Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 MAP1S-210ENST00000597000 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.24■□□□□ 0.193e-9■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 GTPBP1-202ENST00000418601 810 ntTSL 226.28■■□□□ 1.82e-7■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.092e-7■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 GTPBP1-209ENST00000484657 585 ntTSL 414.72□□□□□ -0.052e-7■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 CDYL-207ENST00000472453 1764 ntTSL 1 (best)28.71■■■□□ 2.192e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 CDYL-201ENST00000328908 3419 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.573e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.193e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.983e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.843e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.743e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.723e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.393e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-212ENST00000564725 4620 ntTSL 1 (best)16.36■□□□□ 0.213e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.13e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.123e-6■■■■□ 24.1
FMR1Q06787 GCN1-202ENST00000547263 366 ntTSL 313.53□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 24
FMR1Q06787 ALDOA-211ENST00000564521 2534 ntTSL 515.15■□□□□ 0.022e-23■■■■□ 24
FMR1Q06787 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.512e-7■■■■□ 24
FMR1Q06787 LTBP4-235ENST00000617753 580 ntTSL 421.36■■□□□ 1.013e-12■■■■□ 24
FMR1Q06787 DOCK8-208ENST00000469197 741 ntTSL 59.36□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 24
FMR1Q06787 NUP214-204ENST00000453861 3208 ntTSL 511.49□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.943e-6■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 ANKRD17-206ENST00000514252 3259 ntTSL 25.73□□□□□ -1.491e-6■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 TRANK1-201ENST00000429976 10481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.295e-8■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 SUPT5H-203ENST00000402194 3698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.315e-8■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 SUPT5H-216ENST00000599335 3796 ntTSL 212.73□□□□□ -0.375e-8■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 SUPT5H-204ENST00000432763 3710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.395e-8■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 SUPT5H-215ENST00000599117 3902 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.45e-8■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 SUPT5H-213ENST00000598725 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.465e-8■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 HTT-208ENST00000510626 14438 ntTSL 1 (best)8.65□□□□□ -1.033e-6■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 DIAPH1-214ENST00000524301 561 ntTSL 46.62□□□□□ -1.358e-7■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 CDK5RAP2-212ENST00000480112 5826 ntTSL 1 (best)13.47□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 CDK5RAP2-204ENST00000416449 3902 ntTSL 59.37□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 CDK5RAP2-209ENST00000473282 5956 ntTSL 1 (best)8.18□□□□□ -1.12e-6■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.223e-7■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 UBTF-211ENST00000530828 721 ntTSL 515.01□□□□□ -0.017e-8■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.535e-7■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.145e-7■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.345e-7■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.225e-7■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.045e-7■■■■□ 23.9
FMR1Q06787 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 C11orf80-209ENST00000527368 812 ntTSL 530.81■■■□□ 2.523e-6■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.173e-6■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.153e-6■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.083e-6■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 C11orf80-202ENST00000524551 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 525.47■■□□□ 1.673e-6■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 C11orf80-217ENST00000534325 583 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.29■■□□□ 1.483e-6■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.023e-6■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 C11orf80-211ENST00000531400 367 ntTSL 316.58■□□□□ 0.243e-6■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.99e-7■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.119e-7■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.049e-7■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.931e-6■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.841e-6■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 AC087633.2-204ENST00000621842 496 ntTSL 511.71□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 AC087633.2-205ENST00000615751 500 ntTSL 57.4□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 TTC3-217ENST00000481605 1540 ntTSL 530.03■■■□□ 2.42e-10■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.042e-10■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 TTC3-210ENST00000450533 2451 ntTSL 1 (best)25.4■■□□□ 1.662e-10■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 TTC3-209ENST00000438055 3606 ntTSL 519.1■□□□□ 0.652e-10■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 TTC3-207ENST00000418766 3771 ntTSL 518.57■□□□□ 0.562e-10■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 TTC3-219ENST00000485402 3626 ntTSL 516.88■□□□□ 0.292e-10■■■■□ 23.8
FMR1Q06787 DPF2-208ENST00000531989 1573 ntTSL 319.91■□□□□ 0.788e-7■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 DPF2-209ENST00000532052 3165 ntTSL 210.71□□□□□ -0.698e-7■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-217ENST00000448502 561 ntTSL 426.46■■□□□ 1.833e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-215ENST00000441728 1242 ntTSL 226.04■■□□□ 1.763e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-212ENST00000439338 873 ntTSL 525.63■■□□□ 1.693e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-206ENST00000416292 552 ntTSL 225.63■■□□□ 1.693e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-207ENST00000417231 984 ntTSL 525.35■■□□□ 1.653e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-209ENST00000433568 574 ntTSL 424.73■■□□□ 1.553e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.553e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.263e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-218ENST00000454786 1292 ntTSL 522.45■■□□□ 1.183e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.163e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.063e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-216ENST00000445676 831 ntTSL 319.83■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-219ENST00000455999 760 ntTSL 519.71■□□□□ 0.753e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-214ENST00000440223 830 ntTSL 319.35■□□□□ 0.693e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-SCLY-202ENST00000449891 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.2■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-213ENST00000439780 571 ntTSL 512.92□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-SCLY-201ENST00000449191 951 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.363e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-208ENST00000433241 803 ntTSL 212.59□□□□□ -0.393e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-211ENST00000434655 648 ntTSL 511.53□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.763e-6■■■■□ 23.7
FMR1Q06787 GRB2-207ENST00000577711 555 ntTSL 225.81■■□□□ 1.724e-11■■■■□ 23.7
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 71.1 ms