RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595749.1

FCHO1-211, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-211ENST00000595749 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.81■■■□□ 2.36
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FCHO1-211ENST00000595749 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.99■■□□□ 1.75
FCHO1-211ENST00000595749 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.86■■□□□ 1.73
FCHO1-211ENST00000595749 NACADO15069 1562 aa25.57■■□□□ 1.68
FCHO1-211ENST00000595749 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
FCHO1-211ENST00000595749 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.34■■□□□ 1.65
FCHO1-211ENST00000595749 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.32■■□□□ 1.64
FCHO1-211ENST00000595749 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.11■■□□□ 1.61
FCHO1-211ENST00000595749 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.07■■□□□ 1.6
FCHO1-211ENST00000595749 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.71■■□□□ 1.55
FCHO1-211ENST00000595749 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.69■■□□□ 1.54
FCHO1-211ENST00000595749 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.66■■□□□ 1.54
FCHO1-211ENST00000595749 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
FCHO1-211ENST00000595749 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.61■■□□□ 1.53
FCHO1-211ENST00000595749 SCRIBQ14160 1630 aa24.53■■□□□ 1.52
FCHO1-211ENST00000595749 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
FCHO1-211ENST00000595749 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.17■■□□□ 1.46
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FCHO1-211ENST00000595749 ERCC6Q03468 1493 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-211ENST00000595749 NCAPD3P42695 1498 aa23.6■■□□□ 1.37
FCHO1-211ENST00000595749 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.47■■□□□ 1.35
FCHO1-211ENST00000595749 HMGXB3Q12766 1538 aa23.39■■□□□ 1.34
FCHO1-211ENST00000595749 SMARCA2P51531 1590 aa23.39■■□□□ 1.33
FCHO1-211ENST00000595749 NESP48681 1621 aa23.37■■□□□ 1.33
FCHO1-211ENST00000595749 SMARCA4P51532 1647 aa23.36■■□□□ 1.33
FCHO1-211ENST00000595749 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
FCHO1-211ENST00000595749 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
FCHO1-211ENST00000595749 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
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FCHO1-211ENST00000595749 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.13■■□□□ 1.29
FCHO1-211ENST00000595749 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.09■■□□□ 1.29
FCHO1-211ENST00000595749 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-211ENST00000595749 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.97■■□□□ 1.27
FCHO1-211ENST00000595749 TRIM41Q8WV44 630 aa22.95■■□□□ 1.26
FCHO1-211ENST00000595749 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.86■■□□□ 1.25
FCHO1-211ENST00000595749 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.84■■□□□ 1.25
FCHO1-211ENST00000595749 WDR62O43379 1518 aa22.8■■□□□ 1.24
FCHO1-211ENST00000595749 WIZO95785 1651 aa22.7■■□□□ 1.22
FCHO1-211ENST00000595749 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-211ENST00000595749 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-211ENST00000595749 OSCARQ8IYS5 282 aa22.57■■□□□ 1.2
FCHO1-211ENST00000595749 CFTRP13569 1480 aa22.51■■□□□ 1.19
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FCHO1-211ENST00000595749 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-211ENST00000595749 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-211ENST00000595749 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-211ENST00000595749 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-211ENST00000595749 PRDM2Q13029 1718 aa22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-211ENST00000595749 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
FCHO1-211ENST00000595749 IFT140Q96RY7 1462 aa22.22■■□□□ 1.15
FCHO1-211ENST00000595749 ARHGEF11O15085 1522 aa22.21■■□□□ 1.15
FCHO1-211ENST00000595749 TOPBP1Q92547 1522 aa22.14■■□□□ 1.13
FCHO1-211ENST00000595749 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.11■■□□□ 1.13
FCHO1-211ENST00000595749 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FCHO1-211ENST00000595749 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.07■■□□□ 1.12
FCHO1-211ENST00000595749 ABCC8Q09428 1581 aa22.07■■□□□ 1.12
FCHO1-211ENST00000595749 CHD1O14646 1710 aa22.05■■□□□ 1.12
FCHO1-211ENST00000595749 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.03■■□□□ 1.12
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FCHO1-211ENST00000595749 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.118e-8■■■■■ 33.8
FCHO1-211ENST00000595749 ARAP1Q96P48 1450 aa21.96■■□□□ 1.11
FCHO1-211ENST00000595749 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
FCHO1-211ENST00000595749 FBLN2P98095 1184 aa21.92■■□□□ 1.1
FCHO1-211ENST00000595749 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
FCHO1-211ENST00000595749 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.81■■□□□ 1.08
FCHO1-211ENST00000595749 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
FCHO1-211ENST00000595749 SOGA1O94964 1423 aa21.78■■□□□ 1.08
FCHO1-211ENST00000595749 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.75■■□□□ 1.07
FCHO1-211ENST00000595749 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.75■■□□□ 1.07
FCHO1-211ENST00000595749 WDR97A6NE52 1622 aa21.73■■□□□ 1.07
FCHO1-211ENST00000595749 SYNJ1O43426 1573 aa21.71■■□□□ 1.07
FCHO1-211ENST00000595749 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
FCHO1-211ENST00000595749 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.69■■□□□ 1.06
FCHO1-211ENST00000595749 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
FCHO1-211ENST00000595749 GRIN2BQ13224 1484 aa21.64■■□□□ 1.05
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FCHO1-211ENST00000595749 SYNJ2O15056 1496 aa21.61■■□□□ 1.05
FCHO1-211ENST00000595749 CUX1P39880 1505 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-211ENST00000595749 PBRM1Q86U86 1689 aa21.56■■□□□ 1.04
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FCHO1-211ENST00000595749 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-211ENST00000595749 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.41■■□□□ 1.02
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FCHO1-211ENST00000595749 GRIN2AQ12879 1464 aa21.35■■□□□ 1.01
FCHO1-211ENST00000595749 CEP170Q5SW79 1584 aa21.32■■□□□ 1
FCHO1-211ENST00000595749 ADAMTS12P58397 1594 aa21.3■■□□□ 1
FCHO1-211ENST00000595749 NUP160Q12769 1436 aa21.29■■□□□ 1
FCHO1-211ENST00000595749 SHROOM2Q13796 1616 aa21.27■■□□□ 1
FCHO1-211ENST00000595749 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.25■□□□□ 0.99
FCHO1-211ENST00000595749 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.24■□□□□ 0.99
FCHO1-211ENST00000595749 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.21■□□□□ 0.99
FCHO1-211ENST00000595749 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.18■□□□□ 0.98
FCHO1-211ENST00000595749 TOP2BQ02880 1626 aa21.16■□□□□ 0.98
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FCHO1-211ENST00000595749 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
FCHO1-211ENST00000595749 JPH4Q96JJ6 628 aa21.08■□□□□ 0.97
FCHO1-211ENST00000595749 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
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