RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.37■■■■■ 5.33
UBXN4-202ENST00000415164 ABCC9O60706 1549 aa43.75■■■■■ 4.59
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.38■■■■■ 4.54
UBXN4-202ENST00000415164 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.46■■■■■ 4.23
UBXN4-202ENST00000415164 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.2■■■■■ 4.19
UBXN4-202ENST00000415164 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.1■■■■■ 4.17
UBXN4-202ENST00000415164 NACADO15069 1562 aa41.1■■■■■ 4.17
UBXN4-202ENST00000415164 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.77■■■■■ 4.12
UBXN4-202ENST00000415164 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.44■■■■■ 4.06
UBXN4-202ENST00000415164 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.38■■■■■ 4.06
UBXN4-202ENST00000415164 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.2■■■■■ 4.03
UBXN4-202ENST00000415164 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
UBXN4-202ENST00000415164 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.85■■■■□ 3.97
UBXN4-202ENST00000415164 SCRIBQ14160 1630 aa39.72■■■■□ 3.95
UBXN4-202ENST00000415164 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.59■■■■□ 3.93
UBXN4-202ENST00000415164 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.41■■■■□ 3.9
UBXN4-202ENST00000415164 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.38■■■■□ 3.9
UBXN4-202ENST00000415164 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
UBXN4-202ENST00000415164 NCAPD3P42695 1498 aa37.94■■■■□ 3.66
UBXN4-202ENST00000415164 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.86■■■■□ 3.65
UBXN4-202ENST00000415164 ERCC6Q03468 1493 aa37.82■■■■□ 3.64
UBXN4-202ENST00000415164 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.81■■■■□ 3.64
UBXN4-202ENST00000415164 SMARCA4P51532 1647 aa37.77■■■■□ 3.64
UBXN4-202ENST00000415164 SMARCA2P51531 1590 aa37.73■■■■□ 3.63
UBXN4-202ENST00000415164 HMGXB3Q12766 1538 aa37.65■■■■□ 3.62
UBXN4-202ENST00000415164 CUX2O14529 1486 aa37.64■■■■□ 3.62
UBXN4-202ENST00000415164 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
UBXN4-202ENST00000415164 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
UBXN4-202ENST00000415164 NESP48681 1621 aa37.51■■■■□ 3.6
UBXN4-202ENST00000415164 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.31■■■■□ 3.56
UBXN4-202ENST00000415164 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.3■■■■□ 3.56
UBXN4-202ENST00000415164 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.12■■■■□ 3.53
UBXN4-202ENST00000415164 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
UBXN4-202ENST00000415164 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.99■■■■□ 3.51
UBXN4-202ENST00000415164 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.96■■■■□ 3.51
UBXN4-202ENST00000415164 WIZO95785 1651 aa36.86■■■■□ 3.49
UBXN4-202ENST00000415164 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.85■■■■□ 3.49
UBXN4-202ENST00000415164 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.68■■■■□ 3.46
UBXN4-202ENST00000415164 WDR62O43379 1518 aa36.53■■■■□ 3.44
UBXN4-202ENST00000415164 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.52■■■■□ 3.44
UBXN4-202ENST00000415164 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
UBXN4-202ENST00000415164 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.47■■■■□ 3.43
UBXN4-202ENST00000415164 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
UBXN4-202ENST00000415164 CFTRP13569 1480 aa36.36■■■■□ 3.41
UBXN4-202ENST00000415164 TRIM41Q8WV44 630 aa36.33■■■■□ 3.41
UBXN4-202ENST00000415164 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
UBXN4-202ENST00000415164 OSCARQ8IYS5 282 aa35.99■■■■□ 3.35
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.99■■■■□ 3.35
UBXN4-202ENST00000415164 PRDM2Q13029 1718 aa35.91■■■■□ 3.34
UBXN4-202ENST00000415164 IFT140Q96RY7 1462 aa35.77■■■■□ 3.32
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.31
UBXN4-202ENST00000415164 TOPBP1Q92547 1522 aa35.73■■■■□ 3.31
UBXN4-202ENST00000415164 ABCC8Q09428 1581 aa35.59■■■■□ 3.29
UBXN4-202ENST00000415164 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.57■■■■□ 3.28
UBXN4-202ENST00000415164 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
UBXN4-202ENST00000415164 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.49■■■■□ 3.27
UBXN4-202ENST00000415164 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.49■■■■□ 3.27
UBXN4-202ENST00000415164 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.49■■■■□ 3.27
UBXN4-202ENST00000415164 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.44■■■■□ 3.262e-8■■■□□ 15.9
UBXN4-202ENST00000415164 FBLN2P98095 1184 aa35.39■■■■□ 3.26
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGEF11O15085 1522 aa35.37■■■■□ 3.25
UBXN4-202ENST00000415164 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
UBXN4-202ENST00000415164 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
UBXN4-202ENST00000415164 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.3■■■■□ 3.24
UBXN4-202ENST00000415164 CHD1O14646 1710 aa35.26■■■■□ 3.24
UBXN4-202ENST00000415164 SOGA1O94964 1423 aa35.24■■■■□ 3.23
UBXN4-202ENST00000415164 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.24■■■■□ 3.23
UBXN4-202ENST00000415164 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
UBXN4-202ENST00000415164 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.15■■■■□ 3.22
UBXN4-202ENST00000415164 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.08■■■■□ 3.21
UBXN4-202ENST00000415164 CUX1P39880 1505 aa35.06■■■■□ 3.2
UBXN4-202ENST00000415164 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
UBXN4-202ENST00000415164 ARAP1Q96P48 1450 aa35.02■■■■□ 3.2
UBXN4-202ENST00000415164 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
UBXN4-202ENST00000415164 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
UBXN4-202ENST00000415164 WDR97A6NE52 1622 aa34.95■■■■□ 3.18
UBXN4-202ENST00000415164 GRIN2BQ13224 1484 aa34.92■■■■□ 3.18
UBXN4-202ENST00000415164 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
UBXN4-202ENST00000415164 SYNJ1O43426 1573 aa34.86■■■■□ 3.17
UBXN4-202ENST00000415164 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.83■■■■□ 3.17
UBXN4-202ENST00000415164 SYNJ2O15056 1496 aa34.81■■■■□ 3.16
UBXN4-202ENST00000415164 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.79■■■■□ 3.16
UBXN4-202ENST00000415164 PBRM1Q86U86 1689 aa34.74■■■■□ 3.15
UBXN4-202ENST00000415164 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.67■■■■□ 3.14
UBXN4-202ENST00000415164 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.62■■■■□ 3.13
UBXN4-202ENST00000415164 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.13
UBXN4-202ENST00000415164 GRIN2AQ12879 1464 aa34.46■■■■□ 3.11
UBXN4-202ENST00000415164 TOP2BQ02880 1626 aa34.43■■■■□ 3.1
UBXN4-202ENST00000415164 ADAMTS12P58397 1594 aa34.41■■■■□ 3.1
UBXN4-202ENST00000415164 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.41■■■■□ 3.1
UBXN4-202ENST00000415164 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.35■■■■□ 3.09
UBXN4-202ENST00000415164 CEP170Q5SW79 1584 aa34.34■■■■□ 3.09
UBXN4-202ENST00000415164 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.33■■■■□ 3.09
UBXN4-202ENST00000415164 NUP160Q12769 1436 aa34.31■■■■□ 3.08
UBXN4-202ENST00000415164 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.24■■■■□ 3.07
UBXN4-202ENST00000415164 SHROOM2Q13796 1616 aa34.12■■■■□ 3.05
UBXN4-202ENST00000415164 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
UBXN4-202ENST00000415164 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
UBXN4-202ENST00000415164 JPH4Q96JJ6 628 aa34.05■■■■□ 3.04
UBXN4-202ENST00000415164 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.92■■■■□ 3.02
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