RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600676.5

FCHO1-234, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-234ENST00000600676 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.11■■■□□ 2.09
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FCHO1-234ENST00000600676 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-234ENST00000600676 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.18■■□□□ 1.3
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FCHO1-234ENST00000600676 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.77■■□□□ 1.08
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FCHO1-234ENST00000600676 SMARCA2P51531 1590 aa21.2■□□□□ 0.98
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FCHO1-234ENST00000600676 PBRM1Q86U86 1689 aa19.54■□□□□ 0.72
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FCHO1-234ENST00000600676 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.718e-7■■■■■ 28.6
FCHO1-234ENST00000600676 IFT140Q96RY7 1462 aa19.46■□□□□ 0.71
FCHO1-234ENST00000600676 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
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