RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527634.5

C11orf80-210, Transcript of chromosome 11 open reading frame 80, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene C11orf80, Length 1,666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf80-210ENST00000527634 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.27■■■■■ 6.44
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C11orf80-210ENST00000527634 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.12■■■■■ 4.81
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C11orf80-210ENST00000527634 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.75■■■■■ 4.43
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C11orf80-210ENST00000527634 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.64■■■■■ 4.42
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C11orf80-210ENST00000527634 SMARCA2P51531 1590 aa41.62■■■■■ 4.25
C11orf80-210ENST00000527634 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.52■■■■■ 4.24
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C11orf80-210ENST00000527634 NCAPD3P42695 1498 aa41.14■■■■■ 4.18
C11orf80-210ENST00000527634 ABCC8Q09428 1581 aa40.69■■■■■ 4.1
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C11orf80-210ENST00000527634 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.54■■■■■ 4.08
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C11orf80-210ENST00000527634 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
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C11orf80-210ENST00000527634 SYNJ1O43426 1573 aa40.26■■■■■ 4.03
C11orf80-210ENST00000527634 TOP2BQ02880 1626 aa40.18■■■■■ 4.02
C11orf80-210ENST00000527634 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.15■■■■■ 4.02
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C11orf80-210ENST00000527634 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.82■■■■□ 3.97
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C11orf80-210ENST00000527634 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.4■■■■□ 3.74
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C11orf80-210ENST00000527634 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP38.24■■■■□ 3.71
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