RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594202.5

FCHO1-206, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,214 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-206ENST00000594202 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.6■■■□□ 2.65
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FCHO1-206ENST00000594202 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
FCHO1-206ENST00000594202 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.77■■□□□ 1.88
FCHO1-206ENST00000594202 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
FCHO1-206ENST00000594202 ABCC9O60706 1549 aa25.78■■□□□ 1.72
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FCHO1-206ENST00000594202 SCRIBQ14160 1630 aa25.57■■□□□ 1.68
FCHO1-206ENST00000594202 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.53■■□□□ 1.68
FCHO1-206ENST00000594202 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.5■■□□□ 1.67
FCHO1-206ENST00000594202 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.29■■□□□ 1.64
FCHO1-206ENST00000594202 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.28■■□□□ 1.64
FCHO1-206ENST00000594202 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
FCHO1-206ENST00000594202 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
FCHO1-206ENST00000594202 CECR2Q9BXF3 1484 aa25■■□□□ 1.59
FCHO1-206ENST00000594202 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.97■■□□□ 1.59
FCHO1-206ENST00000594202 NACADO15069 1562 aa24.93■■□□□ 1.58
FCHO1-206ENST00000594202 TRIM41Q8WV44 630 aa24.91■■□□□ 1.58
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FCHO1-206ENST00000594202 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.82■■□□□ 1.56
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FCHO1-206ENST00000594202 WIZO95785 1651 aa24.6■■□□□ 1.53
FCHO1-206ENST00000594202 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
FCHO1-206ENST00000594202 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.38■■□□□ 1.49
FCHO1-206ENST00000594202 HRCP23327 699 aa24.37■■□□□ 1.49
FCHO1-206ENST00000594202 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
FCHO1-206ENST00000594202 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FCHO1-206ENST00000594202 ABCC8Q09428 1581 aa24.14■■□□□ 1.45
FCHO1-206ENST00000594202 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
FCHO1-206ENST00000594202 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.11■■□□□ 1.45
FCHO1-206ENST00000594202 SMARCA4P51532 1647 aa24.1■■□□□ 1.45
FCHO1-206ENST00000594202 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.1■■□□□ 1.45
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FCHO1-206ENST00000594202 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
FCHO1-206ENST00000594202 SMARCA2P51531 1590 aa23.9■■□□□ 1.42
FCHO1-206ENST00000594202 SOGA1O94964 1423 aa23.88■■□□□ 1.41
FCHO1-206ENST00000594202 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.81■■□□□ 1.4
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FCHO1-206ENST00000594202 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-206ENST00000594202 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-206ENST00000594202 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-206ENST00000594202 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-206ENST00000594202 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
FCHO1-206ENST00000594202 CEP162Q5TB80 1403 aa23.53■■□□□ 1.36
FCHO1-206ENST00000594202 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
FCHO1-206ENST00000594202 SYNJ1O43426 1573 aa23.44■■□□□ 1.34
FCHO1-206ENST00000594202 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.43■■□□□ 1.34
FCHO1-206ENST00000594202 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
FCHO1-206ENST00000594202 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-206ENST00000594202 GOLGA3Q08378 1498 aa23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-206ENST00000594202 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-206ENST00000594202 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.22■■□□□ 1.31
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FCHO1-206ENST00000594202 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.13■■□□□ 1.29
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FCHO1-206ENST00000594202 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
FCHO1-206ENST00000594202 ITGAEP38570 1179 aa23■■□□□ 1.27
FCHO1-206ENST00000594202 CUX1P39880 1505 aa23■■□□□ 1.27
FCHO1-206ENST00000594202 P3H3Q8IVL6 736 aa22.99■■□□□ 1.27
FCHO1-206ENST00000594202 TOP2BQ02880 1626 aa22.96■■□□□ 1.27
FCHO1-206ENST00000594202 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.95■■□□□ 1.27
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FCHO1-206ENST00000594202 CFTRP13569 1480 aa22.9■■□□□ 1.26
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FCHO1-206ENST00000594202 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.88■■□□□ 1.25
FCHO1-206ENST00000594202 KIF27Q86VH2 1401 aa22.87■■□□□ 1.25
FCHO1-206ENST00000594202 CUX2O14529 1486 aa22.87■■□□□ 1.25
FCHO1-206ENST00000594202 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.85■■□□□ 1.25
FCHO1-206ENST00000594202 NESP48681 1621 aa22.83■■□□□ 1.25
FCHO1-206ENST00000594202 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.76■■□□□ 1.23
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FCHO1-206ENST00000594202 ARAP1Q96P48 1450 aa22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-206ENST00000594202 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.72■■□□□ 1.23
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FCHO1-206ENST00000594202 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-206ENST00000594202 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-206ENST00000594202 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
FCHO1-206ENST00000594202 TOPBP1Q92547 1522 aa22.42■■□□□ 1.18
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FCHO1-206ENST00000594202 MIER1Q8N108 512 aa22.34■■□□□ 1.17
FCHO1-206ENST00000594202 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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