RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489215.5

PTPN18-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN18, Length 460 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18-213ENST00000489215 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.59■■■■■ 6.97
PTPN18-213ENST00000489215 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.28■■■■■ 5.96
PTPN18-213ENST00000489215 ABCC9O60706 1549 aa51.32■■■■■ 5.81
PTPN18-213ENST00000489215 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.37■■■■■ 5.49
PTPN18-213ENST00000489215 NACADO15069 1562 aa49.25■■■■■ 5.47
PTPN18-213ENST00000489215 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.11■■■■■ 5.45
PTPN18-213ENST00000489215 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.89■■■■■ 5.42
PTPN18-213ENST00000489215 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.72■■■■■ 5.39
PTPN18-213ENST00000489215 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.54■■■■■ 5.36
PTPN18-213ENST00000489215 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.12■■■■■ 5.29
PTPN18-213ENST00000489215 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.9■■■■■ 5.26
PTPN18-213ENST00000489215 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.75■■■■■ 5.23
PTPN18-213ENST00000489215 SCRIBQ14160 1630 aa47.54■■■■■ 5.2
PTPN18-213ENST00000489215 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.42■■■■■ 5.18
PTPN18-213ENST00000489215 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.31■■■■■ 5.16
PTPN18-213ENST00000489215 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
PTPN18-213ENST00000489215 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.44■■■■■ 5.03
PTPN18-213ENST00000489215 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.2■■■■■ 4.99
PTPN18-213ENST00000489215 SMARCA4P51532 1647 aa45.51■■■■■ 4.88
PTPN18-213ENST00000489215 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.49■■■■■ 4.87
PTPN18-213ENST00000489215 NCAPD3P42695 1498 aa45.42■■■■■ 4.86
PTPN18-213ENST00000489215 SMARCA2P51531 1590 aa45.36■■■■■ 4.85
PTPN18-213ENST00000489215 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.35■■■■■ 4.85
PTPN18-213ENST00000489215 HMGXB3Q12766 1538 aa45.16■■■■■ 4.82
PTPN18-213ENST00000489215 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.11■■■■■ 4.81
PTPN18-213ENST00000489215 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.08■■■■■ 4.81
PTPN18-213ENST00000489215 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
PTPN18-213ENST00000489215 WIZO95785 1651 aa44.59■■■■■ 4.73
PTPN18-213ENST00000489215 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
PTPN18-213ENST00000489215 ERCC6Q03468 1493 aa44.35■■■■■ 4.69
PTPN18-213ENST00000489215 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.29■■■■■ 4.68
PTPN18-213ENST00000489215 NESP48681 1621 aa44.28■■■■■ 4.68
PTPN18-213ENST00000489215 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
PTPN18-213ENST00000489215 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.08■■■■■ 4.65
PTPN18-213ENST00000489215 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.04■■■■■ 4.64
PTPN18-213ENST00000489215 CUX2O14529 1486 aa44.02■■■■■ 4.64
PTPN18-213ENST00000489215 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.79■■■■■ 4.6
PTPN18-213ENST00000489215 CFTRP13569 1480 aa43.74■■■■■ 4.59
PTPN18-213ENST00000489215 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
PTPN18-213ENST00000489215 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.62■■■■■ 4.57
PTPN18-213ENST00000489215 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.54■■■■■ 4.56
PTPN18-213ENST00000489215 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.54■■■■■ 4.56
PTPN18-213ENST00000489215 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.52■■■■■ 4.56
PTPN18-213ENST00000489215 PRDM2Q13029 1718 aa43.4■■■■■ 4.54
PTPN18-213ENST00000489215 WDR62O43379 1518 aa43.37■■■■■ 4.53
PTPN18-213ENST00000489215 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
PTPN18-213ENST00000489215 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
PTPN18-213ENST00000489215 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.01■■■■■ 4.48
PTPN18-213ENST00000489215 ABCC8Q09428 1581 aa42.94■■■■■ 4.46
PTPN18-213ENST00000489215 TOPBP1Q92547 1522 aa42.79■■■■■ 4.44
PTPN18-213ENST00000489215 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.74■■■■■ 4.43
PTPN18-213ENST00000489215 IFT140Q96RY7 1462 aa42.66■■■■■ 4.42
PTPN18-213ENST00000489215 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
PTPN18-213ENST00000489215 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
PTPN18-213ENST00000489215 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
PTPN18-213ENST00000489215 CUX1P39880 1505 aa42.31■■■■■ 4.36
PTPN18-213ENST00000489215 SOGA1O94964 1423 aa42.29■■■■■ 4.36
PTPN18-213ENST00000489215 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.25■■■■■ 4.35
PTPN18-213ENST00000489215 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
PTPN18-213ENST00000489215 OSCARQ8IYS5 282 aa42.2■■■■■ 4.35
PTPN18-213ENST00000489215 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.17■■■■■ 4.34
PTPN18-213ENST00000489215 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.13■■■■■ 4.342e-12■■■■■ 52
PTPN18-213ENST00000489215 WDR97A6NE52 1622 aa42.13■■■■■ 4.33
PTPN18-213ENST00000489215 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.02■■■■■ 4.32
PTPN18-213ENST00000489215 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
PTPN18-213ENST00000489215 TOP2BQ02880 1626 aa41.95■■■■■ 4.31
PTPN18-213ENST00000489215 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.93■■■■■ 4.3
PTPN18-213ENST00000489215 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.87■■■■■ 4.29
PTPN18-213ENST00000489215 GRIN2BQ13224 1484 aa41.83■■■■■ 4.29
PTPN18-213ENST00000489215 SYNJ1O43426 1573 aa41.82■■■■■ 4.29
PTPN18-213ENST00000489215 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.79■■■■■ 4.28
PTPN18-213ENST00000489215 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
PTPN18-213ENST00000489215 FBLN2P98095 1184 aa41.76■■■■■ 4.28
PTPN18-213ENST00000489215 CHD1O14646 1710 aa41.75■■■■■ 4.27
PTPN18-213ENST00000489215 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.73■■■■■ 4.27
PTPN18-213ENST00000489215 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.69■■■■■ 4.26
PTPN18-213ENST00000489215 PBRM1Q86U86 1689 aa41.67■■■■■ 4.26
PTPN18-213ENST00000489215 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
PTPN18-213ENST00000489215 SYNJ2O15056 1496 aa41.59■■■■■ 4.25
PTPN18-213ENST00000489215 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.4■■■■■ 4.22
PTPN18-213ENST00000489215 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.4■■■■■ 4.22
PTPN18-213ENST00000489215 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.4■■■■■ 4.22
PTPN18-213ENST00000489215 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.4■■■■■ 4.22
PTPN18-213ENST00000489215 TRIM41Q8WV44 630 aa41.4■■■■■ 4.22
PTPN18-213ENST00000489215 ARHGEF11O15085 1522 aa41.39■■■■■ 4.22
PTPN18-213ENST00000489215 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.31■■■■■ 4.2
PTPN18-213ENST00000489215 ADAMTS12P58397 1594 aa41.29■■■■■ 4.2
PTPN18-213ENST00000489215 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.29■■■■■ 4.2
PTPN18-213ENST00000489215 GRIN2AQ12879 1464 aa41.26■■■■■ 4.2
PTPN18-213ENST00000489215 KIF27Q86VH2 1401 aa41.21■■■■■ 4.19
PTPN18-213ENST00000489215 NUP160Q12769 1436 aa41.08■■■■■ 4.17
PTPN18-213ENST00000489215 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.07■■■■■ 4.17
PTPN18-213ENST00000489215 IGF1RP08069 1367 aa41.02■■■■■ 4.16
PTPN18-213ENST00000489215 CEP170Q5SW79 1584 aa40.99■■■■■ 4.15
PTPN18-213ENST00000489215 ARAP1Q96P48 1450 aa40.98■■■■■ 4.15
PTPN18-213ENST00000489215 CUL7Q14999 1698 aa40.98■■■■■ 4.15
PTPN18-213ENST00000489215 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.81■■■■■ 4.12
PTPN18-213ENST00000489215 SHROOM2Q13796 1616 aa40.8■■■■■ 4.12
PTPN18-213ENST00000489215 JPH4Q96JJ6 628 aa40.73■■■■■ 4.11
PTPN18-213ENST00000489215 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.69■■■■■ 4.1
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