Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 AKR7A2-204ENST00000489286 725 ntTSL 518.12■□□□□ 0.499e-11■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 SYNJ2-209ENST00000640569 2040 nt16.77■□□□□ 0.272e-20■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 AKR7A2-202ENST00000330072 1171 ntTSL 216.72■□□□□ 0.279e-11■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 AKR7A2-203ENST00000481966 488 ntTSL 311.1□□□□□ -0.639e-11■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 HNRNPH1-239ENST00000521173 831 ntTSL 59.92□□□□□ -0.825e-15■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 COL18A1-205ENST00000423214 839 ntTSL 514.81□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 38.7
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SF3B4Q15427 NKTR-209ENST00000465584 3839 ntTSL 22.09□□□□□ -2.089e-13■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 PTPN18-213ENST00000489215 460 ntTSL 421.97■■□□□ 1.112e-8■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 PTPN18-205ENST00000428843 785 ntTSL 320.08■□□□□ 0.812e-8■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 PTPN18-216ENST00000495400 552 ntTSL 413.52□□□□□ -0.251e-8■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 FAM193B-203ENST00000505241 440 ntTSL 311.94□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 PTPN18-212ENST00000483617 595 ntTSL 310.14□□□□□ -0.792e-8■■■■■ 38.7
SF3B4Q15427 SGSM3-205ENST00000462457 881 ntTSL 513.78□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 38.6
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SF3B4Q15427 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.724e-8■■■■■ 38.6
SF3B4Q15427 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.224e-8■■■■■ 38.6
SF3B4Q15427 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.144e-8■■■■■ 38.6
SF3B4Q15427 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.164e-8■■■■■ 38.6
SF3B4Q15427 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.671e-11■■■■■ 38.6
SF3B4Q15427 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.641e-11■■■■■ 38.6
SF3B4Q15427 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.511e-11■■■■■ 38.6
SF3B4Q15427 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.581e-11■■■■■ 38.6
SF3B4Q15427 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.161e-11■■■■■ 38.6
SF3B4Q15427 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.761e-11■■■■■ 38.6
SF3B4Q15427 SUZ12P1-201ENST00000497969 886 ntTSL 1 (best)22.58■■□□□ 1.214e-15■■■■■ 38.6
SF3B4Q15427 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.134e-8■■■■■ 38.6
SF3B4Q15427 ATAD3B-205ENST00000485748 3233 ntTSL 214.4□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 38.6
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SF3B4Q15427 ATAD3B-203ENST00000472194 4314 ntTSL 1 (best)11.66□□□□□ -0.544e-8■■■■■ 38.6
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SF3B4Q15427 ABCD4-219ENST00000553745 1770 ntTSL 212.37□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 38.6
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SF3B4Q15427 ABCD4-201ENST00000356924 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.713e-7■■■■■ 38.6
SF3B4Q15427 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.137e-8■■■■■ 38.6
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SF3B4Q15427 STXBP2-218ENST00000599905 589 ntTSL 418.57■□□□□ 0.567e-11■■■■■ 38.5
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SF3B4Q15427 STAU1-202ENST00000347458 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.64e-10■■■■■ 38.5
SF3B4Q15427 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.684e-10■■■■■ 38.5
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SF3B4Q15427 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.84e-10■■■■■ 38.5
SF3B4Q15427 STAU1-207ENST00000371856 3684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.824e-10■■■■■ 38.5
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SF3B4Q15427 STAU1-205ENST00000371802 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.864e-10■■■■■ 38.5
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SF3B4Q15427 PITRM1-208ENST00000455371 673 ntTSL 26.76□□□□□ -1.334e-6■■■■■ 38.5
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SF3B4Q15427 MTHFR-215ENST00000641759 2454 nt12.09□□□□□ -0.478e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.528e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 MTHFR-214ENST00000641747 3227 nt11.75□□□□□ -0.538e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.558e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.638e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.658e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.074e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 HOXB3-213ENST00000552000 466 ntTSL 34.9□□□□□ -1.634e-8■■■■■ 38.4
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SF3B4Q15427 SLC26A6-209ENST00000426599 555 ntTSL 413.04□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 SLC26A6-218ENST00000482282 1029 ntTSL 512.84□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.537e-7■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 KAT2A-202ENST00000465682 2990 ntTSL 511.34□□□□□ -0.597e-7■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.64■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.9■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-226ENST00000641756 2132 nt15.86■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-227ENST00000641811 1031 nt15.63■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-230ENST00000641927 1678 nt15.58■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-214ENST00000641314 1558 nt15.54■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-211ENST00000641213 2053 nt15.41■□□□□ 0.062e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-229ENST00000641891 2175 nt15.32■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-232ENST00000641947 1774 nt15.26■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-216ENST00000641375 2196 nt14.71□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-233ENST00000642021 2794 nt13.23□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 PHGDH-201ENST00000369407 3180 ntTSL 212.22□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.747e-7■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.817e-7■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.887e-7■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.897e-7■■■■■ 38.4
SF3B4Q15427 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 38.4
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