Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.052e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-208ENST00000618509 582 ntTSL 414.63□□□□□ -0.072e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.212e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.312e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-202ENST00000358053 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 OSBPL2-211ENST00000622332 754 ntTSL 310.85□□□□□ -0.672e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 NBR2-203ENST00000467245 1158 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.782e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 NBR2-201ENST00000356906 978 ntTSL 1 (best)8.2□□□□□ -1.12e-73■■■■■ 1751.4
UTP3Q9NQZ2 JDP2-206ENST00000559060 631 ntTSL 327.03■■□□□ 1.921e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.071e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.031e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 NMT1-205ENST00000587120 573 ntTSL 516.31■□□□□ 0.21e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.091e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 JDP2-204ENST00000437176 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.591e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 MITF-213ENST00000461511 574 ntTSL 411.19□□□□□ -0.621e-68■■■■■ 1639.7
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.374e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.234e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.094e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.124e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 ARMCX5-GPRASP2-207ENST00000486740 689 ntTSL 310.61□□□□□ -0.714e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 ARMCX5-GPRASP2-209ENST00000602463 561 ntTSL 49.96□□□□□ -0.824e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 GPRASP1-204ENST00000466098 689 ntTSL 39.53□□□□□ -0.884e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 ARMCX5-GPRASP2-208ENST00000602366 573 ntTSL 47.23□□□□□ -1.254e-67■■■■■ 1602.4
UTP3Q9NQZ2 TRIM68-202ENST00000526337 874 ntTSL 516.17■□□□□ 0.185e-64■■■■■ 1527.9
UTP3Q9NQZ2 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.165e-64■■■■■ 1527.9
UTP3Q9NQZ2 TRIM68-203ENST00000531101 3187 ntTSL 512.76□□□□□ -0.375e-64■■■■■ 1527.9
UTP3Q9NQZ2 WNT5B-205ENST00000539198 530 ntTSL 423.19■■□□□ 1.38e-7■■■■■ 1509.2
UTP3Q9NQZ2 WNT5B-210ENST00000545811 661 ntTSL 221.1■□□□□ 0.978e-7■■■■■ 1509.2
UTP3Q9NQZ2 CNDP2-204ENST00000577409 422 ntTSL 222.42■■□□□ 1.182e-62■■■■■ 1490.5
UTP3Q9NQZ2 PARP10-207ENST00000526007 2179 ntTSL 1 (best)24.11■■□□□ 1.457e-61■■■■■ 1453.3
UTP3Q9NQZ2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.37e-61■■■■■ 1453.3
UTP3Q9NQZ2 PARP10-209ENST00000527262 3027 ntTSL 1 (best)16.63■□□□□ 0.257e-61■■■■■ 1453.3
UTP3Q9NQZ2 FMC1-205ENST00000488886 432 ntTSL 315.69■□□□□ 0.17e-61■■■■■ 1453.3
UTP3Q9NQZ2 FMC1-203ENST00000481123 460 ntTSL 215.4■□□□□ 0.067e-61■■■■■ 1453.3
UTP3Q9NQZ2 FMC1-202ENST00000468383 345 ntTSL 315.3■□□□□ 0.047e-61■■■■■ 1453.3
UTP3Q9NQZ2 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.037e-61■■■■■ 1453.3
UTP3Q9NQZ2 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.137e-61■■■■■ 1453.3
UTP3Q9NQZ2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.157e-61■■■■■ 1453.3
UTP3Q9NQZ2 FMC1-204ENST00000482181 386 ntTSL 213.51□□□□□ -0.257e-61■■■■■ 1453.3
UTP3Q9NQZ2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.073e-59■■■■■ 1416
UTP3Q9NQZ2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.663e-59■■■■■ 1416
UTP3Q9NQZ2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.193e-59■■■■■ 1416
UTP3Q9NQZ2 GGA1-218ENST00000475445 2614 ntTSL 215.36■□□□□ 0.053e-59■■■■■ 1416
UTP3Q9NQZ2 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.013e-59■■■■■ 1416
UTP3Q9NQZ2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.491e-54■■■■■ 1304.2
UTP3Q9NQZ2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.61e-54■■■■■ 1304.2
UTP3Q9NQZ2 ADAM22-206ENST00000412441 726 ntTSL 518.77■□□□□ 0.61e-54■■■■■ 1304.2
UTP3Q9NQZ2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.481e-54■■■■■ 1304.2
UTP3Q9NQZ2 ADAM22-203ENST00000398203 2697 ntTSL 514.24□□□□□ -0.131e-54■■■■■ 1304.2
UTP3Q9NQZ2 ADAM22-201ENST00000265727 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.271e-54■■■■■ 1304.2
UTP3Q9NQZ2 ADAM22-205ENST00000398209 9144 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-54■■■■■ 1304.2
UTP3Q9NQZ2 OSBPL3-209ENST00000415162 534 ntTSL 48.36□□□□□ -1.071e-54■■■■■ 1304.2
UTP3Q9NQZ2 OSBPL3-211ENST00000441059 540 ntTSL 46.05□□□□□ -1.441e-54■■■■■ 1304.2
UTP3Q9NQZ2 MITF-216ENST00000495741 473 ntTSL 412.23□□□□□ -0.456e-8■■■■■ 1253
UTP3Q9NQZ2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.382e-6■■■■■ 1242.1
UTP3Q9NQZ2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 1242.1
UTP3Q9NQZ2 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-51■■■■■ 1229.7
UTP3Q9NQZ2 TTC28-AS1-203ENST00000419253 846 ntTSL 1 (best)13.24□□□□□ -0.297e-50■■■■■ 1192.4
UTP3Q9NQZ2 TTC28-AS1-205ENST00000425112 807 ntTSL 310.82□□□□□ -0.687e-50■■■■■ 1192.4
UTP3Q9NQZ2 TTC28-AS1-220ENST00000454996 837 ntTSL 28.19□□□□□ -1.17e-50■■■■■ 1192.4
UTP3Q9NQZ2 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)22.06■■□□□ 1.121e-52■■■■■ 1167.3
UTP3Q9NQZ2 MSH4-201ENST00000263187 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.83e-48■■■■■ 1155.2
UTP3Q9NQZ2 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.343e-48■■■■■ 1155.2
UTP3Q9NQZ2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.981e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.751e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.661e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 SPIRE2-206ENST00000564878 663 ntTSL 319.13■□□□□ 0.651e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.321e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 AGER-212ENST00000484849 1597 ntTSL 1 (best)16.59■□□□□ 0.251e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.221e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.221e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 CENPU-206ENST00000514781 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.35■□□□□ 0.211e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 AGER-211ENST00000473619 932 ntTSL 1 (best)16.01■□□□□ 0.151e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 AGER-213ENST00000488669 887 ntTSL 1 (best)16.01■□□□□ 0.151e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.071e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.061e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-205ENST00000517745 391 ntTSL 315.14■□□□□ 0.011e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 AGER-210ENST00000469940 557 ntTSL 214.81□□□□□ -0.041e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-224ENST00000568502 546 ntTSL 413.23□□□□□ -0.292e-61■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.31e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.331e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 SP2-AS1-202ENST00000433001 912 ntTSL 312.06□□□□□ -0.481e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-206ENST00000561825 562 ntTSL 512.03□□□□□ -0.482e-61■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 SP2-AS1-201ENST00000411573 1738 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.851e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 SPIRE2-207ENST00000565103 587 ntTSL 29.71□□□□□ -0.861e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 ULBP1-201ENST00000229708 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.941e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-208ENST00000518094 347 ntTSL 28.37□□□□□ -1.071e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 SP2-AS1-203ENST00000451140 1225 ntTSL 47.29□□□□□ -1.241e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.511e-46■■■■■ 1117.9
UTP3Q9NQZ2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.274e-45■■■■■ 1080.7
UTP3Q9NQZ2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.184e-45■■■■■ 1080.7
UTP3Q9NQZ2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.184e-45■■■■■ 1080.7
UTP3Q9NQZ2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.184e-45■■■■■ 1080.7
UTP3Q9NQZ2 DNAJC19-202ENST00000469657 1239 ntTSL 216.05■□□□□ 0.164e-45■■■■■ 1080.7
UTP3Q9NQZ2 DNAJC19-205ENST00000479269 610 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.944e-45■■■■■ 1080.7
UTP3Q9NQZ2 ANKRD33B-202ENST00000504806 1591 ntTSL 527.88■■■□□ 2.051e-43■■■■■ 1043.4
UTP3Q9NQZ2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.41e-43■■■■■ 1043.4
UTP3Q9NQZ2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.391e-43■■■■■ 1043.4
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3244.9 ms