Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 NPAS2-202ENST00000427413 625 ntTSL 37.31□□□□□ -1.241e-7■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.562e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 RBM12B-203ENST00000518597 579 ntTSL 211.69□□□□□ -0.545e-10■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 RBM12B-204ENST00000519109 615 ntTSL 27.38□□□□□ -1.235e-10■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.688e-7■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.458e-7■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.338e-7■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.28e-7■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 PCSK6-203ENST00000557794 1196 ntTSL 511.24□□□□□ -0.618e-7■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.381e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.411e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.812e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.392e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.332e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.182e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.062e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.042e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.022e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.412e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.542e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.742e-6■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 RBM12B-205ENST00000520560 588 ntTSL 210.03□□□□□ -0.84e-10■■■□□ 14.6
HLTFQ14527 DLEU1-216ENST00000473075 348 ntTSL 54.34□□□□□ -1.712e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.383e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.193e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.183e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 SCLT1-202ENST00000439369 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.373e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.413e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.688e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.88e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.841e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.541e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.451e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.381e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 PPP1R26-203ENST00000602993 409 ntTSL 412.17□□□□□ -0.461e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.339e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 LINC00534-202ENST00000523283 772 ntTSL 26.77□□□□□ -1.339e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 LINC00534-204ENST00000524361 620 ntTSL 36.44□□□□□ -1.389e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.519e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.96e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 PALB2-206ENST00000568219 3963 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.431e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 PALB2-201ENST00000261584 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 AL445686.1-201ENST00000443086 348 ntBASIC8.16□□□□□ -1.16e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 PALB2-203ENST00000565038 344 ntTSL 35.08□□□□□ -1.61e-6■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.496e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.452e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 IPO5-202ENST00000357602 4335 ntAPPRIS P1 TSL 514.04□□□□□ -0.161e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 IPO5-208ENST00000469360 3505 ntTSL 29.52□□□□□ -0.891e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.051e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 IPO5-223ENST00000491555 3688 ntTSL 25.72□□□□□ -1.491e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.51e-7■■□□□ 14.5
HLTFQ14527 MYH10-202ENST00000360416 7762 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.453e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.63e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.63e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.464e-8■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 COX11-204ENST00000572558 1054 ntTSL 315.24■□□□□ 0.033e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 COX11-209ENST00000576370 2663 ntTSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.423e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 COX11-206ENST00000574821 495 ntTSL 25.86□□□□□ -1.473e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 COX11-205ENST00000573912 453 ntTSL 24.94□□□□□ -1.623e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.42e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.522e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.62e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.622e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.682e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.11e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 PCSK6-202ENST00000398185 3723 ntTSL 1 (best)9.73□□□□□ -0.851e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 PCSK6-207ENST00000558951 543 ntTSL 39.46□□□□□ -0.91e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 PCSK6-211ENST00000559605 379 ntTSL 38.5□□□□□ -1.051e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 PCSK6-213ENST00000560902 501 ntTSL 48.41□□□□□ -1.061e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.414e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 CALD1-209ENST00000436461 1614 ntTSL 516.81■□□□□ 0.284e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.244e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.114e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 CALD1-207ENST00000430085 1938 ntTSL 215.05■□□□□ 04e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.084e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 CALD1-210ENST00000443197 4173 ntTSL 511.71□□□□□ -0.544e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 CALD1-203ENST00000393118 4281 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.544e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 CALD1-220ENST00000482470 3941 ntTSL 210.18□□□□□ -0.784e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.814e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 CALD1-202ENST00000361901 4114 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.834e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 PHF3-207ENST00000505138 612 ntTSL 35.79□□□□□ -1.484e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.674e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.944e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.984e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.014e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.524e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.862e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 FBXO11-210ENST00000493962 1986 ntTSL 25.98□□□□□ -1.452e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.762e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.782e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-6■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.729e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 GOSR2-228ENST00000639388 2514 ntTSL 518.76■□□□□ 0.599e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 GOSR2-236ENST00000640358 2313 ntTSL 517.84■□□□□ 0.459e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 GOSR2-216ENST00000638468 1788 ntTSL 517.03■□□□□ 0.329e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 GOSR2-244ENST00000640792 2452 ntTSL 516.81■□□□□ 0.289e-7■■□□□ 14.4
HLTFQ14527 GOSR2-227ENST00000639365 1584 ntTSL 515.8■□□□□ 0.129e-7■■□□□ 14.4
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