Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 SNHG3-202ENST00000437681 2614 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.231e-323■■■■■ 722.5
FMR1Q06787 RPL10-208ENST00000449494 622 ntTSL 518.32■□□□□ 0.524e-30■■■■■ 414.2
FMR1Q06787 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.084e-30■■■■■ 414.2
FMR1Q06787 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.194e-30■■■■■ 414.2
FMR1Q06787 RPL10-209ENST00000451365 713 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.284e-30■■■■■ 414.2
FMR1Q06787 RPL10-205ENST00000427682 457 ntTSL 513.29□□□□□ -0.284e-30■■■■■ 414.2
FMR1Q06787 RPL10-201ENST00000344746 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.414e-30■■■■■ 414.2
FMR1Q06787 RPL10-206ENST00000428169 292 ntTSL 512.3□□□□□ -0.444e-30■■■■■ 414.2
FMR1Q06787 ZNF580-206ENST00000592881 1019 ntTSL 327.08■■□□□ 1.932e-49■■■■■ 396.9
FMR1Q06787 SNHG3-201ENST00000413987 2201 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.77e-47■■■■■ 392
FMR1Q06787 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.525e-13■■■■■ 279.4
FMR1Q06787 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.652e-75■■■■■ 258.5
FMR1Q06787 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.362e-19■■■■■ 257.2
FMR1Q06787 FTX-211ENST00000603672 1077 ntTSL 517.19■□□□□ 0.342e-19■■■■■ 257.2
FMR1Q06787 FTX-209ENST00000602812 2356 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.472e-19■■■■■ 257.2
FMR1Q06787 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.812e-19■■■■■ 257.2
FMR1Q06787 FTX-206ENST00000602420 751 ntTSL 37.36□□□□□ -1.232e-19■■■■■ 257.2
FMR1Q06787 FTX-218ENST00000641360 3897 nt5.98□□□□□ -1.452e-19■■■■■ 257.2
FMR1Q06787 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.572e-19■■■■■ 257.2
FMR1Q06787 RCC1-207ENST00000427469 903 ntTSL 516.68■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 206.2
FMR1Q06787 RCC1-210ENST00000434290 1070 ntTSL 516.24■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 206.2
FMR1Q06787 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 206.2
FMR1Q06787 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 206.2
FMR1Q06787 METTL12-202ENST00000529868 2870 ntTSL 1 (best)17.4■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 203
FMR1Q06787 METTL12-201ENST00000398922 1368 ntTSL 415.88■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 203
FMR1Q06787 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 203
FMR1Q06787 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.122e-41■■■■■ 176.3
FMR1Q06787 BACH1-203ENST00000422809 850 ntTSL 59.02□□□□□ -0.979e-45■■■■■ 171.4
FMR1Q06787 BACH1-208ENST00000468059 663 ntTSL 39.02□□□□□ -0.979e-45■■■■■ 171.4
FMR1Q06787 SRSF1-203ENST00000581497 438 ntTSL 39.96□□□□□ -0.823e-63■■■■■ 159.8
FMR1Q06787 SGMS1-208ENST00000608287 542 ntTSL 425.23■■□□□ 1.633e-16■■■■■ 132.3
FMR1Q06787 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.082e-28■■■■■ 131.1
FMR1Q06787 SMCHD1-213ENST00000609587 460 nt7.31□□□□□ -1.245e-13■■■■■ 127.2
FMR1Q06787 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.863e-6■■■■■ 118.5
FMR1Q06787 HNRNPR-206ENST00000464516 557 ntTSL 210.46□□□□□ -0.731e-55■■■■■ 118.5
FMR1Q06787 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.695e-66■■■■■ 115.8
FMR1Q06787 PRKAR1B-202ENST00000400758 888 ntTSL 331.35■■■□□ 2.615e-66■■■■■ 115.8
FMR1Q06787 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.045e-66■■■■■ 115.8
FMR1Q06787 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.575e-66■■■■■ 115.8
FMR1Q06787 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.995e-66■■■■■ 115.8
FMR1Q06787 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.775e-66■■■■■ 115.8
FMR1Q06787 AP000487.1-201ENST00000530690 554 ntTSL 422.95■■□□□ 1.263e-33■■■■■ 115.3
FMR1Q06787 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.583e-33■■■■■ 115.3
FMR1Q06787 AP000487.1-203ENST00000524619 392 ntTSL 314.25□□□□□ -0.133e-33■■■■■ 115.3
FMR1Q06787 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.571e-7■■■■■ 110.6
FMR1Q06787 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.185e-8■■■■■ 110.5
FMR1Q06787 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.25e-8■■■■■ 110.5
FMR1Q06787 TRAPPC12-211ENST00000452495 544 ntTSL 417.46■□□□□ 0.392e-31■■■■■ 109.2
FMR1Q06787 TRAPPC12-216ENST00000469400 720 ntTSL 217.12■□□□□ 0.332e-31■■■■■ 109.2
FMR1Q06787 TRAPPC12-222ENST00000493792 567 ntTSL 213.31□□□□□ -0.282e-31■■■■■ 109.2
FMR1Q06787 TRAPPC12-205ENST00000416918 473 ntTSL 312.38□□□□□ -0.432e-31■■■■■ 109.2
FMR1Q06787 TRAPPC12-223ENST00000497597 3401 ntTSL 212.05□□□□□ -0.482e-31■■■■■ 109.2
FMR1Q06787 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.237e-31■■■■■ 107.1
FMR1Q06787 CYHR1-206ENST00000526887 1012 ntTSL 321.92■■□□□ 1.17e-31■■■■■ 107.1
FMR1Q06787 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.787e-31■■■■■ 107.1
FMR1Q06787 CYHR1-208ENST00000528663 5821 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.137e-31■■■■■ 107.1
FMR1Q06787 XYLB-204ENST00000472721 546 ntTSL 416.59■□□□□ 0.256e-30■■■■■ 104
FMR1Q06787 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.815e-8■■■■■ 103.9
FMR1Q06787 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.752e-16■■■■■ 102.3
FMR1Q06787 SGMS1-209ENST00000609445 594 ntTSL 420.68■□□□□ 0.92e-16■■■■■ 102.3
FMR1Q06787 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.082e-16■■■■■ 102.3
FMR1Q06787 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.052e-16■■■■■ 102.3
FMR1Q06787 UBE2G2-203ENST00000462569 762 ntTSL 226.18■■□□□ 1.782e-28■■■■■ 98.9
FMR1Q06787 UBE2G2-212ENST00000497664 590 ntTSL 426.18■■□□□ 1.782e-28■■■■■ 98.9
FMR1Q06787 UBE2G2-205ENST00000478200 637 ntTSL 426.18■■□□□ 1.782e-28■■■■■ 98.9
FMR1Q06787 UBE2G2-209ENST00000491513 744 ntTSL 425.17■■□□□ 1.622e-28■■■■■ 98.9
FMR1Q06787 UBE2G2-211ENST00000497630 933 ntTSL 224.72■■□□□ 1.552e-28■■■■■ 98.9
FMR1Q06787 UBE2G2-207ENST00000490091 1512 ntTSL 1 (best)23.76■■□□□ 1.392e-28■■■■■ 98.9
FMR1Q06787 UBE2G2-204ENST00000477954 1034 ntTSL 320.63■□□□□ 0.892e-28■■■■■ 98.9
FMR1Q06787 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.812e-28■■■■■ 98.9
FMR1Q06787 UBE2G2-208ENST00000490450 424 ntTSL 310.61□□□□□ -0.712e-28■■■■■ 98.9
FMR1Q06787 UBE2G2-210ENST00000496395 288 ntTSL 57.89□□□□□ -1.152e-28■■■■■ 98.9
FMR1Q06787 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.151e-8■■■■■ 97.3
FMR1Q06787 SMCHD1-206ENST00000581631 729 ntTSL 37.14□□□□□ -1.273e-9■■■■■ 92
FMR1Q06787 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.539e-26■■■■■ 89.6
FMR1Q06787 MRPS33-201ENST00000324787 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.699e-26■■■■■ 89.6
FMR1Q06787 FANCI-217ENST00000570225 526 ntTSL 37.36□□□□□ -1.239e-26■■■■■ 89.6
FMR1Q06787 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.489e-26■■■■■ 89.6
FMR1Q06787 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.639e-26■■■■■ 89.6
FMR1Q06787 FANCI-210ENST00000565522 233 ntTSL 54.82□□□□□ -1.649e-26■■■■■ 89.6
FMR1Q06787 FANCI-203ENST00000447611 3690 ntTSL 24.22□□□□□ -1.739e-26■■■■■ 89.6
FMR1Q06787 FANCI-204ENST00000561894 3268 ntTSL 23.91□□□□□ -1.789e-26■■■■■ 89.6
FMR1Q06787 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.115e-23■■■■■ 88
FMR1Q06787 LINC00694-203ENST00000636468 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.335e-23■■■■■ 88
FMR1Q06787 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.585e-23■■■■■ 88
FMR1Q06787 CHCHD3-204ENST00000457942 559 ntTSL 420.67■□□□□ 0.94e-14■■■■■ 87.5
FMR1Q06787 AC020687.1-201ENST00000560439 448 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.787e-25■■■■■ 86.5
FMR1Q06787 KIF13A-209ENST00000505588 212 ntTSL 55.42□□□□□ -1.547e-25■■■■■ 86.5
FMR1Q06787 ZNF518B-205ENST00000515072 2623 ntTSL 1 (best)18.17■□□□□ 0.51e-12■■■■■ 85.9
FMR1Q06787 ZNF518B-204ENST00000507515 527 ntTSL 414.63□□□□□ -0.071e-12■■■■■ 85.9
FMR1Q06787 ZNF518B-203ENST00000503068 4196 ntTSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.421e-12■■■■■ 85.9
FMR1Q06787 ZNF518B-202ENST00000500268 4145 ntTSL 1 (best)9.49□□□□□ -0.891e-12■■■■■ 85.9
FMR1Q06787 GABRE-206ENST00000474932 430 ntTSL 55.41□□□□□ -1.541e-24■■■■■ 85.5
FMR1Q06787 SIRT7-215ENST00000574495 920 ntTSL 225.82■■□□□ 1.723e-69■■■■■ 82.7
FMR1Q06787 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.562e-8■■■■■ 81.9
FMR1Q06787 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 81.9
FMR1Q06787 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.177e-29■■■■■ 81.5
FMR1Q06787 TBPL1-202ENST00000367869 623 ntTSL 322.28■■□□□ 1.167e-29■■■■■ 81.5
FMR1Q06787 TBPL1-205ENST00000457715 865 ntTSL 521.72■■□□□ 1.077e-29■■■■■ 81.5
FMR1Q06787 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.97e-29■■■■■ 81.5
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 54.9 ms