RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593870.5

FCHO1-204, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-204ENST00000593870 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.19■■■□□ 2.42
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FCHO1-204ENST00000593870 ABCC9O60706 1549 aa27.11■■□□□ 1.93
FCHO1-204ENST00000593870 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.78■■□□□ 1.72
FCHO1-204ENST00000593870 NACADO15069 1562 aa25.61■■□□□ 1.69
FCHO1-204ENST00000593870 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.54■■□□□ 1.68
FCHO1-204ENST00000593870 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.34■■□□□ 1.65
FCHO1-204ENST00000593870 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.3■■□□□ 1.64
FCHO1-204ENST00000593870 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.27■■□□□ 1.64
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FCHO1-204ENST00000593870 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
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FCHO1-204ENST00000593870 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.72■■□□□ 1.55
FCHO1-204ENST00000593870 SCRIBQ14160 1630 aa24.67■■□□□ 1.54
FCHO1-204ENST00000593870 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.53■■□□□ 1.52
FCHO1-204ENST00000593870 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
FCHO1-204ENST00000593870 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.41■■□□□ 1.5
FCHO1-204ENST00000593870 NCAPD3P42695 1498 aa23.67■■□□□ 1.38
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FCHO1-204ENST00000593870 SMARCA4P51532 1647 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-204ENST00000593870 HMGXB3Q12766 1538 aa23.49■■□□□ 1.35
FCHO1-204ENST00000593870 SMARCA2P51531 1590 aa23.48■■□□□ 1.35
FCHO1-204ENST00000593870 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.41■■□□□ 1.34
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FCHO1-204ENST00000593870 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.39■■□□□ 1.33
FCHO1-204ENST00000593870 CUX2O14529 1486 aa23.38■■□□□ 1.33
FCHO1-204ENST00000593870 NESP48681 1621 aa23.33■■□□□ 1.32
FCHO1-204ENST00000593870 ERCC6Q03468 1493 aa23.31■■□□□ 1.32
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FCHO1-204ENST00000593870 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.27■■□□□ 1.32
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FCHO1-204ENST00000593870 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.12■■□□□ 1.29
FCHO1-204ENST00000593870 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.05■■□□□ 1.28
FCHO1-204ENST00000593870 WIZO95785 1651 aa23■■□□□ 1.27
FCHO1-204ENST00000593870 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.91■■□□□ 1.26
FCHO1-204ENST00000593870 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.89■■□□□ 1.26
FCHO1-204ENST00000593870 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.78■■□□□ 1.24
FCHO1-204ENST00000593870 WDR62O43379 1518 aa22.77■■□□□ 1.24
FCHO1-204ENST00000593870 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
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FCHO1-204ENST00000593870 CFTRP13569 1480 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-204ENST00000593870 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.65■■□□□ 1.22
FCHO1-204ENST00000593870 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.64■■□□□ 1.21
FCHO1-204ENST00000593870 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
FCHO1-204ENST00000593870 PRDM2Q13029 1718 aa22.49■■□□□ 1.19
FCHO1-204ENST00000593870 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-204ENST00000593870 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
FCHO1-204ENST00000593870 TRIM41Q8WV44 630 aa22.25■■□□□ 1.15
FCHO1-204ENST00000593870 TOPBP1Q92547 1522 aa22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-204ENST00000593870 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-204ENST00000593870 OSCARQ8IYS5 282 aa22.22■■□□□ 1.15
FCHO1-204ENST00000593870 IFT140Q96RY7 1462 aa22.21■■□□□ 1.15
FCHO1-204ENST00000593870 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.15■■□□□ 1.14
FCHO1-204ENST00000593870 ABCC8Q09428 1581 aa22.12■■□□□ 1.13
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FCHO1-204ENST00000593870 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FCHO1-204ENST00000593870 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.06■■□□□ 1.12
FCHO1-204ENST00000593870 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.06■■□□□ 1.12
FCHO1-204ENST00000593870 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.06■■□□□ 1.12
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FCHO1-204ENST00000593870 ARHGEF11O15085 1522 aa21.97■■□□□ 1.11
FCHO1-204ENST00000593870 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.92■■□□□ 1.1
FCHO1-204ENST00000593870 CUX1P39880 1505 aa21.86■■□□□ 1.09
FCHO1-204ENST00000593870 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.85■■□□□ 1.09
FCHO1-204ENST00000593870 SOGA1O94964 1423 aa21.85■■□□□ 1.09
FCHO1-204ENST00000593870 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
FCHO1-204ENST00000593870 WDR97A6NE52 1622 aa21.82■■□□□ 1.08
FCHO1-204ENST00000593870 ARAP1Q96P48 1450 aa21.77■■□□□ 1.07
FCHO1-204ENST00000593870 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.76■■□□□ 1.07
FCHO1-204ENST00000593870 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.74■■□□□ 1.07
FCHO1-204ENST00000593870 FBLN2P98095 1184 aa21.7■■□□□ 1.06
FCHO1-204ENST00000593870 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.7■■□□□ 1.06
FCHO1-204ENST00000593870 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
FCHO1-204ENST00000593870 GRIN2BQ13224 1484 aa21.68■■□□□ 1.06
FCHO1-204ENST00000593870 PBRM1Q86U86 1689 aa21.66■■□□□ 1.06
FCHO1-204ENST00000593870 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.64■■□□□ 1.05
FCHO1-204ENST00000593870 SYNJ2O15056 1496 aa21.63■■□□□ 1.05
FCHO1-204ENST00000593870 SYNJ1O43426 1573 aa21.62■■□□□ 1.05
FCHO1-204ENST00000593870 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.61■■□□□ 1.05
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FCHO1-204ENST00000593870 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-204ENST00000593870 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.52■■□□□ 1.04
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FCHO1-204ENST00000593870 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
FCHO1-204ENST00000593870 ADAMTS12P58397 1594 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-204ENST00000593870 GRIN2AQ12879 1464 aa21.43■■□□□ 1.02
FCHO1-204ENST00000593870 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.4■■□□□ 1.02
FCHO1-204ENST00000593870 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
FCHO1-204ENST00000593870 CEP170Q5SW79 1584 aa21.4■■□□□ 1.02
FCHO1-204ENST00000593870 NUP160Q12769 1436 aa21.39■■□□□ 1.02
FCHO1-204ENST00000593870 SHROOM2Q13796 1616 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-204ENST00000593870 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.33■■□□□ 1
FCHO1-204ENST00000593870 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.32■■□□□ 1
FCHO1-204ENST00000593870 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.23■□□□□ 0.99
FCHO1-204ENST00000593870 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.16■□□□□ 0.98
FCHO1-204ENST00000593870 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
FCHO1-204ENST00000593870 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.09■□□□□ 0.97
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