RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418601.1

GTPBP1-202, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 810 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-202ENST00000418601 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.73■■■■■ 5.55
GTPBP1-202ENST00000418601 ABCC9O60706 1549 aa46.19■■■■■ 4.99
GTPBP1-202ENST00000418601 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.2■■■■■ 4.83
GTPBP1-202ENST00000418601 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.15■■■■■ 4.66
GTPBP1-202ENST00000418601 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.5■■■■■ 4.55
GTPBP1-202ENST00000418601 NACADO15069 1562 aa42.9■■■■■ 4.46
GTPBP1-202ENST00000418601 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.74■■■■■ 4.43
GTPBP1-202ENST00000418601 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.57■■■■■ 4.41
GTPBP1-202ENST00000418601 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.35■■■■■ 4.37
GTPBP1-202ENST00000418601 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.27■■■■■ 4.36
GTPBP1-202ENST00000418601 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.92■■■■■ 4.3
GTPBP1-202ENST00000418601 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.71■■■■■ 4.27
GTPBP1-202ENST00000418601 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.69■■■■■ 4.26
GTPBP1-202ENST00000418601 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.6■■■■■ 4.25
GTPBP1-202ENST00000418601 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
GTPBP1-202ENST00000418601 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.32■■■■■ 4.21
GTPBP1-202ENST00000418601 SCRIBQ14160 1630 aa41.13■■■■■ 4.17
GTPBP1-202ENST00000418601 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
GTPBP1-202ENST00000418601 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41■■■■■ 4.15
GTPBP1-202ENST00000418601 CUX2O14529 1486 aa40.25■■■■■ 4.03
GTPBP1-202ENST00000418601 ERCC6Q03468 1493 aa39.98■■■■□ 3.99
GTPBP1-202ENST00000418601 NCAPD3P42695 1498 aa39.56■■■■□ 3.92
GTPBP1-202ENST00000418601 NESP48681 1621 aa39.37■■■■□ 3.89
GTPBP1-202ENST00000418601 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.32■■■■□ 3.89
GTPBP1-202ENST00000418601 HMGXB3Q12766 1538 aa39.27■■■■□ 3.88
GTPBP1-202ENST00000418601 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
GTPBP1-202ENST00000418601 SMARCA2P51531 1590 aa39.21■■■■□ 3.87
GTPBP1-202ENST00000418601 TRIM41Q8WV44 630 aa39.15■■■■□ 3.86
GTPBP1-202ENST00000418601 SMARCA4P51532 1647 aa39.09■■■■□ 3.85
GTPBP1-202ENST00000418601 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.94■■■■□ 3.82
GTPBP1-202ENST00000418601 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.93■■■■□ 3.82
GTPBP1-202ENST00000418601 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.9■■■■□ 3.82
GTPBP1-202ENST00000418601 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
GTPBP1-202ENST00000418601 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.68■■■■□ 3.78
GTPBP1-202ENST00000418601 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.67■■■■□ 3.78
GTPBP1-202ENST00000418601 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.47■■■■□ 3.75
GTPBP1-202ENST00000418601 WDR62O43379 1518 aa38.43■■■■□ 3.74
GTPBP1-202ENST00000418601 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.33■■■■□ 3.73
GTPBP1-202ENST00000418601 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.31■■■■□ 3.72
GTPBP1-202ENST00000418601 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.12■■■■□ 3.69
GTPBP1-202ENST00000418601 OSCARQ8IYS5 282 aa38.1■■■■□ 3.69
GTPBP1-202ENST00000418601 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.94■■■■□ 3.66
GTPBP1-202ENST00000418601 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.91■■■■□ 3.66
GTPBP1-202ENST00000418601 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.91■■■■□ 3.66
GTPBP1-202ENST00000418601 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.91■■■■□ 3.66
GTPBP1-202ENST00000418601 WIZO95785 1651 aa37.85■■■■□ 3.65
GTPBP1-202ENST00000418601 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
GTPBP1-202ENST00000418601 CFTRP13569 1480 aa37.68■■■■□ 3.62
GTPBP1-202ENST00000418601 ARHGEF11O15085 1522 aa37.65■■■■□ 3.62
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
GTPBP1-202ENST00000418601 IFT140Q96RY7 1462 aa37.35■■■■□ 3.57
GTPBP1-202ENST00000418601 PRDM2Q13029 1718 aa37.35■■■■□ 3.57
GTPBP1-202ENST00000418601 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.31■■■■□ 3.56
GTPBP1-202ENST00000418601 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
GTPBP1-202ENST00000418601 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
GTPBP1-202ENST00000418601 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
GTPBP1-202ENST00000418601 ARAP1Q96P48 1450 aa37.2■■■■□ 3.55
GTPBP1-202ENST00000418601 CHD1O14646 1710 aa37.18■■■■□ 3.54
GTPBP1-202ENST00000418601 TOPBP1Q92547 1522 aa37.1■■■■□ 3.53
GTPBP1-202ENST00000418601 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
GTPBP1-202ENST00000418601 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
GTPBP1-202ENST00000418601 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.91■■■■□ 3.5
GTPBP1-202ENST00000418601 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.9■■■■□ 3.52e-6■■■■□ 19.9
GTPBP1-202ENST00000418601 ABCC8Q09428 1581 aa36.9■■■■□ 3.5
GTPBP1-202ENST00000418601 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.5
GTPBP1-202ENST00000418601 FBLN2P98095 1184 aa36.85■■■■□ 3.49
GTPBP1-202ENST00000418601 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.81■■■■□ 3.48
GTPBP1-202ENST00000418601 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.68■■■■□ 3.46
GTPBP1-202ENST00000418601 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
GTPBP1-202ENST00000418601 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.57■■■■□ 3.45
GTPBP1-202ENST00000418601 SYNJ1O43426 1573 aa36.56■■■■□ 3.44
GTPBP1-202ENST00000418601 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.53■■■■□ 3.44
GTPBP1-202ENST00000418601 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
GTPBP1-202ENST00000418601 WDR97A6NE52 1622 aa36.45■■■■□ 3.42
GTPBP1-202ENST00000418601 SOGA1O94964 1423 aa36.41■■■■□ 3.42
GTPBP1-202ENST00000418601 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
GTPBP1-202ENST00000418601 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
GTPBP1-202ENST00000418601 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.32■■■■□ 3.41
GTPBP1-202ENST00000418601 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.3■■■■□ 3.4
GTPBP1-202ENST00000418601 SYNJ2O15056 1496 aa36.29■■■■□ 3.4
GTPBP1-202ENST00000418601 GRIN2BQ13224 1484 aa36.27■■■■□ 3.4
GTPBP1-202ENST00000418601 PBRM1Q86U86 1689 aa36.17■■■■□ 3.38
GTPBP1-202ENST00000418601 CUX1P39880 1505 aa36.09■■■■□ 3.37
GTPBP1-202ENST00000418601 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.02■■■■□ 3.36
GTPBP1-202ENST00000418601 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.91■■■■□ 3.34
GTPBP1-202ENST00000418601 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.9■■■■□ 3.34
GTPBP1-202ENST00000418601 CEP170Q5SW79 1584 aa35.87■■■■□ 3.33
GTPBP1-202ENST00000418601 GRIN2AQ12879 1464 aa35.82■■■■□ 3.32
GTPBP1-202ENST00000418601 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.78■■■■□ 3.32
GTPBP1-202ENST00000418601 ADAMTS12P58397 1594 aa35.74■■■■□ 3.31
GTPBP1-202ENST00000418601 SHROOM2Q13796 1616 aa35.74■■■■□ 3.31
GTPBP1-202ENST00000418601 NUP160Q12769 1436 aa35.72■■■■□ 3.31
GTPBP1-202ENST00000418601 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
GTPBP1-202ENST00000418601 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.48■■■■□ 3.27
GTPBP1-202ENST00000418601 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.48■■■■□ 3.27
GTPBP1-202ENST00000418601 DIP2BQ9P265 1576 aa35.46■■■■□ 3.27
GTPBP1-202ENST00000418601 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
GTPBP1-202ENST00000418601 KDM6BO15054 1643 aa35.45■■■■□ 3.27
GTPBP1-202ENST00000418601 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.44■■■■□ 3.26
GTPBP1-202ENST00000418601 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.42■■■■□ 3.26
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