RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596462.5

FCHO1-213, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-213ENST00000596462 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.08■■■□□ 2.73
FCHO1-213ENST00000596462 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.56■■■□□ 2.16
FCHO1-213ENST00000596462 ABCC9O60706 1549 aa28.11■■■□□ 2.09
FCHO1-213ENST00000596462 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.03■■□□□ 1.92
FCHO1-213ENST00000596462 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.01■■□□□ 1.91
FCHO1-213ENST00000596462 NACADO15069 1562 aa26.97■■□□□ 1.91
FCHO1-213ENST00000596462 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.79■■□□□ 1.88
FCHO1-213ENST00000596462 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
FCHO1-213ENST00000596462 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.58■■□□□ 1.85
FCHO1-213ENST00000596462 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
FCHO1-213ENST00000596462 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.19■■□□□ 1.78
FCHO1-213ENST00000596462 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.07■■□□□ 1.76
FCHO1-213ENST00000596462 SCRIBQ14160 1630 aa26■■□□□ 1.75
FCHO1-213ENST00000596462 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.98■■□□□ 1.75
FCHO1-213ENST00000596462 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.92■■□□□ 1.74
FCHO1-213ENST00000596462 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
FCHO1-213ENST00000596462 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.39■■□□□ 1.66
FCHO1-213ENST00000596462 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.32■■□□□ 1.64
FCHO1-213ENST00000596462 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
FCHO1-213ENST00000596462 NCAPD3P42695 1498 aa24.89■■□□□ 1.58
FCHO1-213ENST00000596462 SMARCA4P51532 1647 aa24.88■■□□□ 1.57
FCHO1-213ENST00000596462 SMARCA2P51531 1590 aa24.85■■□□□ 1.57
FCHO1-213ENST00000596462 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.83■■□□□ 1.57
FCHO1-213ENST00000596462 HMGXB3Q12766 1538 aa24.71■■□□□ 1.55
FCHO1-213ENST00000596462 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.67■■□□□ 1.54
FCHO1-213ENST00000596462 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.67■■□□□ 1.54
FCHO1-213ENST00000596462 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
FCHO1-213ENST00000596462 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
FCHO1-213ENST00000596462 WIZO95785 1651 aa24.36■■□□□ 1.49
FCHO1-213ENST00000596462 ERCC6Q03468 1493 aa24.33■■□□□ 1.49
FCHO1-213ENST00000596462 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.25■■□□□ 1.47
FCHO1-213ENST00000596462 NESP48681 1621 aa24.22■■□□□ 1.47
FCHO1-213ENST00000596462 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.18■■□□□ 1.46
FCHO1-213ENST00000596462 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.18■■□□□ 1.46
FCHO1-213ENST00000596462 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
FCHO1-213ENST00000596462 CUX2O14529 1486 aa24.12■■□□□ 1.45
FCHO1-213ENST00000596462 CFTRP13569 1480 aa23.96■■□□□ 1.43
FCHO1-213ENST00000596462 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.89■■□□□ 1.42
FCHO1-213ENST00000596462 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.89■■□□□ 1.41
FCHO1-213ENST00000596462 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-213ENST00000596462 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-213ENST00000596462 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-213ENST00000596462 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.85■■□□□ 1.41
FCHO1-213ENST00000596462 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-213ENST00000596462 WDR62O43379 1518 aa23.72■■□□□ 1.39
FCHO1-213ENST00000596462 PRDM2Q13029 1718 aa23.64■■□□□ 1.38
FCHO1-213ENST00000596462 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.61■■□□□ 1.37
FCHO1-213ENST00000596462 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-213ENST00000596462 ABCC8Q09428 1581 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-213ENST00000596462 TOPBP1Q92547 1522 aa23.43■■□□□ 1.34
FCHO1-213ENST00000596462 IFT140Q96RY7 1462 aa23.39■■□□□ 1.34
FCHO1-213ENST00000596462 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.39■■□□□ 1.33
FCHO1-213ENST00000596462 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
FCHO1-213ENST00000596462 SOGA1O94964 1423 aa23.2■■□□□ 1.3
FCHO1-213ENST00000596462 OSCARQ8IYS5 282 aa23.2■■□□□ 1.3
FCHO1-213ENST00000596462 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
FCHO1-213ENST00000596462 CUX1P39880 1505 aa23.15■■□□□ 1.3
FCHO1-213ENST00000596462 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.14■■□□□ 1.29
FCHO1-213ENST00000596462 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-213ENST00000596462 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.1■■□□□ 1.29
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FCHO1-213ENST00000596462 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
FCHO1-213ENST00000596462 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-213ENST00000596462 WDR97A6NE52 1622 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-213ENST00000596462 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-213ENST00000596462 FBLN2P98095 1184 aa22.96■■□□□ 1.27
FCHO1-213ENST00000596462 TOP2BQ02880 1626 aa22.94■■□□□ 1.26
FCHO1-213ENST00000596462 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.94■■□□□ 1.26
FCHO1-213ENST00000596462 GRIN2BQ13224 1484 aa22.94■■□□□ 1.26
FCHO1-213ENST00000596462 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
FCHO1-213ENST00000596462 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.91■■□□□ 1.26
FCHO1-213ENST00000596462 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.9■■□□□ 1.26
FCHO1-213ENST00000596462 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
FCHO1-213ENST00000596462 SYNJ1O43426 1573 aa22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-213ENST00000596462 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.85■■□□□ 1.25
FCHO1-213ENST00000596462 SYNJ2O15056 1496 aa22.79■■□□□ 1.24
FCHO1-213ENST00000596462 CHD1O14646 1710 aa22.77■■□□□ 1.24
FCHO1-213ENST00000596462 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.77■■□□□ 1.24
FCHO1-213ENST00000596462 TRIM41Q8WV44 630 aa22.74■■□□□ 1.23
FCHO1-213ENST00000596462 PBRM1Q86U86 1689 aa22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-213ENST00000596462 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-213ENST00000596462 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-213ENST00000596462 ARHGEF11O15085 1522 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-213ENST00000596462 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-213ENST00000596462 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-213ENST00000596462 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.63■■□□□ 1.21
FCHO1-213ENST00000596462 KIF27Q86VH2 1401 aa22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-213ENST00000596462 GRIN2AQ12879 1464 aa22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-213ENST00000596462 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.58■■□□□ 1.21
FCHO1-213ENST00000596462 ADAMTS12P58397 1594 aa22.58■■□□□ 1.2
FCHO1-213ENST00000596462 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.56■■□□□ 1.2
FCHO1-213ENST00000596462 IGF1RP08069 1367 aa22.51■■□□□ 1.19
FCHO1-213ENST00000596462 NUP160Q12769 1436 aa22.5■■□□□ 1.19
FCHO1-213ENST00000596462 ARAP1Q96P48 1450 aa22.43■■□□□ 1.18
FCHO1-213ENST00000596462 CEP170Q5SW79 1584 aa22.42■■□□□ 1.18
FCHO1-213ENST00000596462 CUL7Q14999 1698 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-213ENST00000596462 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-213ENST00000596462 JPH4Q96JJ6 628 aa22.38■■□□□ 1.17
FCHO1-213ENST00000596462 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-213ENST00000596462 SHROOM2Q13796 1616 aa22.29■■□□□ 1.16
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