RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596309.5

FCHO1-212, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-212ENST00000596309 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.31■■■■■ 5
FCHO1-212ENST00000596309 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.07■■■■■ 4.16
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FCHO1-212ENST00000596309 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
FCHO1-212ENST00000596309 NACADO15069 1562 aa38.57■■■■□ 3.77
FCHO1-212ENST00000596309 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.53■■■■□ 3.76
FCHO1-212ENST00000596309 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.49■■■■□ 3.75
FCHO1-212ENST00000596309 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.45■■■■□ 3.75
FCHO1-212ENST00000596309 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.44■■■■□ 3.74
FCHO1-212ENST00000596309 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.48■■■■□ 3.59
FCHO1-212ENST00000596309 SCRIBQ14160 1630 aa37.34■■■■□ 3.57
FCHO1-212ENST00000596309 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.21■■■■□ 3.55
FCHO1-212ENST00000596309 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.14■■■■□ 3.54
FCHO1-212ENST00000596309 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.1■■■■□ 3.53
FCHO1-212ENST00000596309 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
FCHO1-212ENST00000596309 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.1■■■■□ 3.37
FCHO1-212ENST00000596309 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.99■■■■□ 3.35
FCHO1-212ENST00000596309 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.92■■■■□ 3.34
FCHO1-212ENST00000596309 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
FCHO1-212ENST00000596309 SMARCA4P51532 1647 aa35.83■■■■□ 3.33
FCHO1-212ENST00000596309 SMARCA2P51531 1590 aa35.62■■■■□ 3.29
FCHO1-212ENST00000596309 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.61■■■■□ 3.29
FCHO1-212ENST00000596309 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.59■■■■□ 3.29
FCHO1-212ENST00000596309 NCAPD3P42695 1498 aa35.57■■■■□ 3.28
FCHO1-212ENST00000596309 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.56■■■■□ 3.28
FCHO1-212ENST00000596309 HMGXB3Q12766 1538 aa35.42■■■■□ 3.26
FCHO1-212ENST00000596309 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
FCHO1-212ENST00000596309 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
FCHO1-212ENST00000596309 WIZO95785 1651 aa35.21■■■■□ 3.23
FCHO1-212ENST00000596309 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
FCHO1-212ENST00000596309 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
FCHO1-212ENST00000596309 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.57■■■■□ 3.12
FCHO1-212ENST00000596309 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.54■■■■□ 3.12
FCHO1-212ENST00000596309 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.52■■■■□ 3.12
FCHO1-212ENST00000596309 NESP48681 1621 aa34.43■■■■□ 3.1
FCHO1-212ENST00000596309 CFTRP13569 1480 aa34.39■■■■□ 3.1
FCHO1-212ENST00000596309 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.36■■■■□ 3.09
FCHO1-212ENST00000596309 ERCC6Q03468 1493 aa34.28■■■■□ 3.08
FCHO1-212ENST00000596309 PRDM2Q13029 1718 aa34.13■■■■□ 3.05
FCHO1-212ENST00000596309 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.08■■■■□ 3.05
FCHO1-212ENST00000596309 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.06■■■■□ 3.04
FCHO1-212ENST00000596309 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.03■■■■□ 3.04
FCHO1-212ENST00000596309 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.92■■■■□ 3.02
FCHO1-212ENST00000596309 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
FCHO1-212ENST00000596309 CUX2O14529 1486 aa33.89■■■■□ 3.02
FCHO1-212ENST00000596309 WDR62O43379 1518 aa33.79■■■■□ 3
FCHO1-212ENST00000596309 ABCC8Q09428 1581 aa33.74■■■□□ 2.99
FCHO1-212ENST00000596309 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
FCHO1-212ENST00000596309 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.59■■■□□ 2.97
FCHO1-212ENST00000596309 TOPBP1Q92547 1522 aa33.58■■■□□ 2.97
FCHO1-212ENST00000596309 CUX1P39880 1505 aa33.4■■■□□ 2.94
FCHO1-212ENST00000596309 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.36■■■□□ 2.93
FCHO1-212ENST00000596309 IFT140Q96RY7 1462 aa33.35■■■□□ 2.93
FCHO1-212ENST00000596309 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
FCHO1-212ENST00000596309 TOP2BQ02880 1626 aa33.26■■■□□ 2.91
FCHO1-212ENST00000596309 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.25■■■□□ 2.91
FCHO1-212ENST00000596309 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.24■■■□□ 2.91
FCHO1-212ENST00000596309 SOGA1O94964 1423 aa33.2■■■□□ 2.91
FCHO1-212ENST00000596309 SYNJ1O43426 1573 aa33.17■■■□□ 2.9
FCHO1-212ENST00000596309 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
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FCHO1-212ENST00000596309 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.09■■■□□ 2.89
FCHO1-212ENST00000596309 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.02■■■□□ 2.88
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
FCHO1-212ENST00000596309 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
FCHO1-212ENST00000596309 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.91■■■□□ 2.869e-7■■■■■ 30.5
FCHO1-212ENST00000596309 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
FCHO1-212ENST00000596309 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.83■■■□□ 2.85
FCHO1-212ENST00000596309 TRIM41Q8WV44 630 aa32.81■■■□□ 2.84
FCHO1-212ENST00000596309 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.8■■■□□ 2.84
FCHO1-212ENST00000596309 GRIN2BQ13224 1484 aa32.8■■■□□ 2.84
FCHO1-212ENST00000596309 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
FCHO1-212ENST00000596309 KIF27Q86VH2 1401 aa32.7■■■□□ 2.83
FCHO1-212ENST00000596309 PBRM1Q86U86 1689 aa32.67■■■□□ 2.82
FCHO1-212ENST00000596309 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.66■■■□□ 2.82
FCHO1-212ENST00000596309 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.63■■■□□ 2.81
FCHO1-212ENST00000596309 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.57■■■□□ 2.8
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FCHO1-212ENST00000596309 OSCARQ8IYS5 282 aa32.53■■■□□ 2.8
FCHO1-212ENST00000596309 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
FCHO1-212ENST00000596309 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.5■■■□□ 2.79
FCHO1-212ENST00000596309 IGF1RP08069 1367 aa32.48■■■□□ 2.79
FCHO1-212ENST00000596309 ADAMTS12P58397 1594 aa32.46■■■□□ 2.79
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FCHO1-212ENST00000596309 CUL7Q14999 1698 aa32.4■■■□□ 2.78
FCHO1-212ENST00000596309 EEA1Q15075 1411 aa32.36■■■□□ 2.77
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FCHO1-212ENST00000596309 NUP160Q12769 1436 aa32.22■■■□□ 2.75
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FCHO1-212ENST00000596309 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.16■■■□□ 2.74
FCHO1-212ENST00000596309 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.16■■■□□ 2.74
FCHO1-212ENST00000596309 PRXQ9BXM0 1461 aa32.12■■■□□ 2.73
FCHO1-212ENST00000596309 CEP170Q5SW79 1584 aa32.11■■■□□ 2.73
FCHO1-212ENST00000596309 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.01■■■□□ 2.72
FCHO1-212ENST00000596309 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
FCHO1-212ENST00000596309 ARHGEF11O15085 1522 aa31.92■■■□□ 2.7
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