RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598086.5

FCHO1-224, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-224ENST00000598086 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.66■■■□□ 2.98
FCHO1-224ENST00000598086 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.05■■■□□ 2.4
FCHO1-224ENST00000598086 ABCC9O60706 1549 aa30■■■□□ 2.39
FCHO1-224ENST00000598086 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.56■■■□□ 2.16
FCHO1-224ENST00000598086 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.41■■■□□ 2.14
FCHO1-224ENST00000598086 NACADO15069 1562 aa28.41■■■□□ 2.14
FCHO1-224ENST00000598086 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.07■■■□□ 2.08
FCHO1-224ENST00000598086 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.03■■■□□ 2.08
FCHO1-224ENST00000598086 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.01■■■□□ 2.07
FCHO1-224ENST00000598086 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
FCHO1-224ENST00000598086 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.89■■■□□ 2.06
FCHO1-224ENST00000598086 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.78■■■□□ 2.04
FCHO1-224ENST00000598086 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.76■■■□□ 2.03
FCHO1-224ENST00000598086 SCRIBQ14160 1630 aa27.48■■□□□ 1.99
FCHO1-224ENST00000598086 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.34■■□□□ 1.97
FCHO1-224ENST00000598086 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.06■■□□□ 1.92
FCHO1-224ENST00000598086 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
FCHO1-224ENST00000598086 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.99■■□□□ 1.91
FCHO1-224ENST00000598086 NCAPD3P42695 1498 aa26.26■■□□□ 1.79
FCHO1-224ENST00000598086 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.22■■□□□ 1.79
FCHO1-224ENST00000598086 SMARCA4P51532 1647 aa26.21■■□□□ 1.79
FCHO1-224ENST00000598086 SMARCA2P51531 1590 aa26.11■■□□□ 1.77
FCHO1-224ENST00000598086 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
FCHO1-224ENST00000598086 HMGXB3Q12766 1538 aa26.04■■□□□ 1.76
FCHO1-224ENST00000598086 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
FCHO1-224ENST00000598086 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.96■■□□□ 1.75
FCHO1-224ENST00000598086 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.94■■□□□ 1.74
FCHO1-224ENST00000598086 ERCC6Q03468 1493 aa25.86■■□□□ 1.73
FCHO1-224ENST00000598086 NESP48681 1621 aa25.83■■□□□ 1.73
FCHO1-224ENST00000598086 CUX2O14529 1486 aa25.73■■□□□ 1.71
FCHO1-224ENST00000598086 WIZO95785 1651 aa25.64■■□□□ 1.69
FCHO1-224ENST00000598086 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.6■■□□□ 1.69
FCHO1-224ENST00000598086 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.57■■□□□ 1.68
FCHO1-224ENST00000598086 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
FCHO1-224ENST00000598086 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.48■■□□□ 1.67
FCHO1-224ENST00000598086 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.48■■□□□ 1.67
FCHO1-224ENST00000598086 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
FCHO1-224ENST00000598086 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.43■■□□□ 1.66
FCHO1-224ENST00000598086 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
FCHO1-224ENST00000598086 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.26■■□□□ 1.63
FCHO1-224ENST00000598086 CFTRP13569 1480 aa25.22■■□□□ 1.63
FCHO1-224ENST00000598086 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.19■■□□□ 1.62
FCHO1-224ENST00000598086 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.19■■□□□ 1.62
FCHO1-224ENST00000598086 WDR62O43379 1518 aa25.17■■□□□ 1.62
FCHO1-224ENST00000598086 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.07■■□□□ 1.6
FCHO1-224ENST00000598086 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
FCHO1-224ENST00000598086 PRDM2Q13029 1718 aa24.88■■□□□ 1.57
FCHO1-224ENST00000598086 TOPBP1Q92547 1522 aa24.73■■□□□ 1.55
FCHO1-224ENST00000598086 IFT140Q96RY7 1462 aa24.68■■□□□ 1.54
FCHO1-224ENST00000598086 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
FCHO1-224ENST00000598086 ABCC8Q09428 1581 aa24.64■■□□□ 1.54
FCHO1-224ENST00000598086 OSCARQ8IYS5 282 aa24.63■■□□□ 1.53
FCHO1-224ENST00000598086 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.63■■□□□ 1.53
FCHO1-224ENST00000598086 TRIM41Q8WV44 630 aa24.55■■□□□ 1.52
FCHO1-224ENST00000598086 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
FCHO1-224ENST00000598086 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
FCHO1-224ENST00000598086 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
FCHO1-224ENST00000598086 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
FCHO1-224ENST00000598086 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.518e-7■■■■■ 28.5
FCHO1-224ENST00000598086 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.43■■□□□ 1.5
FCHO1-224ENST00000598086 SOGA1O94964 1423 aa24.39■■□□□ 1.5
FCHO1-224ENST00000598086 CUX1P39880 1505 aa24.38■■□□□ 1.49
FCHO1-224ENST00000598086 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.37■■□□□ 1.49
FCHO1-224ENST00000598086 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FCHO1-224ENST00000598086 FBLN2P98095 1184 aa24.27■■□□□ 1.48
FCHO1-224ENST00000598086 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.25■■□□□ 1.47
FCHO1-224ENST00000598086 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.25■■□□□ 1.47
FCHO1-224ENST00000598086 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.25■■□□□ 1.47
FCHO1-224ENST00000598086 CHD1O14646 1710 aa24.24■■□□□ 1.47
FCHO1-224ENST00000598086 ARHGEF11O15085 1522 aa24.21■■□□□ 1.47
FCHO1-224ENST00000598086 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.2■■□□□ 1.47
FCHO1-224ENST00000598086 WDR97A6NE52 1622 aa24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-224ENST00000598086 GRIN2BQ13224 1484 aa24.14■■□□□ 1.46
FCHO1-224ENST00000598086 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
FCHO1-224ENST00000598086 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
FCHO1-224ENST00000598086 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.09■■□□□ 1.45
FCHO1-224ENST00000598086 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.09■■□□□ 1.45
FCHO1-224ENST00000598086 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.07■■□□□ 1.44
FCHO1-224ENST00000598086 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
FCHO1-224ENST00000598086 SYNJ2O15056 1496 aa24.04■■□□□ 1.44
FCHO1-224ENST00000598086 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.02■■□□□ 1.44
FCHO1-224ENST00000598086 PBRM1Q86U86 1689 aa24.01■■□□□ 1.43
FCHO1-224ENST00000598086 ARAP1Q96P48 1450 aa24■■□□□ 1.43
FCHO1-224ENST00000598086 CLASP1Q7Z460 1538 aa24■■□□□ 1.43
FCHO1-224ENST00000598086 SYNJ1O43426 1573 aa24■■□□□ 1.43
FCHO1-224ENST00000598086 TOP2BQ02880 1626 aa24■■□□□ 1.43
FCHO1-224ENST00000598086 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.99■■□□□ 1.43
FCHO1-224ENST00000598086 GRIN2AQ12879 1464 aa23.84■■□□□ 1.41
FCHO1-224ENST00000598086 ADAMTS12P58397 1594 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-224ENST00000598086 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-224ENST00000598086 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-224ENST00000598086 NUP160Q12769 1436 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-224ENST00000598086 CEP170Q5SW79 1584 aa23.74■■□□□ 1.39
FCHO1-224ENST00000598086 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-224ENST00000598086 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-224ENST00000598086 SHROOM2Q13796 1616 aa23.59■■□□□ 1.37
FCHO1-224ENST00000598086 IGF1RP08069 1367 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-224ENST00000598086 KIF27Q86VH2 1401 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-224ENST00000598086 JPH4Q96JJ6 628 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-224ENST00000598086 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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