RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598067.5

FCHO1-223, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-223ENST00000598067 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.79■■■□□ 2.84
FCHO1-223ENST00000598067 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.49■■■□□ 2.31
FCHO1-223ENST00000598067 ABCC9O60706 1549 aa29.45■■■□□ 2.31
FCHO1-223ENST00000598067 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.01■■■□□ 2.07
FCHO1-223ENST00000598067 NACADO15069 1562 aa27.77■■■□□ 2.04
FCHO1-223ENST00000598067 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.74■■■□□ 2.03
FCHO1-223ENST00000598067 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.62■■■□□ 2.01
FCHO1-223ENST00000598067 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.47■■□□□ 1.99
FCHO1-223ENST00000598067 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.38■■□□□ 1.97
FCHO1-223ENST00000598067 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.27■■□□□ 1.96
FCHO1-223ENST00000598067 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.21■■□□□ 1.95
FCHO1-223ENST00000598067 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
FCHO1-223ENST00000598067 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27■■□□□ 1.91
FCHO1-223ENST00000598067 SCRIBQ14160 1630 aa26.98■■□□□ 1.91
FCHO1-223ENST00000598067 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.67■■□□□ 1.86
FCHO1-223ENST00000598067 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.62■■□□□ 1.85
FCHO1-223ENST00000598067 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
FCHO1-223ENST00000598067 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.45■■□□□ 1.82
FCHO1-223ENST00000598067 SMARCA4P51532 1647 aa25.66■■□□□ 1.7
FCHO1-223ENST00000598067 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.56■■□□□ 1.68
FCHO1-223ENST00000598067 NCAPD3P42695 1498 aa25.55■■□□□ 1.68
FCHO1-223ENST00000598067 SMARCA2P51531 1590 aa25.52■■□□□ 1.68
FCHO1-223ENST00000598067 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
FCHO1-223ENST00000598067 HMGXB3Q12766 1538 aa25.46■■□□□ 1.67
FCHO1-223ENST00000598067 ERCC6Q03468 1493 aa25.4■■□□□ 1.66
FCHO1-223ENST00000598067 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
FCHO1-223ENST00000598067 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.33■■□□□ 1.65
FCHO1-223ENST00000598067 NESP48681 1621 aa25.33■■□□□ 1.65
FCHO1-223ENST00000598067 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.3■■□□□ 1.64
FCHO1-223ENST00000598067 CUX2O14529 1486 aa25.23■■□□□ 1.63
FCHO1-223ENST00000598067 WIZO95785 1651 aa25.14■■□□□ 1.62
FCHO1-223ENST00000598067 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.13■■□□□ 1.61
FCHO1-223ENST00000598067 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.1■■□□□ 1.61
FCHO1-223ENST00000598067 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.09■■□□□ 1.61
FCHO1-223ENST00000598067 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
FCHO1-223ENST00000598067 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.86■■□□□ 1.57
FCHO1-223ENST00000598067 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.8■■□□□ 1.56
FCHO1-223ENST00000598067 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
FCHO1-223ENST00000598067 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
FCHO1-223ENST00000598067 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.71■■□□□ 1.55
FCHO1-223ENST00000598067 WDR62O43379 1518 aa24.66■■□□□ 1.54
FCHO1-223ENST00000598067 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.65■■□□□ 1.54
FCHO1-223ENST00000598067 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.62■■□□□ 1.53
FCHO1-223ENST00000598067 PRDM2Q13029 1718 aa24.61■■□□□ 1.53
FCHO1-223ENST00000598067 CFTRP13569 1480 aa24.55■■□□□ 1.52
FCHO1-223ENST00000598067 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
FCHO1-223ENST00000598067 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.4■■□□□ 1.5
FCHO1-223ENST00000598067 TRIM41Q8WV44 630 aa24.21■■□□□ 1.47
FCHO1-223ENST00000598067 TOPBP1Q92547 1522 aa24.17■■□□□ 1.46
FCHO1-223ENST00000598067 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
FCHO1-223ENST00000598067 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.11■■□□□ 1.45
FCHO1-223ENST00000598067 IFT140Q96RY7 1462 aa24.1■■□□□ 1.45
FCHO1-223ENST00000598067 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
FCHO1-223ENST00000598067 OSCARQ8IYS5 282 aa24.05■■□□□ 1.44
FCHO1-223ENST00000598067 ABCC8Q09428 1581 aa24.02■■□□□ 1.44
FCHO1-223ENST00000598067 CHD1O14646 1710 aa23.99■■□□□ 1.43
FCHO1-223ENST00000598067 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
FCHO1-223ENST00000598067 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.94■■□□□ 1.42
FCHO1-223ENST00000598067 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.94■■□□□ 1.42
FCHO1-223ENST00000598067 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.94■■□□□ 1.42
FCHO1-223ENST00000598067 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
FCHO1-223ENST00000598067 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.421e-6■■■■■ 29.9
FCHO1-223ENST00000598067 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.87■■□□□ 1.41
FCHO1-223ENST00000598067 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-223ENST00000598067 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-223ENST00000598067 CUX1P39880 1505 aa23.8■■□□□ 1.4
FCHO1-223ENST00000598067 ARHGEF11O15085 1522 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-223ENST00000598067 SOGA1O94964 1423 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-223ENST00000598067 FBLN2P98095 1184 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-223ENST00000598067 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-223ENST00000598067 WDR97A6NE52 1622 aa23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-223ENST00000598067 PBRM1Q86U86 1689 aa23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-223ENST00000598067 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-223ENST00000598067 GRIN2BQ13224 1484 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-223ENST00000598067 ARAP1Q96P48 1450 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-223ENST00000598067 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-223ENST00000598067 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
FCHO1-223ENST00000598067 SYNJ1O43426 1573 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-223ENST00000598067 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-223ENST00000598067 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.53■■□□□ 1.36
FCHO1-223ENST00000598067 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.51■■□□□ 1.35
FCHO1-223ENST00000598067 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
FCHO1-223ENST00000598067 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.48■■□□□ 1.35
FCHO1-223ENST00000598067 SYNJ2O15056 1496 aa23.48■■□□□ 1.35
FCHO1-223ENST00000598067 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.47■■□□□ 1.35
FCHO1-223ENST00000598067 TOP2BQ02880 1626 aa23.43■■□□□ 1.34
FCHO1-223ENST00000598067 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
FCHO1-223ENST00000598067 ADAMTS12P58397 1594 aa23.36■■□□□ 1.33
FCHO1-223ENST00000598067 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
FCHO1-223ENST00000598067 GRIN2AQ12879 1464 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-223ENST00000598067 CEP170Q5SW79 1584 aa23.28■■□□□ 1.32
FCHO1-223ENST00000598067 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-223ENST00000598067 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.19■■□□□ 1.3
FCHO1-223ENST00000598067 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.16■■□□□ 1.3
FCHO1-223ENST00000598067 NUP160Q12769 1436 aa23.15■■□□□ 1.3
FCHO1-223ENST00000598067 SHROOM2Q13796 1616 aa23.14■■□□□ 1.29
FCHO1-223ENST00000598067 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.03■■□□□ 1.28
FCHO1-223ENST00000598067 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
FCHO1-223ENST00000598067 CUL7Q14999 1698 aa22.96■■□□□ 1.27
FCHO1-223ENST00000598067 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.2 ms