RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593385.5

FCHO1-202, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-202ENST00000593385 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.39■■■□□ 2.78
FCHO1-202ENST00000593385 ABCC9O60706 1549 aa29.68■■■□□ 2.34
FCHO1-202ENST00000593385 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.31■■■□□ 2.28
FCHO1-202ENST00000593385 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.15■■■□□ 2.1
FCHO1-202ENST00000593385 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.11■■■□□ 2.09
FCHO1-202ENST00000593385 NACADO15069 1562 aa27.84■■■□□ 2.05
FCHO1-202ENST00000593385 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.58■■■□□ 2.01
FCHO1-202ENST00000593385 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 2
FCHO1-202ENST00000593385 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.33■■□□□ 1.97
FCHO1-202ENST00000593385 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.32■■□□□ 1.96
FCHO1-202ENST00000593385 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.18■■□□□ 1.94
FCHO1-202ENST00000593385 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.01■■□□□ 1.91
FCHO1-202ENST00000593385 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.83■■□□□ 1.89
FCHO1-202ENST00000593385 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.79■■□□□ 1.88
FCHO1-202ENST00000593385 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.78■■□□□ 1.88
FCHO1-202ENST00000593385 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
FCHO1-202ENST00000593385 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.69■■□□□ 1.86
FCHO1-202ENST00000593385 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
FCHO1-202ENST00000593385 SCRIBQ14160 1630 aa26.61■■□□□ 1.85
FCHO1-202ENST00000593385 CUX2O14529 1486 aa25.88■■□□□ 1.73
FCHO1-202ENST00000593385 ERCC6Q03468 1493 aa25.78■■□□□ 1.72
FCHO1-202ENST00000593385 NCAPD3P42695 1498 aa25.67■■□□□ 1.7
FCHO1-202ENST00000593385 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.5■■□□□ 1.67
FCHO1-202ENST00000593385 SMARCA2P51531 1590 aa25.49■■□□□ 1.67
FCHO1-202ENST00000593385 HMGXB3Q12766 1538 aa25.47■■□□□ 1.67
FCHO1-202ENST00000593385 SMARCA4P51532 1647 aa25.35■■□□□ 1.65
FCHO1-202ENST00000593385 NESP48681 1621 aa25.3■■□□□ 1.64
FCHO1-202ENST00000593385 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
FCHO1-202ENST00000593385 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
FCHO1-202ENST00000593385 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.2■■□□□ 1.62
FCHO1-202ENST00000593385 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
FCHO1-202ENST00000593385 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.14■■□□□ 1.61
FCHO1-202ENST00000593385 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.12■■□□□ 1.61
FCHO1-202ENST00000593385 TRIM41Q8WV44 630 aa25.06■■□□□ 1.6
FCHO1-202ENST00000593385 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.99■■□□□ 1.59
FCHO1-202ENST00000593385 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.89■■□□□ 1.57
FCHO1-202ENST00000593385 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.88■■□□□ 1.57
FCHO1-202ENST00000593385 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.87■■□□□ 1.57
FCHO1-202ENST00000593385 WDR62O43379 1518 aa24.79■■□□□ 1.56
FCHO1-202ENST00000593385 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.7■■□□□ 1.55
FCHO1-202ENST00000593385 OSCARQ8IYS5 282 aa24.62■■□□□ 1.53
FCHO1-202ENST00000593385 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.59■■□□□ 1.53
FCHO1-202ENST00000593385 WIZO95785 1651 aa24.56■■□□□ 1.52
FCHO1-202ENST00000593385 CFTRP13569 1480 aa24.49■■□□□ 1.51
FCHO1-202ENST00000593385 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FCHO1-202ENST00000593385 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
FCHO1-202ENST00000593385 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.24■■□□□ 1.47
FCHO1-202ENST00000593385 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.24■■□□□ 1.47
FCHO1-202ENST00000593385 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.24■■□□□ 1.47
FCHO1-202ENST00000593385 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
FCHO1-202ENST00000593385 IFT140Q96RY7 1462 aa24.23■■□□□ 1.47
FCHO1-202ENST00000593385 PRDM2Q13029 1718 aa24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-202ENST00000593385 ARHGEF11O15085 1522 aa24.15■■□□□ 1.46
FCHO1-202ENST00000593385 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
FCHO1-202ENST00000593385 ABCC8Q09428 1581 aa24.1■■□□□ 1.45
FCHO1-202ENST00000593385 TOPBP1Q92547 1522 aa24.05■■□□□ 1.44
FCHO1-202ENST00000593385 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.02■■□□□ 1.44
FCHO1-202ENST00000593385 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
FCHO1-202ENST00000593385 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.99■■□□□ 1.43
FCHO1-202ENST00000593385 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
FCHO1-202ENST00000593385 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
FCHO1-202ENST00000593385 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.95■■□□□ 1.43
FCHO1-202ENST00000593385 FBLN2P98095 1184 aa23.9■■□□□ 1.42
FCHO1-202ENST00000593385 CHD1O14646 1710 aa23.88■■□□□ 1.41
FCHO1-202ENST00000593385 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.411e-6■■■■■ 29.9
FCHO1-202ENST00000593385 ARAP1Q96P48 1450 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-202ENST00000593385 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-202ENST00000593385 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-202ENST00000593385 WDR97A6NE52 1622 aa23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-202ENST00000593385 SOGA1O94964 1423 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-202ENST00000593385 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-202ENST00000593385 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-202ENST00000593385 SYNJ1O43426 1573 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-202ENST00000593385 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.64■■□□□ 1.38
FCHO1-202ENST00000593385 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.64■■□□□ 1.38
FCHO1-202ENST00000593385 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-202ENST00000593385 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.61■■□□□ 1.37
FCHO1-202ENST00000593385 GRIN2BQ13224 1484 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-202ENST00000593385 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-202ENST00000593385 SYNJ2O15056 1496 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-202ENST00000593385 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.44■■□□□ 1.34
FCHO1-202ENST00000593385 CUX1P39880 1505 aa23.43■■□□□ 1.34
FCHO1-202ENST00000593385 PBRM1Q86U86 1689 aa23.37■■□□□ 1.33
FCHO1-202ENST00000593385 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-202ENST00000593385 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-202ENST00000593385 GRIN2AQ12879 1464 aa23.24■■□□□ 1.31
FCHO1-202ENST00000593385 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
FCHO1-202ENST00000593385 NUP160Q12769 1436 aa23.16■■□□□ 1.3
FCHO1-202ENST00000593385 CEP170Q5SW79 1584 aa23.15■■□□□ 1.3
FCHO1-202ENST00000593385 ADAMTS12P58397 1594 aa23.14■■□□□ 1.29
FCHO1-202ENST00000593385 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-202ENST00000593385 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.11■■□□□ 1.29
FCHO1-202ENST00000593385 SHROOM2Q13796 1616 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-202ENST00000593385 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.03■■□□□ 1.28
FCHO1-202ENST00000593385 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-202ENST00000593385 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
FCHO1-202ENST00000593385 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
FCHO1-202ENST00000593385 TOP2BQ02880 1626 aa22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-202ENST00000593385 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-202ENST00000593385 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.9 ms