RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601247.5

FCHO1-235, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 458 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-235ENST00000601247 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.58■■■■□ 3.29
FCHO1-235ENST00000601247 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.37■■■□□ 2.61
FCHO1-235ENST00000601247 ABCC9O60706 1549 aa30.11■■■□□ 2.41
FCHO1-235ENST00000601247 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
FCHO1-235ENST00000601247 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.65■■■□□ 2.34
FCHO1-235ENST00000601247 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.45■■■□□ 2.31
FCHO1-235ENST00000601247 NACADO15069 1562 aa29.35■■■□□ 2.29
FCHO1-235ENST00000601247 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.34■■■□□ 2.29
FCHO1-235ENST00000601247 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.26■■■□□ 2.27
FCHO1-235ENST00000601247 SCRIBQ14160 1630 aa28.71■■■□□ 2.19
FCHO1-235ENST00000601247 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.61■■■□□ 2.17
FCHO1-235ENST00000601247 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.47■■■□□ 2.15
FCHO1-235ENST00000601247 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.25■■■□□ 2.11
FCHO1-235ENST00000601247 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.22■■■□□ 2.11
FCHO1-235ENST00000601247 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.62■■■□□ 2.01
FCHO1-235ENST00000601247 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
FCHO1-235ENST00000601247 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
FCHO1-235ENST00000601247 SMARCA4P51532 1647 aa27.49■■□□□ 1.99
FCHO1-235ENST00000601247 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.43■■□□□ 1.98
FCHO1-235ENST00000601247 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
FCHO1-235ENST00000601247 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
FCHO1-235ENST00000601247 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.22■■□□□ 1.95
FCHO1-235ENST00000601247 SMARCA2P51531 1590 aa27.22■■□□□ 1.95
FCHO1-235ENST00000601247 WIZO95785 1651 aa27.17■■□□□ 1.94
FCHO1-235ENST00000601247 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.16■■□□□ 1.94
FCHO1-235ENST00000601247 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.15■■□□□ 1.94
FCHO1-235ENST00000601247 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
FCHO1-235ENST00000601247 NCAPD3P42695 1498 aa27.04■■□□□ 1.92
FCHO1-235ENST00000601247 HMGXB3Q12766 1538 aa26.99■■□□□ 1.91
FCHO1-235ENST00000601247 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
FCHO1-235ENST00000601247 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.91■■□□□ 1.9
FCHO1-235ENST00000601247 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.62■■□□□ 1.85
FCHO1-235ENST00000601247 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.33■■□□□ 1.8
FCHO1-235ENST00000601247 CFTRP13569 1480 aa26.28■■□□□ 1.8
FCHO1-235ENST00000601247 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.27■■□□□ 1.8
FCHO1-235ENST00000601247 NESP48681 1621 aa26.19■■□□□ 1.78
FCHO1-235ENST00000601247 PRDM2Q13029 1718 aa26.13■■□□□ 1.77
FCHO1-235ENST00000601247 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.12■■□□□ 1.77
FCHO1-235ENST00000601247 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.04■■□□□ 1.76
FCHO1-235ENST00000601247 ERCC6Q03468 1493 aa25.98■■□□□ 1.75
FCHO1-235ENST00000601247 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.98■■□□□ 1.75
FCHO1-235ENST00000601247 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.9■■□□□ 1.74
FCHO1-235ENST00000601247 ABCC8Q09428 1581 aa25.86■■□□□ 1.73
FCHO1-235ENST00000601247 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
FCHO1-235ENST00000601247 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.79■■□□□ 1.72
FCHO1-235ENST00000601247 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.77■■□□□ 1.72
FCHO1-235ENST00000601247 TRIM41Q8WV44 630 aa25.76■■□□□ 1.71
FCHO1-235ENST00000601247 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.72■■□□□ 1.71
FCHO1-235ENST00000601247 CUX1P39880 1505 aa25.69■■□□□ 1.7
FCHO1-235ENST00000601247 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
FCHO1-235ENST00000601247 SYNJ1O43426 1573 aa25.68■■□□□ 1.7
FCHO1-235ENST00000601247 TOPBP1Q92547 1522 aa25.68■■□□□ 1.7
FCHO1-235ENST00000601247 TOP2BQ02880 1626 aa25.67■■□□□ 1.7
FCHO1-235ENST00000601247 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.65■■□□□ 1.7
FCHO1-235ENST00000601247 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
FCHO1-235ENST00000601247 WDR62O43379 1518 aa25.63■■□□□ 1.69
FCHO1-235ENST00000601247 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.55■■□□□ 1.68
FCHO1-235ENST00000601247 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
FCHO1-235ENST00000601247 SOGA1O94964 1423 aa25.45■■□□□ 1.66
FCHO1-235ENST00000601247 CUX2O14529 1486 aa25.4■■□□□ 1.66
FCHO1-235ENST00000601247 IFT140Q96RY7 1462 aa25.39■■□□□ 1.65
FCHO1-235ENST00000601247 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.38■■□□□ 1.65
FCHO1-235ENST00000601247 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.31■■□□□ 1.64
FCHO1-235ENST00000601247 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
FCHO1-235ENST00000601247 KIF27Q86VH2 1401 aa25.28■■□□□ 1.64
FCHO1-235ENST00000601247 WDR97A6NE52 1622 aa25.24■■□□□ 1.63
FCHO1-235ENST00000601247 EEA1Q15075 1411 aa25.24■■□□□ 1.63
FCHO1-235ENST00000601247 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
FCHO1-235ENST00000601247 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
FCHO1-235ENST00000601247 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.16■■□□□ 1.62
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
FCHO1-235ENST00000601247 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.14■■□□□ 1.62
FCHO1-235ENST00000601247 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.13■■□□□ 1.61
FCHO1-235ENST00000601247 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.619e-7■■■■■ 30.5
FCHO1-235ENST00000601247 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
FCHO1-235ENST00000601247 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.09■■□□□ 1.61
FCHO1-235ENST00000601247 GRIN2BQ13224 1484 aa25.08■■□□□ 1.6
FCHO1-235ENST00000601247 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.04■■□□□ 1.6
FCHO1-235ENST00000601247 PBRM1Q86U86 1689 aa25.04■■□□□ 1.6
FCHO1-235ENST00000601247 IGF1RP08069 1367 aa25.01■■□□□ 1.59
FCHO1-235ENST00000601247 CUL7Q14999 1698 aa24.97■■□□□ 1.59
FCHO1-235ENST00000601247 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.95■■□□□ 1.58
FCHO1-235ENST00000601247 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.93■■□□□ 1.58
FCHO1-235ENST00000601247 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
FCHO1-235ENST00000601247 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.9■■□□□ 1.58
FCHO1-235ENST00000601247 ADAMTS12P58397 1594 aa24.88■■□□□ 1.57
FCHO1-235ENST00000601247 KIF21BO75037 1637 aa24.87■■□□□ 1.57
FCHO1-235ENST00000601247 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.87■■□□□ 1.57
FCHO1-235ENST00000601247 PRXQ9BXM0 1461 aa24.87■■□□□ 1.57
FCHO1-235ENST00000601247 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.86■■□□□ 1.57
FCHO1-235ENST00000601247 GOLGA3Q08378 1498 aa24.84■■□□□ 1.57
FCHO1-235ENST00000601247 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
FCHO1-235ENST00000601247 FBLN2P98095 1184 aa24.83■■□□□ 1.57
FCHO1-235ENST00000601247 SYNJ2O15056 1496 aa24.83■■□□□ 1.56
FCHO1-235ENST00000601247 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
FCHO1-235ENST00000601247 GRIN2AQ12879 1464 aa24.73■■□□□ 1.55
FCHO1-235ENST00000601247 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.72■■□□□ 1.55
FCHO1-235ENST00000601247 CHD1O14646 1710 aa24.66■■□□□ 1.54
FCHO1-235ENST00000601247 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.61■■□□□ 1.53
FCHO1-235ENST00000601247 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.2 ms