RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599236.5

FCHO1-228, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-228ENST00000599236 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.88■■■■□ 3.33
FCHO1-228ENST00000599236 ABCC9O60706 1549 aa32.64■■■□□ 2.82
FCHO1-228ENST00000599236 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.16■■■□□ 2.74
FCHO1-228ENST00000599236 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.07■■■□□ 2.56
FCHO1-228ENST00000599236 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.79■■■□□ 2.52
FCHO1-228ENST00000599236 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.55■■■□□ 2.48
FCHO1-228ENST00000599236 NACADO15069 1562 aa30.53■■■□□ 2.48
FCHO1-228ENST00000599236 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.47■■■□□ 2.47
FCHO1-228ENST00000599236 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.19■■■□□ 2.42
FCHO1-228ENST00000599236 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.05■■■□□ 2.4
FCHO1-228ENST00000599236 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.99■■■□□ 2.39
FCHO1-228ENST00000599236 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
FCHO1-228ENST00000599236 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.53■■■□□ 2.32
FCHO1-228ENST00000599236 SCRIBQ14160 1630 aa29.43■■■□□ 2.3
FCHO1-228ENST00000599236 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.42■■■□□ 2.3
FCHO1-228ENST00000599236 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.38■■■□□ 2.29
FCHO1-228ENST00000599236 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.36■■■□□ 2.29
FCHO1-228ENST00000599236 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
FCHO1-228ENST00000599236 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.57■■■□□ 2.16
FCHO1-228ENST00000599236 NCAPD3P42695 1498 aa28.27■■■□□ 2.12
FCHO1-228ENST00000599236 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.17■■■□□ 2.1
FCHO1-228ENST00000599236 CUX2O14529 1486 aa28.1■■■□□ 2.09
FCHO1-228ENST00000599236 ERCC6Q03468 1493 aa28.09■■■□□ 2.09
FCHO1-228ENST00000599236 SMARCA4P51532 1647 aa28.02■■■□□ 2.08
FCHO1-228ENST00000599236 NESP48681 1621 aa28.01■■■□□ 2.07
FCHO1-228ENST00000599236 SMARCA2P51531 1590 aa27.95■■■□□ 2.07
FCHO1-228ENST00000599236 HMGXB3Q12766 1538 aa27.93■■■□□ 2.06
FCHO1-228ENST00000599236 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
FCHO1-228ENST00000599236 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
FCHO1-228ENST00000599236 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.72■■■□□ 2.03
FCHO1-228ENST00000599236 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.71■■■□□ 2.03
FCHO1-228ENST00000599236 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
FCHO1-228ENST00000599236 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.58■■■□□ 2.01
FCHO1-228ENST00000599236 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.52■■■□□ 2
FCHO1-228ENST00000599236 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.47■■□□□ 1.99
FCHO1-228ENST00000599236 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.42■■□□□ 1.98
FCHO1-228ENST00000599236 WIZO95785 1651 aa27.35■■□□□ 1.97
FCHO1-228ENST00000599236 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.25■■□□□ 1.95
FCHO1-228ENST00000599236 TRIM41Q8WV44 630 aa27.22■■□□□ 1.95
FCHO1-228ENST00000599236 WDR62O43379 1518 aa27.19■■□□□ 1.94
FCHO1-228ENST00000599236 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.08■■□□□ 1.93
FCHO1-228ENST00000599236 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.08■■□□□ 1.93
FCHO1-228ENST00000599236 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
FCHO1-228ENST00000599236 CFTRP13569 1480 aa27.03■■□□□ 1.92
FCHO1-228ENST00000599236 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
FCHO1-228ENST00000599236 OSCARQ8IYS5 282 aa26.9■■□□□ 1.9
FCHO1-228ENST00000599236 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
FCHO1-228ENST00000599236 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.7■■□□□ 1.87
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
FCHO1-228ENST00000599236 PRDM2Q13029 1718 aa26.59■■□□□ 1.85
FCHO1-228ENST00000599236 IFT140Q96RY7 1462 aa26.55■■□□□ 1.84
FCHO1-228ENST00000599236 TOPBP1Q92547 1522 aa26.55■■□□□ 1.84
FCHO1-228ENST00000599236 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.54■■□□□ 1.84
FCHO1-228ENST00000599236 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.54■■□□□ 1.84
FCHO1-228ENST00000599236 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.54■■□□□ 1.84
FCHO1-228ENST00000599236 ARHGEF11O15085 1522 aa26.42■■□□□ 1.82
FCHO1-228ENST00000599236 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.829e-7■■■■■ 30.5
FCHO1-228ENST00000599236 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
FCHO1-228ENST00000599236 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.37■■□□□ 1.81
FCHO1-228ENST00000599236 ABCC8Q09428 1581 aa26.36■■□□□ 1.81
FCHO1-228ENST00000599236 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.35■■□□□ 1.81
FCHO1-228ENST00000599236 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
FCHO1-228ENST00000599236 FBLN2P98095 1184 aa26.28■■□□□ 1.8
FCHO1-228ENST00000599236 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
FCHO1-228ENST00000599236 CHD1O14646 1710 aa26.26■■□□□ 1.79
FCHO1-228ENST00000599236 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.26■■□□□ 1.79
FCHO1-228ENST00000599236 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
FCHO1-228ENST00000599236 ARAP1Q96P48 1450 aa26.18■■□□□ 1.78
FCHO1-228ENST00000599236 SOGA1O94964 1423 aa26.16■■□□□ 1.78
FCHO1-228ENST00000599236 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
FCHO1-228ENST00000599236 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.06■■□□□ 1.76
FCHO1-228ENST00000599236 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.04■■□□□ 1.76
FCHO1-228ENST00000599236 CUX1P39880 1505 aa26.03■■□□□ 1.76
FCHO1-228ENST00000599236 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
FCHO1-228ENST00000599236 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.96■■□□□ 1.75
FCHO1-228ENST00000599236 GRIN2BQ13224 1484 aa25.91■■□□□ 1.74
FCHO1-228ENST00000599236 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
FCHO1-228ENST00000599236 WDR97A6NE52 1622 aa25.87■■□□□ 1.73
FCHO1-228ENST00000599236 SYNJ1O43426 1573 aa25.84■■□□□ 1.73
FCHO1-228ENST00000599236 SYNJ2O15056 1496 aa25.84■■□□□ 1.73
FCHO1-228ENST00000599236 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.8■■□□□ 1.72
FCHO1-228ENST00000599236 PBRM1Q86U86 1689 aa25.74■■□□□ 1.71
FCHO1-228ENST00000599236 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
FCHO1-228ENST00000599236 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.72■■□□□ 1.71
FCHO1-228ENST00000599236 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.68■■□□□ 1.7
FCHO1-228ENST00000599236 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.66■■□□□ 1.7
FCHO1-228ENST00000599236 GRIN2AQ12879 1464 aa25.58■■□□□ 1.69
FCHO1-228ENST00000599236 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
FCHO1-228ENST00000599236 CEP170Q5SW79 1584 aa25.53■■□□□ 1.68
FCHO1-228ENST00000599236 NUP160Q12769 1436 aa25.53■■□□□ 1.68
FCHO1-228ENST00000599236 ADAMTS12P58397 1594 aa25.5■■□□□ 1.67
FCHO1-228ENST00000599236 TOP2BQ02880 1626 aa25.46■■□□□ 1.67
FCHO1-228ENST00000599236 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
FCHO1-228ENST00000599236 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.45■■□□□ 1.66
FCHO1-228ENST00000599236 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.45■■□□□ 1.66
FCHO1-228ENST00000599236 SHROOM2Q13796 1616 aa25.4■■□□□ 1.66
FCHO1-228ENST00000599236 JPH4Q96JJ6 628 aa25.35■■□□□ 1.65
FCHO1-228ENST00000599236 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.35■■□□□ 1.65
FCHO1-228ENST00000599236 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
FCHO1-228ENST00000599236 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.24■■□□□ 1.63
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