Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.461e-16■■■■■ 37.5
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RBM22Q9NW64 SRSF5-202ENST00000553369 613 ntTSL 210.05□□□□□ -0.81e-16■■■■■ 37.5
RBM22Q9NW64 SRSF5-217ENST00000557154 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.851e-16■■■■■ 37.5
RBM22Q9NW64 SRSF5-219ENST00000557460 939 ntTSL 58.91□□□□□ -0.981e-16■■■■■ 37.5
RBM22Q9NW64 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC8.33□□□□□ -1.081e-16■■■■■ 37.5
RBM22Q9NW64 SRSF5-211ENST00000555547 2057 ntTSL 58.17□□□□□ -1.11e-16■■■■■ 37.5
RBM22Q9NW64 SRSF5-207ENST00000554465 3044 ntTSL 1 (best)8.03□□□□□ -1.121e-16■■■■■ 37.5
RBM22Q9NW64 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.31e-16■■■■■ 37.5
RBM22Q9NW64 U2SURP-209ENST00000480029 2855 ntTSL 21.88□□□□□ -2.119e-7■■■■■ 37.5
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RBM22Q9NW64 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 37.4
RBM22Q9NW64 IPO8-206ENST00000540979 792 ntTSL 525.18■■□□□ 1.624e-7■■■■■ 37.4
RBM22Q9NW64 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 37.4
RBM22Q9NW64 USP15-215ENST00000549523 584 ntTSL 511.26□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 37.4
RBM22Q9NW64 USP15-208ENST00000548524 648 ntTSL 29.56□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 37.4
RBM22Q9NW64 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.174e-12■■■■■ 37.3
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RBM22Q9NW64 CEACAM1-204ENST00000358394 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -16e-14■■■■■ 37.3
RBM22Q9NW64 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.346e-14■■■■■ 37.3
RBM22Q9NW64 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.346e-14■■■■■ 37.3
RBM22Q9NW64 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.366e-14■■■■■ 37.3
RBM22Q9NW64 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.366e-14■■■■■ 37.3
RBM22Q9NW64 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.486e-14■■■■■ 37.3
RBM22Q9NW64 CEACAM1-211ENST00000485605 678 ntTSL 55.56□□□□□ -1.526e-14■■■■■ 37.3
RBM22Q9NW64 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.757e-8■■■■■ 37.1
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RBM22Q9NW64 CDC45-207ENST00000455750 568 ntTSL 212.91□□□□□ -0.341e-10■■■■■ 37.1
RBM22Q9NW64 MEMO1-205ENST00000413686 769 ntTSL 315.91■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 MEMO1-209ENST00000490459 1242 ntTSL 214.13□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 MEMO1-201ENST00000295065 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 MEMO1-203ENST00000404530 1482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 DPY30-206ENST00000446765 1519 ntTSL 52.74□□□□□ -1.973e-6■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 MEMO1-206ENST00000422936 327 ntTSL 51.56□□□□□ -2.163e-6■■■■■ 37
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RBM22Q9NW64 ZNF280A-201ENST00000302097 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.891e-8■■■■■ 37
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RBM22Q9NW64 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.021e-12■■■■■ 37
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RBM22Q9NW64 CAP1-210ENST00000420216 668 ntTSL 514.53□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 CAP1-208ENST00000414893 528 ntTSL 313.57□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 CAP1-214ENST00000435719 817 ntTSL 313.21□□□□□ -0.291e-8■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 CAP1-209ENST00000417287 610 ntTSL 513.14□□□□□ -0.311e-8■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 CAP1-207ENST00000414281 772 ntTSL 411.23□□□□□ -0.611e-8■■■■■ 37
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RBM22Q9NW64 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 EIF4A2-223ENST00000494445 629 ntTSL 28.8□□□□□ -13e-7■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 EIF4A2-225ENST00000496382 460 ntTSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 EIF4A2-226ENST00000497177 849 ntTSL 54.53□□□□□ -1.683e-7■■■■■ 37
RBM22Q9NW64 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.283e-7■■■■■ 36.9
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