RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598932.5

FCHO1-226, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-226ENST00000598932 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.14■■■■□ 3.22
FCHO1-226ENST00000598932 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.46■■■□□ 2.63
FCHO1-226ENST00000598932 ABCC9O60706 1549 aa31.39■■■□□ 2.61
FCHO1-226ENST00000598932 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.89■■■□□ 2.38
FCHO1-226ENST00000598932 NACADO15069 1562 aa29.69■■■□□ 2.34
FCHO1-226ENST00000598932 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.63■■■□□ 2.33
FCHO1-226ENST00000598932 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.3■■■□□ 2.28
FCHO1-226ENST00000598932 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.29■■■□□ 2.28
FCHO1-226ENST00000598932 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.24■■■□□ 2.27
FCHO1-226ENST00000598932 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.24■■■□□ 2.27
FCHO1-226ENST00000598932 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
FCHO1-226ENST00000598932 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.03■■■□□ 2.24
FCHO1-226ENST00000598932 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.99■■■□□ 2.23
FCHO1-226ENST00000598932 SCRIBQ14160 1630 aa28.75■■■□□ 2.19
FCHO1-226ENST00000598932 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.59■■■□□ 2.17
FCHO1-226ENST00000598932 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.34■■■□□ 2.13
FCHO1-226ENST00000598932 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
FCHO1-226ENST00000598932 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.23■■■□□ 2.11
FCHO1-226ENST00000598932 NCAPD3P42695 1498 aa27.4■■□□□ 1.98
FCHO1-226ENST00000598932 SMARCA4P51532 1647 aa27.4■■□□□ 1.98
FCHO1-226ENST00000598932 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.38■■□□□ 1.97
FCHO1-226ENST00000598932 SMARCA2P51531 1590 aa27.3■■□□□ 1.96
FCHO1-226ENST00000598932 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.96
FCHO1-226ENST00000598932 HMGXB3Q12766 1538 aa27.24■■□□□ 1.95
FCHO1-226ENST00000598932 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
FCHO1-226ENST00000598932 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.11■■□□□ 1.93
FCHO1-226ENST00000598932 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.09■■□□□ 1.93
FCHO1-226ENST00000598932 ERCC6Q03468 1493 aa27.07■■□□□ 1.92
FCHO1-226ENST00000598932 NESP48681 1621 aa27.01■■□□□ 1.91
FCHO1-226ENST00000598932 CUX2O14529 1486 aa26.93■■□□□ 1.9
FCHO1-226ENST00000598932 WIZO95785 1651 aa26.79■■□□□ 1.88
FCHO1-226ENST00000598932 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.79■■□□□ 1.88
FCHO1-226ENST00000598932 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.74■■□□□ 1.87
FCHO1-226ENST00000598932 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
FCHO1-226ENST00000598932 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.66■■□□□ 1.86
FCHO1-226ENST00000598932 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.62■■□□□ 1.85
FCHO1-226ENST00000598932 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.59■■□□□ 1.85
FCHO1-226ENST00000598932 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
FCHO1-226ENST00000598932 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
FCHO1-226ENST00000598932 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.41■■□□□ 1.82
FCHO1-226ENST00000598932 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.34■■□□□ 1.81
FCHO1-226ENST00000598932 WDR62O43379 1518 aa26.34■■□□□ 1.81
FCHO1-226ENST00000598932 CFTRP13569 1480 aa26.33■■□□□ 1.81
FCHO1-226ENST00000598932 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.32■■□□□ 1.8
FCHO1-226ENST00000598932 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.15■■□□□ 1.78
FCHO1-226ENST00000598932 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
FCHO1-226ENST00000598932 PRDM2Q13029 1718 aa26.09■■□□□ 1.77
FCHO1-226ENST00000598932 TOPBP1Q92547 1522 aa25.84■■□□□ 1.73
FCHO1-226ENST00000598932 IFT140Q96RY7 1462 aa25.79■■□□□ 1.72
FCHO1-226ENST00000598932 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
FCHO1-226ENST00000598932 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.76■■□□□ 1.71
FCHO1-226ENST00000598932 ABCC8Q09428 1581 aa25.73■■□□□ 1.71
FCHO1-226ENST00000598932 OSCARQ8IYS5 282 aa25.71■■□□□ 1.71
FCHO1-226ENST00000598932 TRIM41Q8WV44 630 aa25.71■■□□□ 1.71
FCHO1-226ENST00000598932 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
FCHO1-226ENST00000598932 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
FCHO1-226ENST00000598932 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
FCHO1-226ENST00000598932 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.689e-7■■■■■ 30.5
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FCHO1-226ENST00000598932 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.51■■□□□ 1.67
FCHO1-226ENST00000598932 CUX1P39880 1505 aa25.47■■□□□ 1.67
FCHO1-226ENST00000598932 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.46■■□□□ 1.67
FCHO1-226ENST00000598932 SOGA1O94964 1423 aa25.46■■□□□ 1.67
FCHO1-226ENST00000598932 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.43■■□□□ 1.66
FCHO1-226ENST00000598932 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.43■■□□□ 1.66
FCHO1-226ENST00000598932 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.43■■□□□ 1.66
FCHO1-226ENST00000598932 CHD1O14646 1710 aa25.43■■□□□ 1.66
FCHO1-226ENST00000598932 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
FCHO1-226ENST00000598932 FBLN2P98095 1184 aa25.36■■□□□ 1.65
FCHO1-226ENST00000598932 ARHGEF11O15085 1522 aa25.35■■□□□ 1.65
FCHO1-226ENST00000598932 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.31■■□□□ 1.64
FCHO1-226ENST00000598932 WDR97A6NE52 1622 aa25.3■■□□□ 1.64
FCHO1-226ENST00000598932 GRIN2BQ13224 1484 aa25.22■■□□□ 1.63
FCHO1-226ENST00000598932 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
FCHO1-226ENST00000598932 PBRM1Q86U86 1689 aa25.17■■□□□ 1.62
FCHO1-226ENST00000598932 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
FCHO1-226ENST00000598932 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.15■■□□□ 1.62
FCHO1-226ENST00000598932 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.15■■□□□ 1.62
FCHO1-226ENST00000598932 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.15■■□□□ 1.62
FCHO1-226ENST00000598932 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.13■■□□□ 1.61
FCHO1-226ENST00000598932 SYNJ2O15056 1496 aa25.13■■□□□ 1.61
FCHO1-226ENST00000598932 ARAP1Q96P48 1450 aa25.12■■□□□ 1.61
FCHO1-226ENST00000598932 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.12■■□□□ 1.61
FCHO1-226ENST00000598932 SYNJ1O43426 1573 aa25.1■■□□□ 1.61
FCHO1-226ENST00000598932 TOP2BQ02880 1626 aa25.08■■□□□ 1.6
FCHO1-226ENST00000598932 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.08■■□□□ 1.6
FCHO1-226ENST00000598932 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
FCHO1-226ENST00000598932 ADAMTS12P58397 1594 aa24.93■■□□□ 1.58
FCHO1-226ENST00000598932 GRIN2AQ12879 1464 aa24.9■■□□□ 1.58
FCHO1-226ENST00000598932 CEP170Q5SW79 1584 aa24.84■■□□□ 1.57
FCHO1-226ENST00000598932 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.83■■□□□ 1.57
FCHO1-226ENST00000598932 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
FCHO1-226ENST00000598932 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.83■■□□□ 1.57
FCHO1-226ENST00000598932 NUP160Q12769 1436 aa24.8■■□□□ 1.56
FCHO1-226ENST00000598932 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.78■■□□□ 1.56
FCHO1-226ENST00000598932 SHROOM2Q13796 1616 aa24.68■■□□□ 1.54
FCHO1-226ENST00000598932 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.59■■□□□ 1.53
FCHO1-226ENST00000598932 KIF27Q86VH2 1401 aa24.57■■□□□ 1.52
FCHO1-226ENST00000598932 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
FCHO1-226ENST00000598932 IGF1RP08069 1367 aa24.54■■□□□ 1.52
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