RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596865.5

FCHO1-217, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-217ENST00000596865 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.78■■■□□ 2.68
FCHO1-217ENST00000596865 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.12■■■□□ 2.09
FCHO1-217ENST00000596865 ABCC9O60706 1549 aa27.67■■■□□ 2.02
FCHO1-217ENST00000596865 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.7■■□□□ 1.86
FCHO1-217ENST00000596865 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
FCHO1-217ENST00000596865 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.46■■□□□ 1.83
FCHO1-217ENST00000596865 NACADO15069 1562 aa26.41■■□□□ 1.82
FCHO1-217ENST00000596865 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.18■■□□□ 1.78
FCHO1-217ENST00000596865 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.14■■□□□ 1.78
FCHO1-217ENST00000596865 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.05■■□□□ 1.76
FCHO1-217ENST00000596865 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
FCHO1-217ENST00000596865 SCRIBQ14160 1630 aa25.88■■□□□ 1.73
FCHO1-217ENST00000596865 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.81■■□□□ 1.72
FCHO1-217ENST00000596865 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.45■■□□□ 1.66
FCHO1-217ENST00000596865 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.4■■□□□ 1.66
FCHO1-217ENST00000596865 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
FCHO1-217ENST00000596865 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.97■■□□□ 1.59
FCHO1-217ENST00000596865 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.9■■□□□ 1.58
FCHO1-217ENST00000596865 SMARCA4P51532 1647 aa24.67■■□□□ 1.54
FCHO1-217ENST00000596865 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.6■■□□□ 1.53
FCHO1-217ENST00000596865 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
FCHO1-217ENST00000596865 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.5■■□□□ 1.51
FCHO1-217ENST00000596865 NCAPD3P42695 1498 aa24.4■■□□□ 1.5
FCHO1-217ENST00000596865 SMARCA2P51531 1590 aa24.37■■□□□ 1.49
FCHO1-217ENST00000596865 WIZO95785 1651 aa24.37■■□□□ 1.49
FCHO1-217ENST00000596865 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.32■■□□□ 1.48
FCHO1-217ENST00000596865 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
FCHO1-217ENST00000596865 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
FCHO1-217ENST00000596865 HMGXB3Q12766 1538 aa24.26■■□□□ 1.47
FCHO1-217ENST00000596865 NESP48681 1621 aa24.02■■□□□ 1.44
FCHO1-217ENST00000596865 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
FCHO1-217ENST00000596865 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
FCHO1-217ENST00000596865 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-217ENST00000596865 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.74■■□□□ 1.39
FCHO1-217ENST00000596865 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-217ENST00000596865 ERCC6Q03468 1493 aa23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-217ENST00000596865 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-217ENST00000596865 CFTRP13569 1480 aa23.6■■□□□ 1.37
FCHO1-217ENST00000596865 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.55■■□□□ 1.36
FCHO1-217ENST00000596865 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
FCHO1-217ENST00000596865 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.49■■□□□ 1.35
FCHO1-217ENST00000596865 CUX2O14529 1486 aa23.43■■□□□ 1.34
FCHO1-217ENST00000596865 PRDM2Q13029 1718 aa23.42■■□□□ 1.34
FCHO1-217ENST00000596865 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.42■■□□□ 1.34
FCHO1-217ENST00000596865 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.37■■□□□ 1.33
FCHO1-217ENST00000596865 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
FCHO1-217ENST00000596865 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-217ENST00000596865 WDR62O43379 1518 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-217ENST00000596865 TOPBP1Q92547 1522 aa23.14■■□□□ 1.3
FCHO1-217ENST00000596865 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-217ENST00000596865 CUX1P39880 1505 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-217ENST00000596865 ABCC8Q09428 1581 aa23.02■■□□□ 1.28
FCHO1-217ENST00000596865 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
FCHO1-217ENST00000596865 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
FCHO1-217ENST00000596865 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.96■■□□□ 1.27
FCHO1-217ENST00000596865 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.93■■□□□ 1.26
FCHO1-217ENST00000596865 IFT140Q96RY7 1462 aa22.9■■□□□ 1.26
FCHO1-217ENST00000596865 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
FCHO1-217ENST00000596865 SYNJ1O43426 1573 aa22.89■■□□□ 1.26
FCHO1-217ENST00000596865 SOGA1O94964 1423 aa22.85■■□□□ 1.25
FCHO1-217ENST00000596865 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
FCHO1-217ENST00000596865 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.255e-7■■■■■ 30.4
FCHO1-217ENST00000596865 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
FCHO1-217ENST00000596865 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
FCHO1-217ENST00000596865 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.79■■□□□ 1.24
FCHO1-217ENST00000596865 TOP2BQ02880 1626 aa22.79■■□□□ 1.24
FCHO1-217ENST00000596865 WDR97A6NE52 1622 aa22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-217ENST00000596865 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-217ENST00000596865 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-217ENST00000596865 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.57■■□□□ 1.2
FCHO1-217ENST00000596865 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.57■■□□□ 1.2
FCHO1-217ENST00000596865 PBRM1Q86U86 1689 aa22.57■■□□□ 1.2
FCHO1-217ENST00000596865 CHD1O14646 1710 aa22.55■■□□□ 1.2
FCHO1-217ENST00000596865 FBLN2P98095 1184 aa22.55■■□□□ 1.2
FCHO1-217ENST00000596865 GRIN2BQ13224 1484 aa22.52■■□□□ 1.2
FCHO1-217ENST00000596865 OSCARQ8IYS5 282 aa22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-217ENST00000596865 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-217ENST00000596865 TRIM41Q8WV44 630 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-217ENST00000596865 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-217ENST00000596865 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-217ENST00000596865 SYNJ2O15056 1496 aa22.36■■□□□ 1.17
FCHO1-217ENST00000596865 ADAMTS12P58397 1594 aa22.36■■□□□ 1.17
FCHO1-217ENST00000596865 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-217ENST00000596865 KIF27Q86VH2 1401 aa22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-217ENST00000596865 IGF1RP08069 1367 aa22.3■■□□□ 1.16
FCHO1-217ENST00000596865 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.27■■□□□ 1.16
FCHO1-217ENST00000596865 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.27■■□□□ 1.16
FCHO1-217ENST00000596865 GRIN2AQ12879 1464 aa22.27■■□□□ 1.16
FCHO1-217ENST00000596865 CEP170Q5SW79 1584 aa22.23■■□□□ 1.15
FCHO1-217ENST00000596865 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.22■■□□□ 1.15
FCHO1-217ENST00000596865 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.2■■□□□ 1.14
FCHO1-217ENST00000596865 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.2■■□□□ 1.14
FCHO1-217ENST00000596865 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.2■■□□□ 1.14
FCHO1-217ENST00000596865 ARHGEF11O15085 1522 aa22.16■■□□□ 1.14
FCHO1-217ENST00000596865 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.15■■□□□ 1.14
FCHO1-217ENST00000596865 NUP160Q12769 1436 aa22.14■■□□□ 1.14
FCHO1-217ENST00000596865 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
FCHO1-217ENST00000596865 CUL7Q14999 1698 aa22.14■■□□□ 1.13
FCHO1-217ENST00000596865 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.1■■□□□ 1.13
FCHO1-217ENST00000596865 ARAP1Q96P48 1450 aa22.03■■□□□ 1.12
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