RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600209.5

FCHO1-232, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-232ENST00000600209 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.66■■■■■ 5.22
FCHO1-232ENST00000600209 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.17■■■■■ 4.34
FCHO1-232ENST00000600209 ABCC9O60706 1549 aa40.72■■■■■ 4.11
FCHO1-232ENST00000600209 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
FCHO1-232ENST00000600209 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.62■■■■□ 3.93
FCHO1-232ENST00000600209 NACADO15069 1562 aa39.54■■■■□ 3.92
FCHO1-232ENST00000600209 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.5■■■■□ 3.91
FCHO1-232ENST00000600209 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.49■■■■□ 3.91
FCHO1-232ENST00000600209 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.44■■■■□ 3.9
FCHO1-232ENST00000600209 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.58■■■■□ 3.77
FCHO1-232ENST00000600209 SCRIBQ14160 1630 aa38.45■■■■□ 3.75
FCHO1-232ENST00000600209 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.21■■■■□ 3.71
FCHO1-232ENST00000600209 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.15■■■■□ 3.7
FCHO1-232ENST00000600209 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.89■■■■□ 3.66
FCHO1-232ENST00000600209 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
FCHO1-232ENST00000600209 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.05■■■■□ 3.52
FCHO1-232ENST00000600209 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.94■■■■□ 3.5
FCHO1-232ENST00000600209 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
FCHO1-232ENST00000600209 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.88■■■■□ 3.5
FCHO1-232ENST00000600209 SMARCA4P51532 1647 aa36.87■■■■□ 3.49
FCHO1-232ENST00000600209 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.72■■■■□ 3.47
FCHO1-232ENST00000600209 SMARCA2P51531 1590 aa36.54■■■■□ 3.44
FCHO1-232ENST00000600209 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.54■■■■□ 3.44
FCHO1-232ENST00000600209 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.53■■■■□ 3.44
FCHO1-232ENST00000600209 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
FCHO1-232ENST00000600209 NCAPD3P42695 1498 aa36.48■■■■□ 3.43
FCHO1-232ENST00000600209 WIZO95785 1651 aa36.37■■■■□ 3.41
FCHO1-232ENST00000600209 HMGXB3Q12766 1538 aa36.31■■■■□ 3.4
FCHO1-232ENST00000600209 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
FCHO1-232ENST00000600209 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
FCHO1-232ENST00000600209 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
FCHO1-232ENST00000600209 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.59■■■■□ 3.29
FCHO1-232ENST00000600209 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.44■■■■□ 3.26
FCHO1-232ENST00000600209 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.42■■■■□ 3.26
FCHO1-232ENST00000600209 NESP48681 1621 aa35.39■■■■□ 3.26
FCHO1-232ENST00000600209 CFTRP13569 1480 aa35.32■■■■□ 3.24
FCHO1-232ENST00000600209 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.18■■■■□ 3.22
FCHO1-232ENST00000600209 PRDM2Q13029 1718 aa35.13■■■■□ 3.21
FCHO1-232ENST00000600209 ERCC6Q03468 1493 aa35.06■■■■□ 3.2
FCHO1-232ENST00000600209 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.01■■■■□ 3.19
FCHO1-232ENST00000600209 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35■■■■□ 3.19
FCHO1-232ENST00000600209 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.9■■■■□ 3.18
FCHO1-232ENST00000600209 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.75■■■■□ 3.15
FCHO1-232ENST00000600209 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
FCHO1-232ENST00000600209 WDR62O43379 1518 aa34.61■■■■□ 3.13
FCHO1-232ENST00000600209 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
FCHO1-232ENST00000600209 ABCC8Q09428 1581 aa34.59■■■■□ 3.13
FCHO1-232ENST00000600209 CUX2O14529 1486 aa34.54■■■■□ 3.12
FCHO1-232ENST00000600209 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.51■■■■□ 3.12
FCHO1-232ENST00000600209 TOPBP1Q92547 1522 aa34.5■■■■□ 3.11
FCHO1-232ENST00000600209 CUX1P39880 1505 aa34.41■■■■□ 3.1
FCHO1-232ENST00000600209 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.4■■■■□ 3.1
FCHO1-232ENST00000600209 TOP2BQ02880 1626 aa34.28■■■■□ 3.08
FCHO1-232ENST00000600209 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.28■■■■□ 3.08
FCHO1-232ENST00000600209 SYNJ1O43426 1573 aa34.26■■■■□ 3.07
FCHO1-232ENST00000600209 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
FCHO1-232ENST00000600209 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.21■■■■□ 3.07
FCHO1-232ENST00000600209 IFT140Q96RY7 1462 aa34.17■■■■□ 3.06
FCHO1-232ENST00000600209 SOGA1O94964 1423 aa34.13■■■■□ 3.05
FCHO1-232ENST00000600209 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
FCHO1-232ENST00000600209 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.07■■■■□ 3.04
FCHO1-232ENST00000600209 TRIM41Q8WV44 630 aa33.97■■■■□ 3.03
FCHO1-232ENST00000600209 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.94■■■■□ 3.02
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
FCHO1-232ENST00000600209 WDR97A6NE52 1622 aa33.92■■■■□ 3.02
FCHO1-232ENST00000600209 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.89■■■■□ 3.02
FCHO1-232ENST00000600209 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
FCHO1-232ENST00000600209 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.82■■■■□ 3.018e-7■■■■■ 27.6
FCHO1-232ENST00000600209 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
FCHO1-232ENST00000600209 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.74■■■□□ 2.99
FCHO1-232ENST00000600209 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.74■■■□□ 2.99
FCHO1-232ENST00000600209 GRIN2BQ13224 1484 aa33.67■■■□□ 2.98
FCHO1-232ENST00000600209 KIF27Q86VH2 1401 aa33.66■■■□□ 2.98
FCHO1-232ENST00000600209 PBRM1Q86U86 1689 aa33.63■■■□□ 2.97
FCHO1-232ENST00000600209 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.55■■■□□ 2.96
FCHO1-232ENST00000600209 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
FCHO1-232ENST00000600209 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.5■■■□□ 2.95
FCHO1-232ENST00000600209 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.48■■■□□ 2.95
FCHO1-232ENST00000600209 IGF1RP08069 1367 aa33.47■■■□□ 2.95
FCHO1-232ENST00000600209 SYNJ2O15056 1496 aa33.38■■■□□ 2.93
FCHO1-232ENST00000600209 EEA1Q15075 1411 aa33.38■■■□□ 2.93
FCHO1-232ENST00000600209 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.37■■■□□ 2.93
FCHO1-232ENST00000600209 ADAMTS12P58397 1594 aa33.36■■■□□ 2.93
FCHO1-232ENST00000600209 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
FCHO1-232ENST00000600209 CUL7Q14999 1698 aa33.35■■■□□ 2.93
FCHO1-232ENST00000600209 CHD1O14646 1710 aa33.33■■■□□ 2.93
FCHO1-232ENST00000600209 FBLN2P98095 1184 aa33.33■■■□□ 2.93
FCHO1-232ENST00000600209 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.28■■■□□ 2.92
FCHO1-232ENST00000600209 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.27■■■□□ 2.92
FCHO1-232ENST00000600209 OSCARQ8IYS5 282 aa33.26■■■□□ 2.91
FCHO1-232ENST00000600209 GRIN2AQ12879 1464 aa33.21■■■□□ 2.91
FCHO1-232ENST00000600209 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
FCHO1-232ENST00000600209 PRXQ9BXM0 1461 aa33.13■■■□□ 2.89
FCHO1-232ENST00000600209 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.13■■■□□ 2.89
FCHO1-232ENST00000600209 NUP160Q12769 1436 aa33.06■■■□□ 2.88
FCHO1-232ENST00000600209 CEP170Q5SW79 1584 aa33.01■■■□□ 2.88
FCHO1-232ENST00000600209 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.97■■■□□ 2.87
FCHO1-232ENST00000600209 KIF21BO75037 1637 aa32.96■■■□□ 2.87
FCHO1-232ENST00000600209 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.93■■■□□ 2.86
FCHO1-232ENST00000600209 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.89■■■□□ 2.86
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