RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540737.5

C11orf80-218, Transcript of chromosome 11 open reading frame 80, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene C11orf80, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf80-218ENST00000540737 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.7■■■■■ 6.67
C11orf80-218ENST00000540737 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.33■■■■■ 5.49
C11orf80-218ENST00000540737 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
C11orf80-218ENST00000540737 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.04■■■■■ 5.12
C11orf80-218ENST00000540737 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.43■■■■■ 5.02
C11orf80-218ENST00000540737 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.39■■■■■ 5.02
C11orf80-218ENST00000540737 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.22■■■■■ 4.99
C11orf80-218ENST00000540737 ABCC9O60706 1549 aa46.11■■■■■ 4.97
C11orf80-218ENST00000540737 NACADO15069 1562 aa45.87■■■■■ 4.93
C11orf80-218ENST00000540737 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.34■■■■■ 4.85
C11orf80-218ENST00000540737 SCRIBQ14160 1630 aa45.22■■■■■ 4.83
C11orf80-218ENST00000540737 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.69■■■■■ 4.75
C11orf80-218ENST00000540737 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.31■■■■■ 4.68
C11orf80-218ENST00000540737 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
C11orf80-218ENST00000540737 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.93■■■■■ 4.62
C11orf80-218ENST00000540737 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.93■■■■■ 4.62
C11orf80-218ENST00000540737 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.77■■■■■ 4.6
C11orf80-218ENST00000540737 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.75■■■■■ 4.59
C11orf80-218ENST00000540737 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.52■■■■■ 4.561e-5■□□□□ 8.6
C11orf80-218ENST00000540737 SMARCA4P51532 1647 aa43.48■■■■■ 4.55
C11orf80-218ENST00000540737 WIZO95785 1651 aa43.36■■■■■ 4.53
C11orf80-218ENST00000540737 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.12■■■■■ 4.49
C11orf80-218ENST00000540737 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
C11orf80-218ENST00000540737 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.05■■■■■ 4.48
C11orf80-218ENST00000540737 SMARCA2P51531 1590 aa42.73■■■■■ 4.43
C11orf80-218ENST00000540737 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.71■■■■■ 4.43
C11orf80-218ENST00000540737 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.4
C11orf80-218ENST00000540737 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.56■■■■■ 4.4
C11orf80-218ENST00000540737 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
C11orf80-218ENST00000540737 NCAPD3P42695 1498 aa42.34■■■■■ 4.37
C11orf80-218ENST00000540737 HMGXB3Q12766 1538 aa42.31■■■■■ 4.36
C11orf80-218ENST00000540737 TRIM41Q8WV44 630 aa42.12■■■■■ 4.33
C11orf80-218ENST00000540737 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.05■■■■■ 4.32
C11orf80-218ENST00000540737 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.81■■■■■ 4.28
C11orf80-218ENST00000540737 ABCC8Q09428 1581 aa41.67■■■■■ 4.26
C11orf80-218ENST00000540737 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.49■■■■■ 4.23
C11orf80-218ENST00000540737 CFTRP13569 1480 aa41.47■■■■■ 4.23
C11orf80-218ENST00000540737 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.35■■■■■ 4.21
C11orf80-218ENST00000540737 SYNJ1O43426 1573 aa41.25■■■■■ 4.19
C11orf80-218ENST00000540737 PRDM2Q13029 1718 aa41.24■■■■■ 4.19
C11orf80-218ENST00000540737 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.24■■■■■ 4.19
C11orf80-218ENST00000540737 EEA1Q15075 1411 aa41.23■■■■■ 4.19
C11orf80-218ENST00000540737 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
C11orf80-218ENST00000540737 TOP2BQ02880 1626 aa41.14■■■■■ 4.18
C11orf80-218ENST00000540737 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.1■■■■■ 4.17
C11orf80-218ENST00000540737 SOGA1O94964 1423 aa41.01■■■■■ 4.16
C11orf80-218ENST00000540737 CUX1P39880 1505 aa40.9■■■■■ 4.14
C11orf80-218ENST00000540737 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.83■■■■■ 4.13
C11orf80-218ENST00000540737 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.81■■■■■ 4.12
C11orf80-218ENST00000540737 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.8■■■■■ 4.12
C11orf80-218ENST00000540737 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.73■■■■■ 4.11
C11orf80-218ENST00000540737 NESP48681 1621 aa40.59■■■■■ 4.09
C11orf80-218ENST00000540737 KIF21BO75037 1637 aa40.58■■■■■ 4.09
C11orf80-218ENST00000540737 GOLGA3Q08378 1498 aa40.56■■■■■ 4.08
C11orf80-218ENST00000540737 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.55■■■■■ 4.08
C11orf80-218ENST00000540737 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.54■■■■■ 4.08
C11orf80-218ENST00000540737 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.48■■■■■ 4.07
C11orf80-218ENST00000540737 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.47■■■■■ 4.07
C11orf80-218ENST00000540737 KIF27Q86VH2 1401 aa40.45■■■■■ 4.07
C11orf80-218ENST00000540737 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.43■■■■■ 4.06
C11orf80-218ENST00000540737 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.38■■■■■ 4.06
C11orf80-218ENST00000540737 TOPBP1Q92547 1522 aa40.34■■■■■ 4.05
C11orf80-218ENST00000540737 PRXQ9BXM0 1461 aa40.29■■■■■ 4.04
C11orf80-218ENST00000540737 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.29■■■■■ 4.04
C11orf80-218ENST00000540737 CEP162Q5TB80 1403 aa40.26■■■■■ 4.04
C11orf80-218ENST00000540737 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
C11orf80-218ENST00000540737 CUX2O14529 1486 aa40.19■■■■■ 4.02
C11orf80-218ENST00000540737 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
C11orf80-218ENST00000540737 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.18■■■■■ 4.02
C11orf80-218ENST00000540737 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
C11orf80-218ENST00000540737 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.13■■■■■ 4.01
C11orf80-218ENST00000540737 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.12■■■■■ 4.01
C11orf80-218ENST00000540737 IGF1RP08069 1367 aa40.04■■■■■ 4
C11orf80-218ENST00000540737 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.96■■■■□ 3.99
C11orf80-218ENST00000540737 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
C11orf80-218ENST00000540737 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.91■■■■□ 3.98
C11orf80-218ENST00000540737 WDR97A6NE52 1622 aa39.91■■■■□ 3.98
C11orf80-218ENST00000540737 CLIP1P30622 1438 aa39.88■■■■□ 3.97
C11orf80-218ENST00000540737 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.83■■■■□ 3.97
C11orf80-218ENST00000540737 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.83■■■■□ 3.97
C11orf80-218ENST00000540737 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.73■■■■□ 3.95
C11orf80-218ENST00000540737 CUL7Q14999 1698 aa39.72■■■■□ 3.95
C11orf80-218ENST00000540737 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
C11orf80-218ENST00000540737 WDR62O43379 1518 aa39.71■■■■□ 3.95
C11orf80-218ENST00000540737 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.63■■■■□ 3.93
C11orf80-218ENST00000540737 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.61■■■■□ 3.93
C11orf80-218ENST00000540737 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
C11orf80-218ENST00000540737 ERCC6Q03468 1493 aa39.53■■■■□ 3.92
C11orf80-218ENST00000540737 IFT140Q96RY7 1462 aa39.51■■■■□ 3.92
C11orf80-218ENST00000540737 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
C11orf80-218ENST00000540737 ARAP1Q96P48 1450 aa39.45■■■■□ 3.91
C11orf80-218ENST00000540737 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.38■■■■□ 3.9
C11orf80-218ENST00000540737 PBRM1Q86U86 1689 aa39.31■■■■□ 3.88
C11orf80-218ENST00000540737 GRIN2BQ13224 1484 aa39.29■■■■□ 3.88
C11orf80-218ENST00000540737 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.27■■■■□ 3.88
C11orf80-218ENST00000540737 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.25■■■■□ 3.87
C11orf80-218ENST00000540737 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.24■■■■□ 3.87
C11orf80-218ENST00000540737 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
C11orf80-218ENST00000540737 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.23■■■■□ 3.87
C11orf80-218ENST00000540737 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.19■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.1 ms