RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467713.5

CRELD1-208, Transcript of cysteine rich with EGF like domains 1, humanhuman

TSL 2

Gene CRELD1, Length 540 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1-208ENST00000467713 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.54■■■□□ 2.48
CRELD1-208ENST00000467713 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.58■■■□□ 2.01
CRELD1-208ENST00000467713 ABCC9O60706 1549 aa27.56■■■□□ 2
CRELD1-208ENST00000467713 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.27■■□□□ 1.8
CRELD1-208ENST00000467713 NACADO15069 1562 aa26.06■■□□□ 1.76
CRELD1-208ENST00000467713 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.88■■□□□ 1.73
CRELD1-208ENST00000467713 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.69■■□□□ 1.7
CRELD1-208ENST00000467713 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.68■■□□□ 1.7
CRELD1-208ENST00000467713 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.66■■□□□ 1.7
CRELD1-208ENST00000467713 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
CRELD1-208ENST00000467713 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.47■■□□□ 1.67
CRELD1-208ENST00000467713 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CRELD1-208ENST00000467713 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.29■■□□□ 1.64
CRELD1-208ENST00000467713 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.23■■□□□ 1.63
CRELD1-208ENST00000467713 SCRIBQ14160 1630 aa25.02■■□□□ 1.6
CRELD1-208ENST00000467713 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.94■■□□□ 1.58
CRELD1-208ENST00000467713 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.87■■□□□ 1.57
CRELD1-208ENST00000467713 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CRELD1-208ENST00000467713 NCAPD3P42695 1498 aa24■■□□□ 1.43
CRELD1-208ENST00000467713 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.94■■□□□ 1.42
CRELD1-208ENST00000467713 CUX2O14529 1486 aa23.91■■□□□ 1.42
CRELD1-208ENST00000467713 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.9■■□□□ 1.42
CRELD1-208ENST00000467713 SMARCA4P51532 1647 aa23.89■■□□□ 1.42
CRELD1-208ENST00000467713 SMARCA2P51531 1590 aa23.89■■□□□ 1.41
CRELD1-208ENST00000467713 HMGXB3Q12766 1538 aa23.89■■□□□ 1.41
CRELD1-208ENST00000467713 ERCC6Q03468 1493 aa23.85■■□□□ 1.41
CRELD1-208ENST00000467713 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CRELD1-208ENST00000467713 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.69■■□□□ 1.38
CRELD1-208ENST00000467713 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CRELD1-208ENST00000467713 NESP48681 1621 aa23.62■■□□□ 1.37
CRELD1-208ENST00000467713 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.55■■□□□ 1.36
CRELD1-208ENST00000467713 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CRELD1-208ENST00000467713 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.49■■□□□ 1.35
CRELD1-208ENST00000467713 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.41■■□□□ 1.34
CRELD1-208ENST00000467713 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.37■■□□□ 1.33
CRELD1-208ENST00000467713 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.25■■□□□ 1.31
CRELD1-208ENST00000467713 WIZO95785 1651 aa23.22■■□□□ 1.31
CRELD1-208ENST00000467713 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.18■■□□□ 1.3
CRELD1-208ENST00000467713 WDR62O43379 1518 aa23.16■■□□□ 1.3
CRELD1-208ENST00000467713 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.07■■□□□ 1.28
CRELD1-208ENST00000467713 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23■■□□□ 1.27
CRELD1-208ENST00000467713 CFTRP13569 1480 aa22.98■■□□□ 1.27
CRELD1-208ENST00000467713 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CRELD1-208ENST00000467713 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CRELD1-208ENST00000467713 PRDM2Q13029 1718 aa22.86■■□□□ 1.25
CRELD1-208ENST00000467713 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CRELD1-208ENST00000467713 TRIM41Q8WV44 630 aa22.78■■□□□ 1.24
CRELD1-208ENST00000467713 OSCARQ8IYS5 282 aa22.68■■□□□ 1.22
CRELD1-208ENST00000467713 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.64■■□□□ 1.21
CRELD1-208ENST00000467713 IFT140Q96RY7 1462 aa22.61■■□□□ 1.21
CRELD1-208ENST00000467713 TOPBP1Q92547 1522 aa22.55■■□□□ 1.2
CRELD1-208ENST00000467713 ABCC8Q09428 1581 aa22.54■■□□□ 1.2
CRELD1-208ENST00000467713 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CRELD1-208ENST00000467713 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.5■■□□□ 1.19
CRELD1-208ENST00000467713 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.49■■□□□ 1.19
CRELD1-208ENST00000467713 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.49■■□□□ 1.19
CRELD1-208ENST00000467713 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.49■■□□□ 1.19
CRELD1-208ENST00000467713 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CRELD1-208ENST00000467713 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CRELD1-208ENST00000467713 ARHGEF11O15085 1522 aa22.39■■□□□ 1.17
CRELD1-208ENST00000467713 CHD1O14646 1710 aa22.34■■□□□ 1.17
CRELD1-208ENST00000467713 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CRELD1-208ENST00000467713 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.163e-6■■■■□ 21.2
CRELD1-208ENST00000467713 WDR97A6NE52 1622 aa22.25■■□□□ 1.15
CRELD1-208ENST00000467713 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.17■■□□□ 1.14
CRELD1-208ENST00000467713 SOGA1O94964 1423 aa22.17■■□□□ 1.14
CRELD1-208ENST00000467713 ARAP1Q96P48 1450 aa22.15■■□□□ 1.14
CRELD1-208ENST00000467713 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.14■■□□□ 1.13
CRELD1-208ENST00000467713 FBLN2P98095 1184 aa22.12■■□□□ 1.13
CRELD1-208ENST00000467713 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.12■■□□□ 1.13
CRELD1-208ENST00000467713 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.11■■□□□ 1.13
CRELD1-208ENST00000467713 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CRELD1-208ENST00000467713 CUX1P39880 1505 aa22.11■■□□□ 1.13
CRELD1-208ENST00000467713 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CRELD1-208ENST00000467713 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.08■■□□□ 1.13
CRELD1-208ENST00000467713 SYNJ1O43426 1573 aa22.07■■□□□ 1.12
CRELD1-208ENST00000467713 GRIN2BQ13224 1484 aa22.04■■□□□ 1.12
CRELD1-208ENST00000467713 PBRM1Q86U86 1689 aa22.01■■□□□ 1.11
CRELD1-208ENST00000467713 SYNJ2O15056 1496 aa22■■□□□ 1.11
CRELD1-208ENST00000467713 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CRELD1-208ENST00000467713 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CRELD1-208ENST00000467713 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.93■■□□□ 1.1
CRELD1-208ENST00000467713 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.92■■□□□ 1.1
CRELD1-208ENST00000467713 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.91■■□□□ 1.1
CRELD1-208ENST00000467713 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.78■■□□□ 1.08
CRELD1-208ENST00000467713 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
CRELD1-208ENST00000467713 ADAMTS12P58397 1594 aa21.77■■□□□ 1.08
CRELD1-208ENST00000467713 GRIN2AQ12879 1464 aa21.77■■□□□ 1.07
CRELD1-208ENST00000467713 TOP2BQ02880 1626 aa21.76■■□□□ 1.07
CRELD1-208ENST00000467713 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CRELD1-208ENST00000467713 NUP160Q12769 1436 aa21.7■■□□□ 1.06
CRELD1-208ENST00000467713 CEP170Q5SW79 1584 aa21.7■■□□□ 1.06
CRELD1-208ENST00000467713 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.66■■□□□ 1.06
CRELD1-208ENST00000467713 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.66■■□□□ 1.06
CRELD1-208ENST00000467713 SHROOM2Q13796 1616 aa21.66■■□□□ 1.06
CRELD1-208ENST00000467713 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.65■■□□□ 1.06
CRELD1-208ENST00000467713 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.47■■□□□ 1.03
CRELD1-208ENST00000467713 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CRELD1-208ENST00000467713 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.44■■□□□ 1.02
CRELD1-208ENST00000467713 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms