL 211.26□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.667e-15■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.677e-15■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 RPS18-232ENST00000474626 639 ntTSL 310.69□□□□□ -0.74e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 RPS18-237ENST00000496813 642 ntTSL 210.69□□□□□ -0.74e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.737e-15■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.785e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AURKA-205ENST00000395911 2145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 MARK3-220ENST00000560417 579 ntTSL 39.77□□□□□ -0.854e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AURKA-206ENST00000395913 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.865e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 SRSF3-207ENST00000620389 2655 ntTSL 29.56□□□□□ -0.884e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)9.54□□□□□ -0.887e-15■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AURKA-204ENST00000395907 1902 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.95e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AURKA-201ENST00000312783 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.95e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 CCT4-202ENST00000461370 388 ntTSL 27.77□□□□□ -1.177e-15■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 PCNP-203ENST00000465366 771 ntTSL 27.43□□□□□ -1.224e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 ACACA-233ENST00000614450 591 ntTSL 47.4□□□□□ -1.224e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.274e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 UBXN4-205ENST00000467065 334 ntTSL 57.01□□□□□ -1.294e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 ACACA-225ENST00000612120 566 ntTSL 46.46□□□□□ -1.384e-8■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 NUP205-206ENST00000477620 1800 ntTSL 55.44□□□□□ -1.545e-7■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 DNMT3B-201ENST00000201963 4255 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AC005381.1-201ENST00000593065 769 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 32.6
UTP3Q9NQZ2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.964e-7■■■■■ 32.5
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.514e-7■■■■■ 32.5
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 32.5
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 32.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-207ENST00000480987 752 ntTSL 413.28□□□□□ -0.283e-15■■■■■ 32.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-203ENST00000461310 648 ntTSL 58.76□□□□□ -1.013e-15■■■■■ 32.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-204ENST00000467249 566 ntTSL 27.93□□□□□ -1.143e-15■■■■■ 32.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH3-209ENST00000486854 635 ntTSL 26.51□□□□□ -1.373e-15■■■■■ 32.5
UTP3Q9NQZ2 VARS-217ENST00000440048 804 ntTSL 1 (best)25.24■■□□□ 1.634e-6■■■■■ 32.5
UTP3Q9NQZ2 TRIM25-203ENST00000570473 498 ntTSL 311.61□□□□□ -0.555e-6■■■■■ 32.5
UTP3Q9NQZ2 NUCB1-212ENST00000492367 1515 ntTSL 220.46■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 CRELD1-208ENST00000467713 540 ntTSL 212.73□□□□□ -0.371e-10■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 CFH-203ENST00000466229 6985 ntTSL 1 (best)4.79□□□□□ -1.644e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.94e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.836e-8■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.686e-8■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.516e-8■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 CHTOP-206ENST00000495554 2553 ntTSL 215.89■□□□□ 0.136e-8■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.386e-7■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 XPO1-206ENST00000428210 6776 ntTSL 215.91■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.347e-8■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.697e-8■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.887e-8■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.698e-8■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.575e-7■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.415e-7■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 CCSAP-204ENST00000483092 3492 ntTSL 1 (best)17.46■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.51■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 32.4
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-208ENST00000504907 1682 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 32.4
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3527 ms