RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.24■■■■□ 3.23
CCSAP-203ENST00000366687 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.67■■■□□ 2.98
CCSAP-203ENST00000366687 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
CCSAP-203ENST00000366687 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.8■■■□□ 2.84
CCSAP-203ENST00000366687 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.23■■■□□ 2.75
CCSAP-203ENST00000366687 APLP2Q06481 763 aa31.92■■■□□ 2.7
CCSAP-203ENST00000366687 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
CCSAP-203ENST00000366687 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
CCSAP-203ENST00000366687 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.24■■■□□ 2.59
CCSAP-203ENST00000366687 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM41Q8WV44 630 aa31.1■■■□□ 2.57
CCSAP-203ENST00000366687 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CCSAP-203ENST00000366687 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
CCSAP-203ENST00000366687 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
CCSAP-203ENST00000366687 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
CCSAP-203ENST00000366687 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.5
CCSAP-203ENST00000366687 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
CCSAP-203ENST00000366687 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.23■■■□□ 2.43
CCSAP-203ENST00000366687 NEFLP07196 543 aa30.06■■■□□ 2.4
CCSAP-203ENST00000366687 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
CCSAP-203ENST00000366687 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CCSAP-203ENST00000366687 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.75■■■□□ 2.35
CCSAP-203ENST00000366687 ITGAEP38570 1179 aa29.67■■■□□ 2.34
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CCSAP-203ENST00000366687 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.66■■■□□ 2.34
CCSAP-203ENST00000366687 HRCP23327 699 aa29.59■■■□□ 2.33
CCSAP-203ENST00000366687 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.51■■■□□ 2.32
CCSAP-203ENST00000366687 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.38■■■□□ 2.29
CCSAP-203ENST00000366687 MYT1Q01538 1121 aa29.28■■■□□ 2.28
CCSAP-203ENST00000366687 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CCSAP-203ENST00000366687 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CCSAP-203ENST00000366687 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
CCSAP-203ENST00000366687 ABCC9O60706 1549 aa29.01■■■□□ 2.23
CCSAP-203ENST00000366687 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
CCSAP-203ENST00000366687 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CCSAP-203ENST00000366687 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM52Q96A61 297 aa28.8■■■□□ 2.2
CCSAP-203ENST00000366687 NEUROD1Q13562 356 aa28.65■■■□□ 2.18
CCSAP-203ENST00000366687 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.56■■■□□ 2.16
CCSAP-203ENST00000366687 FBLN2P98095 1184 aa28.46■■■□□ 2.15
CCSAP-203ENST00000366687 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.45■■■□□ 2.15
CCSAP-203ENST00000366687 ANP32CO43423 234 aa28.44■■■□□ 2.14
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CCSAP-203ENST00000366687 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CCSAP-203ENST00000366687 P3H3Q8IVL6 736 aa28.26■■■□□ 2.11
CCSAP-203ENST00000366687 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.18■■■□□ 2.1
CCSAP-203ENST00000366687 BCANQ96GW7 911 aa28.16■■■□□ 2.1
CCSAP-203ENST00000366687 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CCSAP-203ENST00000366687 ARID3CA6NKF2 412 aa28.11■■■□□ 2.09
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CCSAP-203ENST00000366687 NEFMP07197 916 aa27.98■■■□□ 2.07
CCSAP-203ENST00000366687 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CCSAP-203ENST00000366687 SCRIBQ14160 1630 aa27.93■■■□□ 2.06
CCSAP-203ENST00000366687 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.04
CCSAP-203ENST00000366687 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CCSAP-203ENST00000366687 TONSLQ96HA7 1378 aa27.81■■■□□ 2.04
CCSAP-203ENST00000366687 SLC24A1O60721 1099 aa27.79■■■□□ 2.04
CCSAP-203ENST00000366687 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.67■■■□□ 2.02
CCSAP-203ENST00000366687 BCL11AQ9H165 835 aa27.66■■■□□ 2.02
CCSAP-203ENST00000366687 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
CCSAP-203ENST00000366687 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
CCSAP-203ENST00000366687 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
CCSAP-203ENST00000366687 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CCSAP-203ENST00000366687 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.56■■■□□ 2
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 2
CCSAP-203ENST00000366687 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.51■■□□□ 1.99
CCSAP-203ENST00000366687 TSPY4P0CV99 314 aa27.49■■□□□ 1.99
CCSAP-203ENST00000366687 TSPY10P0CW01 314 aa27.49■■□□□ 1.99
CCSAP-203ENST00000366687 FKBP8Q14318 412 aa27.47■■□□□ 1.99
CCSAP-203ENST00000366687 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.45■■□□□ 1.98
CCSAP-203ENST00000366687 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.45■■□□□ 1.98
CCSAP-203ENST00000366687 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.4■■□□□ 1.98
CCSAP-203ENST00000366687 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CCSAP-203ENST00000366687 TMC1Q8TDI8 760 aa27.39■■□□□ 1.97
CCSAP-203ENST00000366687 CLIP1P30622 1438 aa27.36■■□□□ 1.97
CCSAP-203ENST00000366687 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CCSAP-203ENST00000366687 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
CCSAP-203ENST00000366687 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.26■■□□□ 1.96
CCSAP-203ENST00000366687 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.25■■□□□ 1.95
CCSAP-203ENST00000366687 EEA1Q15075 1411 aa27.25■■□□□ 1.95
CCSAP-203ENST00000366687 MRS2Q9HD23 443 aa27.25■■□□□ 1.95
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CCSAP-203ENST00000366687 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CCSAP-203ENST00000366687 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.2■■□□□ 1.94
CCSAP-203ENST00000366687 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.18■■□□□ 1.94
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.945e-7■□□□□ 10.7
CCSAP-203ENST00000366687 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CCSAP-203ENST00000366687 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CCSAP-203ENST00000366687 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.12■■□□□ 1.93
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA3Q08378 1498 aa27.1■■□□□ 1.93
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.09■■□□□ 1.93
CCSAP-203ENST00000366687 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.09■■□□□ 1.93
CCSAP-203ENST00000366687 MIER1Q8N108 512 aa27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms