RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239151.5

HOXB5-201, Transcript of homeobox B5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB5, Length 2,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5-201ENST00000239151 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.73■■■■□ 3.79
HOXB5-201ENST00000239151 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.05■■■■□ 3.04
HOXB5-201ENST00000239151 ABCC9O60706 1549 aa33.01■■■□□ 2.87
HOXB5-201ENST00000239151 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXB5-201ENST00000239151 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
HOXB5-201ENST00000239151 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.96■■■□□ 2.71
HOXB5-201ENST00000239151 NACADO15069 1562 aa31.93■■■□□ 2.7
HOXB5-201ENST00000239151 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.86■■■□□ 2.69
HOXB5-201ENST00000239151 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.84■■■□□ 2.69
HOXB5-201ENST00000239151 SCRIBQ14160 1630 aa31.29■■■□□ 2.6
HOXB5-201ENST00000239151 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.2■■■□□ 2.58
HOXB5-201ENST00000239151 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXB5-201ENST00000239151 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.03■■■□□ 2.56
HOXB5-201ENST00000239151 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXB5-201ENST00000239151 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXB5-201ENST00000239151 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
HOXB5-201ENST00000239151 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
HOXB5-201ENST00000239151 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB5-201ENST00000239151 SMARCA4P51532 1647 aa29.92■■■□□ 2.38
HOXB5-201ENST00000239151 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.89■■■□□ 2.38
HOXB5-201ENST00000239151 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXB5-201ENST00000239151 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
HOXB5-201ENST00000239151 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXB5-201ENST00000239151 WIZO95785 1651 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXB5-201ENST00000239151 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
HOXB5-201ENST00000239151 SMARCA2P51531 1590 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXB5-201ENST00000239151 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXB5-201ENST00000239151 NCAPD3P42695 1498 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXB5-201ENST00000239151 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
HOXB5-201ENST00000239151 HMGXB3Q12766 1538 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXB5-201ENST00000239151 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
HOXB5-201ENST00000239151 CCDC88BA6NC98 1476 aa29■■■□□ 2.23
HOXB5-201ENST00000239151 NESP48681 1621 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXB5-201ENST00000239151 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXB5-201ENST00000239151 CFTRP13569 1480 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXB5-201ENST00000239151 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXB5-201ENST00000239151 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXB5-201ENST00000239151 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXB5-201ENST00000239151 PRDM2Q13029 1718 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXB5-201ENST00000239151 ERCC6Q03468 1493 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXB5-201ENST00000239151 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXB5-201ENST00000239151 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXB5-201ENST00000239151 ABCC8Q09428 1581 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXB5-201ENST00000239151 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB5-201ENST00000239151 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXB5-201ENST00000239151 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXB5-201ENST00000239151 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.04■■■□□ 2.08
HOXB5-201ENST00000239151 CUX1P39880 1505 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXB5-201ENST00000239151 TOPBP1Q92547 1522 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXB5-201ENST00000239151 WDR62O43379 1518 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB5-201ENST00000239151 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB5-201ENST00000239151 SYNJ1O43426 1573 aa27.95■■■□□ 2.07
HOXB5-201ENST00000239151 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.91■■■□□ 2.06
HOXB5-201ENST00000239151 TOP2BQ02880 1626 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXB5-201ENST00000239151 TRIM41Q8WV44 630 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXB5-201ENST00000239151 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.83■■■□□ 2.05
HOXB5-201ENST00000239151 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXB5-201ENST00000239151 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
HOXB5-201ENST00000239151 CUX2O14529 1486 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB5-201ENST00000239151 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXB5-201ENST00000239151 SOGA1O94964 1423 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXB5-201ENST00000239151 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
HOXB5-201ENST00000239151 IFT140Q96RY7 1462 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXB5-201ENST00000239151 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
HOXB5-201ENST00000239151 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
HOXB5-201ENST00000239151 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.54■■■□□ 2
HOXB5-201ENST00000239151 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
HOXB5-201ENST00000239151 WDR97A6NE52 1622 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXB5-201ENST00000239151 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.45■■□□□ 1.99
HOXB5-201ENST00000239151 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
HOXB5-201ENST00000239151 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.39■■□□□ 1.97
HOXB5-201ENST00000239151 KIF27Q86VH2 1401 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXB5-201ENST00000239151 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
HOXB5-201ENST00000239151 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXB5-201ENST00000239151 GRIN2BQ13224 1484 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXB5-201ENST00000239151 IGF1RP08069 1367 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXB5-201ENST00000239151 PBRM1Q86U86 1689 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXB5-201ENST00000239151 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXB5-201ENST00000239151 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXB5-201ENST00000239151 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXB5-201ENST00000239151 EEA1Q15075 1411 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXB5-201ENST00000239151 FBLN2P98095 1184 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXB5-201ENST00000239151 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
HOXB5-201ENST00000239151 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXB5-201ENST00000239151 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXB5-201ENST00000239151 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXB5-201ENST00000239151 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB5-201ENST00000239151 ADAMTS12P58397 1594 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXB5-201ENST00000239151 SYNJ2O15056 1496 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXB5-201ENST00000239151 CUL7Q14999 1698 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXB5-201ENST00000239151 PRXQ9BXM0 1461 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXB5-201ENST00000239151 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB5-201ENST00000239151 CHD1O14646 1710 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXB5-201ENST00000239151 GRIN2AQ12879 1464 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXB5-201ENST00000239151 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXB5-201ENST00000239151 KIF21BO75037 1637 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXB5-201ENST00000239151 OSCARQ8IYS5 282 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXB5-201ENST00000239151 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
HOXB5-201ENST00000239151 CEP170Q5SW79 1584 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB5-201ENST00000239151 GOLGA3Q08378 1498 aa26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms