RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524551.5

C11orf80-202, Transcript of chromosome 11 open reading frame 80, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene C11orf80, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf80-202ENST00000524551 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.42■■■■■ 5.5
C11orf80-202ENST00000524551 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.16■■■■■ 4.66
C11orf80-202ENST00000524551 ABCC9O60706 1549 aa43.93■■■■■ 4.62
C11orf80-202ENST00000524551 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.92■■■■■ 4.3
C11orf80-202ENST00000524551 NACADO15069 1562 aa41.71■■■■■ 4.27
C11orf80-202ENST00000524551 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.61■■■■■ 4.25
C11orf80-202ENST00000524551 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.25■■■■■ 4.19
C11orf80-202ENST00000524551 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
C11orf80-202ENST00000524551 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.99■■■■■ 4.15
C11orf80-202ENST00000524551 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.98■■■■■ 4.15
C11orf80-202ENST00000524551 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.93■■■■■ 4.14
C11orf80-202ENST00000524551 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.83■■■■■ 4.13
C11orf80-202ENST00000524551 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.7■■■■■ 4.11
C11orf80-202ENST00000524551 SCRIBQ14160 1630 aa40.28■■■■■ 4.04
C11orf80-202ENST00000524551 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.18■■■■■ 4.02
C11orf80-202ENST00000524551 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
C11orf80-202ENST00000524551 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.67■■■■□ 3.94
C11orf80-202ENST00000524551 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.54■■■■□ 3.92
C11orf80-202ENST00000524551 NCAPD3P42695 1498 aa38.54■■■■□ 3.76
C11orf80-202ENST00000524551 SMARCA4P51532 1647 aa38.46■■■■□ 3.75
C11orf80-202ENST00000524551 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.46■■■■□ 3.75
C11orf80-202ENST00000524551 SMARCA2P51531 1590 aa38.35■■■■□ 3.73
C11orf80-202ENST00000524551 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.73
C11orf80-202ENST00000524551 HMGXB3Q12766 1538 aa38.25■■■■□ 3.71
C11orf80-202ENST00000524551 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.1■■■■□ 3.69
C11orf80-202ENST00000524551 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.09■■■■□ 3.69
C11orf80-202ENST00000524551 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
C11orf80-202ENST00000524551 ERCC6Q03468 1493 aa37.9■■■■□ 3.66
C11orf80-202ENST00000524551 NESP48681 1621 aa37.83■■■■□ 3.65
C11orf80-202ENST00000524551 CUX2O14529 1486 aa37.72■■■■□ 3.63
C11orf80-202ENST00000524551 WIZO95785 1651 aa37.62■■■■□ 3.61
C11orf80-202ENST00000524551 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.58■■■■□ 3.61
C11orf80-202ENST00000524551 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
C11orf80-202ENST00000524551 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.4■■■■□ 3.58
C11orf80-202ENST00000524551 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.39■■■■□ 3.58
C11orf80-202ENST00000524551 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.38■■■■□ 3.57
C11orf80-202ENST00000524551 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
C11orf80-202ENST00000524551 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.29■■■■□ 3.56
C11orf80-202ENST00000524551 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
C11orf80-202ENST00000524551 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.03■■■■□ 3.52
C11orf80-202ENST00000524551 CFTRP13569 1480 aa37.01■■■■□ 3.52
C11orf80-202ENST00000524551 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.94■■■■□ 3.5
C11orf80-202ENST00000524551 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.94■■■■□ 3.5
C11orf80-202ENST00000524551 WDR62O43379 1518 aa36.92■■■■□ 3.5
C11orf80-202ENST00000524551 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.78■■■■□ 3.48
C11orf80-202ENST00000524551 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
C11orf80-202ENST00000524551 PRDM2Q13029 1718 aa36.57■■■■□ 3.45
C11orf80-202ENST00000524551 TOPBP1Q92547 1522 aa36.28■■■■□ 3.4
C11orf80-202ENST00000524551 ABCC8Q09428 1581 aa36.21■■■■□ 3.39
C11orf80-202ENST00000524551 IFT140Q96RY7 1462 aa36.21■■■■□ 3.39
C11orf80-202ENST00000524551 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.15■■■■□ 3.38
C11orf80-202ENST00000524551 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
C11orf80-202ENST00000524551 OSCARQ8IYS5 282 aa36.09■■■■□ 3.37
C11orf80-202ENST00000524551 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
C11orf80-202ENST00000524551 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
C11orf80-202ENST00000524551 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
C11orf80-202ENST00000524551 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
C11orf80-202ENST00000524551 TRIM41Q8WV44 630 aa35.87■■■■□ 3.33
C11orf80-202ENST00000524551 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.85■■■■□ 3.33
C11orf80-202ENST00000524551 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.8■■■■□ 3.32
C11orf80-202ENST00000524551 SOGA1O94964 1423 aa35.78■■■■□ 3.32
C11orf80-202ENST00000524551 CUX1P39880 1505 aa35.76■■■■□ 3.31
C11orf80-202ENST00000524551 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.74■■■■□ 3.31
C11orf80-202ENST00000524551 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
C11orf80-202ENST00000524551 FBLN2P98095 1184 aa35.56■■■■□ 3.28
C11orf80-202ENST00000524551 CHD1O14646 1710 aa35.55■■■■□ 3.28
C11orf80-202ENST00000524551 WDR97A6NE52 1622 aa35.55■■■■□ 3.28
C11orf80-202ENST00000524551 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.54■■■■□ 3.28
C11orf80-202ENST00000524551 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.54■■■■□ 3.28
C11orf80-202ENST00000524551 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.54■■■■□ 3.28
C11orf80-202ENST00000524551 ARHGEF11O15085 1522 aa35.47■■■■□ 3.27
C11orf80-202ENST00000524551 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.47■■■■□ 3.27
C11orf80-202ENST00000524551 GRIN2BQ13224 1484 aa35.42■■■■□ 3.26
C11orf80-202ENST00000524551 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
C11orf80-202ENST00000524551 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.36■■■■□ 3.25
C11orf80-202ENST00000524551 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
C11orf80-202ENST00000524551 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.34■■■■□ 3.25
C11orf80-202ENST00000524551 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.29■■■■□ 3.24
C11orf80-202ENST00000524551 SYNJ2O15056 1496 aa35.27■■■■□ 3.24
C11orf80-202ENST00000524551 TOP2BQ02880 1626 aa35.25■■■■□ 3.23
C11orf80-202ENST00000524551 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.25■■■■□ 3.23
C11orf80-202ENST00000524551 PBRM1Q86U86 1689 aa35.24■■■■□ 3.23
C11orf80-202ENST00000524551 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.24■■■■□ 3.23
C11orf80-202ENST00000524551 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.23■■■■□ 3.23
C11orf80-202ENST00000524551 SYNJ1O43426 1573 aa35.22■■■■□ 3.23
C11orf80-202ENST00000524551 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.2■■■■□ 3.23
C11orf80-202ENST00000524551 ARAP1Q96P48 1450 aa35.16■■■■□ 3.22
C11orf80-202ENST00000524551 GRIN2AQ12879 1464 aa34.97■■■■□ 3.19
C11orf80-202ENST00000524551 ADAMTS12P58397 1594 aa34.96■■■■□ 3.19
C11orf80-202ENST00000524551 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.91■■■■□ 3.18
C11orf80-202ENST00000524551 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.91■■■■□ 3.18
C11orf80-202ENST00000524551 NUP160Q12769 1436 aa34.84■■■■□ 3.17
C11orf80-202ENST00000524551 CEP170Q5SW79 1584 aa34.82■■■■□ 3.16
C11orf80-202ENST00000524551 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
C11orf80-202ENST00000524551 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.69■■■■□ 3.14
C11orf80-202ENST00000524551 SHROOM2Q13796 1616 aa34.63■■■■□ 3.13
C11orf80-202ENST00000524551 KIF27Q86VH2 1401 aa34.6■■■■□ 3.13
C11orf80-202ENST00000524551 IGF1RP08069 1367 aa34.59■■■■□ 3.13
C11orf80-202ENST00000524551 JPH4Q96JJ6 628 aa34.51■■■■□ 3.12
C11orf80-202ENST00000524551 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms