RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-231ENST00000600201 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.36■■■■□ 3.57
FCHO1-231ENST00000600201 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.49■■■□□ 2.95
FCHO1-231ENST00000600201 ABCC9O60706 1549 aa33.4■■■□□ 2.94
FCHO1-231ENST00000600201 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.74■■■□□ 2.67
FCHO1-231ENST00000600201 NACADO15069 1562 aa31.53■■■□□ 2.64
FCHO1-231ENST00000600201 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.4■■■□□ 2.62
FCHO1-231ENST00000600201 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.32■■■□□ 2.61
FCHO1-231ENST00000600201 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.24■■■□□ 2.59
FCHO1-231ENST00000600201 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.08■■■□□ 2.57
FCHO1-231ENST00000600201 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.08■■■□□ 2.57
FCHO1-231ENST00000600201 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
FCHO1-231ENST00000600201 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.98■■■□□ 2.55
FCHO1-231ENST00000600201 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.78■■■□□ 2.52
FCHO1-231ENST00000600201 SCRIBQ14160 1630 aa30.63■■■□□ 2.49
FCHO1-231ENST00000600201 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.29■■■□□ 2.44
FCHO1-231ENST00000600201 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.19■■■□□ 2.42
FCHO1-231ENST00000600201 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
FCHO1-231ENST00000600201 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.99■■■□□ 2.39
FCHO1-231ENST00000600201 SMARCA4P51532 1647 aa29.18■■■□□ 2.26
FCHO1-231ENST00000600201 NCAPD3P42695 1498 aa29.1■■■□□ 2.25
FCHO1-231ENST00000600201 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.1■■■□□ 2.25
FCHO1-231ENST00000600201 SMARCA2P51531 1590 aa28.96■■■□□ 2.23
FCHO1-231ENST00000600201 HMGXB3Q12766 1538 aa28.94■■■□□ 2.22
FCHO1-231ENST00000600201 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
FCHO1-231ENST00000600201 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.88■■■□□ 2.21
FCHO1-231ENST00000600201 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.82■■■□□ 2.2
FCHO1-231ENST00000600201 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
FCHO1-231ENST00000600201 NESP48681 1621 aa28.8■■■□□ 2.2
FCHO1-231ENST00000600201 ERCC6Q03468 1493 aa28.71■■■□□ 2.19
FCHO1-231ENST00000600201 WIZO95785 1651 aa28.6■■■□□ 2.17
FCHO1-231ENST00000600201 CUX2O14529 1486 aa28.59■■■□□ 2.17
FCHO1-231ENST00000600201 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.48■■■□□ 2.15
FCHO1-231ENST00000600201 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
FCHO1-231ENST00000600201 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.46■■■□□ 2.15
FCHO1-231ENST00000600201 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.39■■■□□ 2.14
FCHO1-231ENST00000600201 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
FCHO1-231ENST00000600201 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.21■■■□□ 2.11
FCHO1-231ENST00000600201 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.19■■■□□ 2.1
FCHO1-231ENST00000600201 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
FCHO1-231ENST00000600201 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.05■■■□□ 2.08
FCHO1-231ENST00000600201 WDR62O43379 1518 aa28.02■■■□□ 2.08
FCHO1-231ENST00000600201 CFTRP13569 1480 aa27.95■■■□□ 2.07
FCHO1-231ENST00000600201 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.95■■■□□ 2.07
FCHO1-231ENST00000600201 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.95■■■□□ 2.07
FCHO1-231ENST00000600201 PRDM2Q13029 1718 aa27.87■■■□□ 2.05
FCHO1-231ENST00000600201 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.81■■■□□ 2.04
FCHO1-231ENST00000600201 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
FCHO1-231ENST00000600201 TOPBP1Q92547 1522 aa27.48■■□□□ 1.99
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
FCHO1-231ENST00000600201 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.39■■□□□ 1.97
FCHO1-231ENST00000600201 IFT140Q96RY7 1462 aa27.36■■□□□ 1.97
FCHO1-231ENST00000600201 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
FCHO1-231ENST00000600201 TRIM41Q8WV44 630 aa27.3■■□□□ 1.96
FCHO1-231ENST00000600201 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
FCHO1-231ENST00000600201 ABCC8Q09428 1581 aa27.24■■□□□ 1.95
FCHO1-231ENST00000600201 OSCARQ8IYS5 282 aa27.22■■□□□ 1.95
FCHO1-231ENST00000600201 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
FCHO1-231ENST00000600201 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.948e-7■■■■■ 33.2
FCHO1-231ENST00000600201 CHD1O14646 1710 aa27.16■■□□□ 1.94
FCHO1-231ENST00000600201 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.16■■□□□ 1.94
FCHO1-231ENST00000600201 CUX1P39880 1505 aa27.11■■□□□ 1.93
FCHO1-231ENST00000600201 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.11■■□□□ 1.93
FCHO1-231ENST00000600201 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.11■■□□□ 1.93
FCHO1-231ENST00000600201 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.11■■□□□ 1.93
FCHO1-231ENST00000600201 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
FCHO1-231ENST00000600201 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.07■■□□□ 1.92
FCHO1-231ENST00000600201 SOGA1O94964 1423 aa27.01■■□□□ 1.91
FCHO1-231ENST00000600201 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
FCHO1-231ENST00000600201 WDR97A6NE52 1622 aa26.99■■□□□ 1.91
FCHO1-231ENST00000600201 ARHGEF11O15085 1522 aa26.97■■□□□ 1.91
FCHO1-231ENST00000600201 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.91■■□□□ 1.9
FCHO1-231ENST00000600201 PBRM1Q86U86 1689 aa26.86■■□□□ 1.89
FCHO1-231ENST00000600201 FBLN2P98095 1184 aa26.86■■□□□ 1.89
FCHO1-231ENST00000600201 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.77■■□□□ 1.88
FCHO1-231ENST00000600201 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.75■■□□□ 1.87
FCHO1-231ENST00000600201 GRIN2BQ13224 1484 aa26.75■■□□□ 1.87
FCHO1-231ENST00000600201 ARAP1Q96P48 1450 aa26.75■■□□□ 1.87
FCHO1-231ENST00000600201 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
FCHO1-231ENST00000600201 SYNJ1O43426 1573 aa26.73■■□□□ 1.87
FCHO1-231ENST00000600201 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.72■■□□□ 1.87
FCHO1-231ENST00000600201 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.71■■□□□ 1.87
FCHO1-231ENST00000600201 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.7■■□□□ 1.87
FCHO1-231ENST00000600201 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.67■■□□□ 1.86
FCHO1-231ENST00000600201 TOP2BQ02880 1626 aa26.67■■□□□ 1.86
FCHO1-231ENST00000600201 SYNJ2O15056 1496 aa26.67■■□□□ 1.86
FCHO1-231ENST00000600201 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
FCHO1-231ENST00000600201 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
FCHO1-231ENST00000600201 ADAMTS12P58397 1594 aa26.55■■□□□ 1.84
FCHO1-231ENST00000600201 CEP170Q5SW79 1584 aa26.48■■□□□ 1.83
FCHO1-231ENST00000600201 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.47■■□□□ 1.83
FCHO1-231ENST00000600201 GRIN2AQ12879 1464 aa26.47■■□□□ 1.83
FCHO1-231ENST00000600201 NUP160Q12769 1436 aa26.36■■□□□ 1.81
FCHO1-231ENST00000600201 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.35■■□□□ 1.81
FCHO1-231ENST00000600201 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.33■■□□□ 1.81
FCHO1-231ENST00000600201 SHROOM2Q13796 1616 aa26.31■■□□□ 1.8
FCHO1-231ENST00000600201 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
FCHO1-231ENST00000600201 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.19■■□□□ 1.78
FCHO1-231ENST00000600201 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
FCHO1-231ENST00000600201 CUL7Q14999 1698 aa26.05■■□□□ 1.76
FCHO1-231ENST00000600201 IGF1RP08069 1367 aa26.05■■□□□ 1.76
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