RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594068.5

FCHO1-205, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 841 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-205ENST00000594068 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.13■■■■□ 3.05
FCHO1-205ENST00000594068 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.29■■■□□ 2.44
FCHO1-205ENST00000594068 ABCC9O60706 1549 aa29.65■■■□□ 2.34
FCHO1-205ENST00000594068 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.64■■■□□ 2.18
FCHO1-205ENST00000594068 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.51■■■□□ 2.15
FCHO1-205ENST00000594068 NACADO15069 1562 aa28.46■■■□□ 2.15
FCHO1-205ENST00000594068 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
FCHO1-205ENST00000594068 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.26■■■□□ 2.11
FCHO1-205ENST00000594068 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.19■■■□□ 2.1
FCHO1-205ENST00000594068 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.81■■■□□ 2.04
FCHO1-205ENST00000594068 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.74■■■□□ 2.03
FCHO1-205ENST00000594068 SCRIBQ14160 1630 aa27.74■■■□□ 2.03
FCHO1-205ENST00000594068 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.59■■■□□ 2.01
FCHO1-205ENST00000594068 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.31■■□□□ 1.96
FCHO1-205ENST00000594068 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.06■■□□□ 1.92
FCHO1-205ENST00000594068 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
FCHO1-205ENST00000594068 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.78■■□□□ 1.88
FCHO1-205ENST00000594068 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.61■■□□□ 1.85
FCHO1-205ENST00000594068 SMARCA4P51532 1647 aa26.48■■□□□ 1.83
FCHO1-205ENST00000594068 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
FCHO1-205ENST00000594068 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.32■■□□□ 1.8
FCHO1-205ENST00000594068 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.3■■□□□ 1.8
FCHO1-205ENST00000594068 SMARCA2P51531 1590 aa26.29■■□□□ 1.8
FCHO1-205ENST00000594068 NCAPD3P42695 1498 aa26.24■■□□□ 1.79
FCHO1-205ENST00000594068 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.16■■□□□ 1.78
FCHO1-205ENST00000594068 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
FCHO1-205ENST00000594068 HMGXB3Q12766 1538 aa26.14■■□□□ 1.78
FCHO1-205ENST00000594068 WIZO95785 1651 aa26.05■■□□□ 1.76
FCHO1-205ENST00000594068 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
FCHO1-205ENST00000594068 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
FCHO1-205ENST00000594068 NESP48681 1621 aa25.66■■□□□ 1.7
FCHO1-205ENST00000594068 ERCC6Q03468 1493 aa25.59■■□□□ 1.69
FCHO1-205ENST00000594068 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
FCHO1-205ENST00000594068 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.56■■□□□ 1.68
FCHO1-205ENST00000594068 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.53■■□□□ 1.68
FCHO1-205ENST00000594068 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.47■■□□□ 1.67
FCHO1-205ENST00000594068 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.43■■□□□ 1.66
FCHO1-205ENST00000594068 CFTRP13569 1480 aa25.37■■□□□ 1.65
FCHO1-205ENST00000594068 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.34■■□□□ 1.65
FCHO1-205ENST00000594068 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.26■■□□□ 1.63
FCHO1-205ENST00000594068 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.23■■□□□ 1.63
FCHO1-205ENST00000594068 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
FCHO1-205ENST00000594068 CUX2O14529 1486 aa25.2■■□□□ 1.62
FCHO1-205ENST00000594068 PRDM2Q13029 1718 aa25.17■■□□□ 1.62
FCHO1-205ENST00000594068 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.16■■□□□ 1.62
FCHO1-205ENST00000594068 WDR62O43379 1518 aa25.05■■□□□ 1.6
FCHO1-205ENST00000594068 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
FCHO1-205ENST00000594068 TOPBP1Q92547 1522 aa24.85■■□□□ 1.57
FCHO1-205ENST00000594068 ABCC8Q09428 1581 aa24.84■■□□□ 1.57
FCHO1-205ENST00000594068 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.83■■□□□ 1.57
FCHO1-205ENST00000594068 CUX1P39880 1505 aa24.69■■□□□ 1.54
FCHO1-205ENST00000594068 IFT140Q96RY7 1462 aa24.68■■□□□ 1.54
FCHO1-205ENST00000594068 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
FCHO1-205ENST00000594068 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.62■■□□□ 1.53
FCHO1-205ENST00000594068 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
FCHO1-205ENST00000594068 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.57■■□□□ 1.52
FCHO1-205ENST00000594068 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
FCHO1-205ENST00000594068 SOGA1O94964 1423 aa24.56■■□□□ 1.52
FCHO1-205ENST00000594068 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
FCHO1-205ENST00000594068 SYNJ1O43426 1573 aa24.51■■□□□ 1.51
FCHO1-205ENST00000594068 TOP2BQ02880 1626 aa24.49■■□□□ 1.51
FCHO1-205ENST00000594068 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
FCHO1-205ENST00000594068 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.47■■□□□ 1.51
FCHO1-205ENST00000594068 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.47■■□□□ 1.51
FCHO1-205ENST00000594068 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.58e-7■■■■■ 27.6
FCHO1-205ENST00000594068 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
FCHO1-205ENST00000594068 WDR97A6NE52 1622 aa24.35■■□□□ 1.49
FCHO1-205ENST00000594068 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.35■■□□□ 1.49
FCHO1-205ENST00000594068 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.28■■□□□ 1.48
FCHO1-205ENST00000594068 GRIN2BQ13224 1484 aa24.26■■□□□ 1.47
FCHO1-205ENST00000594068 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.25■■□□□ 1.47
FCHO1-205ENST00000594068 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.24■■□□□ 1.47
FCHO1-205ENST00000594068 FBLN2P98095 1184 aa24.23■■□□□ 1.47
FCHO1-205ENST00000594068 PBRM1Q86U86 1689 aa24.21■■□□□ 1.47
FCHO1-205ENST00000594068 OSCARQ8IYS5 282 aa24.2■■□□□ 1.46
FCHO1-205ENST00000594068 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
FCHO1-205ENST00000594068 CHD1O14646 1710 aa24.15■■□□□ 1.46
FCHO1-205ENST00000594068 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
FCHO1-205ENST00000594068 TRIM41Q8WV44 630 aa24.12■■□□□ 1.45
FCHO1-205ENST00000594068 SYNJ2O15056 1496 aa24.09■■□□□ 1.45
FCHO1-205ENST00000594068 KIF27Q86VH2 1401 aa24.08■■□□□ 1.44
FCHO1-205ENST00000594068 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.06■■□□□ 1.44
FCHO1-205ENST00000594068 ADAMTS12P58397 1594 aa24.03■■□□□ 1.44
FCHO1-205ENST00000594068 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24■■□□□ 1.43
FCHO1-205ENST00000594068 GRIN2AQ12879 1464 aa23.94■■□□□ 1.42
FCHO1-205ENST00000594068 IGF1RP08069 1367 aa23.92■■□□□ 1.42
FCHO1-205ENST00000594068 CUL7Q14999 1698 aa23.88■■□□□ 1.41
FCHO1-205ENST00000594068 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-205ENST00000594068 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.85■■□□□ 1.41
FCHO1-205ENST00000594068 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-205ENST00000594068 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-205ENST00000594068 CEP170Q5SW79 1584 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-205ENST00000594068 NUP160Q12769 1436 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-205ENST00000594068 ARHGEF11O15085 1522 aa23.8■■□□□ 1.4
FCHO1-205ENST00000594068 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-205ENST00000594068 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-205ENST00000594068 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-205ENST00000594068 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-205ENST00000594068 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-205ENST00000594068 EEA1Q15075 1411 aa23.65■■□□□ 1.38
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