RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597474.5

FCHO1-220, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-220ENST00000597474 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33■■■□□ 2.87
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FCHO1-220ENST00000597474 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.74■■■□□ 2.35
FCHO1-220ENST00000597474 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.32■■■□□ 2.12
FCHO1-220ENST00000597474 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.1■■■□□ 2.09
FCHO1-220ENST00000597474 NACADO15069 1562 aa28.07■■■□□ 2.08
FCHO1-220ENST00000597474 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.86■■■□□ 2.05
FCHO1-220ENST00000597474 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.82■■■□□ 2.04
FCHO1-220ENST00000597474 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.02
FCHO1-220ENST00000597474 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.62■■■□□ 2.01
FCHO1-220ENST00000597474 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.56■■■□□ 2
FCHO1-220ENST00000597474 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
FCHO1-220ENST00000597474 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.23■■□□□ 1.95
FCHO1-220ENST00000597474 SCRIBQ14160 1630 aa27.08■■□□□ 1.93
FCHO1-220ENST00000597474 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.07■■□□□ 1.92
FCHO1-220ENST00000597474 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.98■■□□□ 1.91
FCHO1-220ENST00000597474 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
FCHO1-220ENST00000597474 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.86■■□□□ 1.89
FCHO1-220ENST00000597474 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.69■■□□□ 1.86
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FCHO1-220ENST00000597474 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.83■■□□□ 1.73
FCHO1-220ENST00000597474 SMARCA4P51532 1647 aa25.81■■□□□ 1.72
FCHO1-220ENST00000597474 SMARCA2P51531 1590 aa25.74■■□□□ 1.71
FCHO1-220ENST00000597474 HMGXB3Q12766 1538 aa25.74■■□□□ 1.71
FCHO1-220ENST00000597474 CUX2O14529 1486 aa25.73■■□□□ 1.71
FCHO1-220ENST00000597474 ERCC6Q03468 1493 aa25.72■■□□□ 1.71
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FCHO1-220ENST00000597474 NESP48681 1621 aa25.61■■□□□ 1.69
FCHO1-220ENST00000597474 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
FCHO1-220ENST00000597474 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.55■■□□□ 1.68
FCHO1-220ENST00000597474 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.45■■□□□ 1.66
FCHO1-220ENST00000597474 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
FCHO1-220ENST00000597474 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.39■■□□□ 1.65
FCHO1-220ENST00000597474 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.35■■□□□ 1.65
FCHO1-220ENST00000597474 WIZO95785 1651 aa25.18■■□□□ 1.62
FCHO1-220ENST00000597474 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.17■■□□□ 1.62
FCHO1-220ENST00000597474 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.08■■□□□ 1.61
FCHO1-220ENST00000597474 TRIM41Q8WV44 630 aa25.06■■□□□ 1.6
FCHO1-220ENST00000597474 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.01■■□□□ 1.59
FCHO1-220ENST00000597474 WDR62O43379 1518 aa24.98■■□□□ 1.59
FCHO1-220ENST00000597474 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.88■■□□□ 1.57
FCHO1-220ENST00000597474 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.84■■□□□ 1.57
FCHO1-220ENST00000597474 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
FCHO1-220ENST00000597474 CFTRP13569 1480 aa24.8■■□□□ 1.56
FCHO1-220ENST00000597474 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
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FCHO1-220ENST00000597474 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
FCHO1-220ENST00000597474 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.51■■□□□ 1.51
FCHO1-220ENST00000597474 OSCARQ8IYS5 282 aa24.46■■□□□ 1.51
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
FCHO1-220ENST00000597474 TOPBP1Q92547 1522 aa24.38■■□□□ 1.49
FCHO1-220ENST00000597474 IFT140Q96RY7 1462 aa24.37■■□□□ 1.49
FCHO1-220ENST00000597474 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.32■■□□□ 1.48
FCHO1-220ENST00000597474 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.32■■□□□ 1.48
FCHO1-220ENST00000597474 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.32■■□□□ 1.48
FCHO1-220ENST00000597474 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
FCHO1-220ENST00000597474 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.28■■□□□ 1.48
FCHO1-220ENST00000597474 ABCC8Q09428 1581 aa24.25■■□□□ 1.47
FCHO1-220ENST00000597474 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
FCHO1-220ENST00000597474 CHD1O14646 1710 aa24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-220ENST00000597474 ARHGEF11O15085 1522 aa24.18■■□□□ 1.46
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FCHO1-220ENST00000597474 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
FCHO1-220ENST00000597474 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.03■■□□□ 1.44
FCHO1-220ENST00000597474 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
FCHO1-220ENST00000597474 SOGA1O94964 1423 aa23.95■■□□□ 1.42
FCHO1-220ENST00000597474 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.94■■□□□ 1.42
FCHO1-220ENST00000597474 ARAP1Q96P48 1450 aa23.94■■□□□ 1.42
FCHO1-220ENST00000597474 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
FCHO1-220ENST00000597474 FBLN2P98095 1184 aa23.94■■□□□ 1.42
FCHO1-220ENST00000597474 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.93■■□□□ 1.42
FCHO1-220ENST00000597474 CUX1P39880 1505 aa23.93■■□□□ 1.42
FCHO1-220ENST00000597474 WDR97A6NE52 1622 aa23.91■■□□□ 1.42
FCHO1-220ENST00000597474 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.89■■□□□ 1.42
FCHO1-220ENST00000597474 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.84■■□□□ 1.41
FCHO1-220ENST00000597474 PBRM1Q86U86 1689 aa23.8■■□□□ 1.4
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FCHO1-220ENST00000597474 GRIN2BQ13224 1484 aa23.77■■□□□ 1.4
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FCHO1-220ENST00000597474 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
FCHO1-220ENST00000597474 SYNJ2O15056 1496 aa23.72■■□□□ 1.39
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FCHO1-220ENST00000597474 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.65■■□□□ 1.38
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FCHO1-220ENST00000597474 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-220ENST00000597474 ADAMTS12P58397 1594 aa23.52■■□□□ 1.36
FCHO1-220ENST00000597474 TOP2BQ02880 1626 aa23.5■■□□□ 1.35
FCHO1-220ENST00000597474 GRIN2AQ12879 1464 aa23.49■■□□□ 1.35
FCHO1-220ENST00000597474 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.49■■□□□ 1.35
FCHO1-220ENST00000597474 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
FCHO1-220ENST00000597474 CEP170Q5SW79 1584 aa23.47■■□□□ 1.35
FCHO1-220ENST00000597474 NUP160Q12769 1436 aa23.42■■□□□ 1.34
FCHO1-220ENST00000597474 SHROOM2Q13796 1616 aa23.4■■□□□ 1.34
FCHO1-220ENST00000597474 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.35■■□□□ 1.33
FCHO1-220ENST00000597474 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.35■■□□□ 1.33
FCHO1-220ENST00000597474 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.22■■□□□ 1.31
FCHO1-220ENST00000597474 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.19■■□□□ 1.3
FCHO1-220ENST00000597474 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
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