RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593833.5

FCHO1-203, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-203ENST00000593833 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.54■■■□□ 2.8
FCHO1-203ENST00000593833 ABCC9O60706 1549 aa29.3■■■□□ 2.28
FCHO1-203ENST00000593833 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.25■■■□□ 2.27
FCHO1-203ENST00000593833 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.89■■■□□ 2.05
FCHO1-203ENST00000593833 NACADO15069 1562 aa27.67■■■□□ 2.02
FCHO1-203ENST00000593833 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.57■■■□□ 2
FCHO1-203ENST00000593833 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.45■■□□□ 1.98
FCHO1-203ENST00000593833 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
FCHO1-203ENST00000593833 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.24■■□□□ 1.95
FCHO1-203ENST00000593833 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.2■■□□□ 1.94
FCHO1-203ENST00000593833 BICRAQ9NZM4 1560 aa27■■□□□ 1.91
FCHO1-203ENST00000593833 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
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FCHO1-203ENST00000593833 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.7■■□□□ 1.87
FCHO1-203ENST00000593833 SCRIBQ14160 1630 aa26.67■■□□□ 1.86
FCHO1-203ENST00000593833 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.46■■□□□ 1.83
FCHO1-203ENST00000593833 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.42■■□□□ 1.82
FCHO1-203ENST00000593833 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
FCHO1-203ENST00000593833 NCAPD3P42695 1498 aa25.51■■□□□ 1.67
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FCHO1-203ENST00000593833 SMARCA4P51532 1647 aa25.41■■□□□ 1.66
FCHO1-203ENST00000593833 SMARCA2P51531 1590 aa25.4■■□□□ 1.66
FCHO1-203ENST00000593833 ERCC6Q03468 1493 aa25.37■■□□□ 1.65
FCHO1-203ENST00000593833 HMGXB3Q12766 1538 aa25.34■■□□□ 1.65
FCHO1-203ENST00000593833 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.3■■□□□ 1.64
FCHO1-203ENST00000593833 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
FCHO1-203ENST00000593833 CUX2O14529 1486 aa25.29■■□□□ 1.64
FCHO1-203ENST00000593833 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
FCHO1-203ENST00000593833 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.14■■□□□ 1.61
FCHO1-203ENST00000593833 NESP48681 1621 aa25.13■■□□□ 1.61
FCHO1-203ENST00000593833 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.06■■□□□ 1.6
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FCHO1-203ENST00000593833 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
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FCHO1-203ENST00000593833 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.82■■□□□ 1.56
FCHO1-203ENST00000593833 WIZO95785 1651 aa24.78■■□□□ 1.56
FCHO1-203ENST00000593833 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.76■■□□□ 1.55
FCHO1-203ENST00000593833 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.64■■□□□ 1.53
FCHO1-203ENST00000593833 WDR62O43379 1518 aa24.56■■□□□ 1.52
FCHO1-203ENST00000593833 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.54■■□□□ 1.52
FCHO1-203ENST00000593833 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
FCHO1-203ENST00000593833 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.49■■□□□ 1.51
FCHO1-203ENST00000593833 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
FCHO1-203ENST00000593833 CFTRP13569 1480 aa24.45■■□□□ 1.51
FCHO1-203ENST00000593833 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
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FCHO1-203ENST00000593833 PRDM2Q13029 1718 aa24.23■■□□□ 1.47
FCHO1-203ENST00000593833 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.18■■□□□ 1.46
FCHO1-203ENST00000593833 OSCARQ8IYS5 282 aa24.14■■□□□ 1.45
FCHO1-203ENST00000593833 IFT140Q96RY7 1462 aa24.05■■□□□ 1.44
FCHO1-203ENST00000593833 TOPBP1Q92547 1522 aa24■■□□□ 1.43
FCHO1-203ENST00000593833 ABCC8Q09428 1581 aa23.99■■□□□ 1.43
FCHO1-203ENST00000593833 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
FCHO1-203ENST00000593833 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.93■■□□□ 1.42
FCHO1-203ENST00000593833 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
FCHO1-203ENST00000593833 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-203ENST00000593833 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-203ENST00000593833 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-203ENST00000593833 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
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FCHO1-203ENST00000593833 ARHGEF11O15085 1522 aa23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-203ENST00000593833 CHD1O14646 1710 aa23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-203ENST00000593833 FBLN2P98095 1184 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-203ENST00000593833 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-203ENST00000593833 SOGA1O94964 1423 aa23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-203ENST00000593833 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-203ENST00000593833 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-203ENST00000593833 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.58■■□□□ 1.37
FCHO1-203ENST00000593833 WDR97A6NE52 1622 aa23.58■■□□□ 1.36
FCHO1-203ENST00000593833 CUX1P39880 1505 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-203ENST00000593833 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.55■■□□□ 1.36
FCHO1-203ENST00000593833 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
FCHO1-203ENST00000593833 GRIN2BQ13224 1484 aa23.48■■□□□ 1.35
FCHO1-203ENST00000593833 ARAP1Q96P48 1450 aa23.48■■□□□ 1.35
FCHO1-203ENST00000593833 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
FCHO1-203ENST00000593833 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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FCHO1-203ENST00000593833 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.4■■□□□ 1.34
FCHO1-203ENST00000593833 SYNJ2O15056 1496 aa23.4■■□□□ 1.34
FCHO1-203ENST00000593833 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.38■■□□□ 1.33
FCHO1-203ENST00000593833 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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FCHO1-203ENST00000593833 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.33■■□□□ 1.33
FCHO1-203ENST00000593833 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-203ENST00000593833 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
FCHO1-203ENST00000593833 TOP2BQ02880 1626 aa23.19■■□□□ 1.3
FCHO1-203ENST00000593833 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.19■■□□□ 1.3
FCHO1-203ENST00000593833 GRIN2AQ12879 1464 aa23.16■■□□□ 1.3
FCHO1-203ENST00000593833 ADAMTS12P58397 1594 aa23.14■■□□□ 1.3
FCHO1-203ENST00000593833 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-203ENST00000593833 CEP170Q5SW79 1584 aa23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-203ENST00000593833 NUP160Q12769 1436 aa23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-203ENST00000593833 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-203ENST00000593833 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-203ENST00000593833 SHROOM2Q13796 1616 aa22.97■■□□□ 1.27
FCHO1-203ENST00000593833 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
FCHO1-203ENST00000593833 JPH4Q96JJ6 628 aa22.85■■□□□ 1.25
FCHO1-203ENST00000593833 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.82■■□□□ 1.24
FCHO1-203ENST00000593833 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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