RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595023.5

FCHO1-207, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 1,131 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-207ENST00000595023 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.3■■■□□ 2.92
FCHO1-207ENST00000595023 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.43■■■□□ 2.3
FCHO1-207ENST00000595023 ABCC9O60706 1549 aa28.8■■■□□ 2.2
FCHO1-207ENST00000595023 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.9■■■□□ 2.06
FCHO1-207ENST00000595023 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.04
FCHO1-207ENST00000595023 NACADO15069 1562 aa27.7■■■□□ 2.03
FCHO1-207ENST00000595023 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.69■■■□□ 2.02
FCHO1-207ENST00000595023 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.57■■■□□ 2
FCHO1-207ENST00000595023 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.52■■■□□ 2
FCHO1-207ENST00000595023 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
FCHO1-207ENST00000595023 SCRIBQ14160 1630 aa26.96■■□□□ 1.91
FCHO1-207ENST00000595023 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.94■■□□□ 1.9
FCHO1-207ENST00000595023 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.84■■□□□ 1.89
FCHO1-207ENST00000595023 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.57■■□□□ 1.84
FCHO1-207ENST00000595023 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.32■■□□□ 1.8
FCHO1-207ENST00000595023 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
FCHO1-207ENST00000595023 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.99■■□□□ 1.75
FCHO1-207ENST00000595023 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.96■■□□□ 1.75
FCHO1-207ENST00000595023 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
FCHO1-207ENST00000595023 SMARCA4P51532 1647 aa25.77■■□□□ 1.72
FCHO1-207ENST00000595023 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.68■■□□□ 1.7
FCHO1-207ENST00000595023 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.65■■□□□ 1.7
FCHO1-207ENST00000595023 NCAPD3P42695 1498 aa25.6■■□□□ 1.69
FCHO1-207ENST00000595023 SMARCA2P51531 1590 aa25.59■■□□□ 1.69
FCHO1-207ENST00000595023 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.49■■□□□ 1.67
FCHO1-207ENST00000595023 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
FCHO1-207ENST00000595023 HMGXB3Q12766 1538 aa25.45■■□□□ 1.66
FCHO1-207ENST00000595023 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
FCHO1-207ENST00000595023 WIZO95785 1651 aa25.36■■□□□ 1.65
FCHO1-207ENST00000595023 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
FCHO1-207ENST00000595023 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
FCHO1-207ENST00000595023 NESP48681 1621 aa24.95■■□□□ 1.58
FCHO1-207ENST00000595023 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.9■■□□□ 1.58
FCHO1-207ENST00000595023 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.87■■□□□ 1.57
FCHO1-207ENST00000595023 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.85■■□□□ 1.57
FCHO1-207ENST00000595023 ERCC6Q03468 1493 aa24.83■■□□□ 1.56
FCHO1-207ENST00000595023 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.76■■□□□ 1.55
FCHO1-207ENST00000595023 CFTRP13569 1480 aa24.75■■□□□ 1.55
FCHO1-207ENST00000595023 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.59■■□□□ 1.53
FCHO1-207ENST00000595023 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.56■■□□□ 1.52
FCHO1-207ENST00000595023 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.54■■□□□ 1.52
FCHO1-207ENST00000595023 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.47■■□□□ 1.51
FCHO1-207ENST00000595023 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
FCHO1-207ENST00000595023 CUX2O14529 1486 aa24.45■■□□□ 1.5
FCHO1-207ENST00000595023 PRDM2Q13029 1718 aa24.4■■□□□ 1.5
FCHO1-207ENST00000595023 WDR62O43379 1518 aa24.35■■□□□ 1.49
FCHO1-207ENST00000595023 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
FCHO1-207ENST00000595023 TOPBP1Q92547 1522 aa24.2■■□□□ 1.47
FCHO1-207ENST00000595023 ABCC8Q09428 1581 aa24.2■■□□□ 1.46
FCHO1-207ENST00000595023 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.16■■□□□ 1.46
FCHO1-207ENST00000595023 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.11■■□□□ 1.45
FCHO1-207ENST00000595023 CUX1P39880 1505 aa24.08■■□□□ 1.45
FCHO1-207ENST00000595023 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
FCHO1-207ENST00000595023 IFT140Q96RY7 1462 aa24.02■■□□□ 1.44
FCHO1-207ENST00000595023 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
FCHO1-207ENST00000595023 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.98■■□□□ 1.43
FCHO1-207ENST00000595023 SOGA1O94964 1423 aa23.95■■□□□ 1.42
FCHO1-207ENST00000595023 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.94■■□□□ 1.42
FCHO1-207ENST00000595023 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
FCHO1-207ENST00000595023 SYNJ1O43426 1573 aa23.89■■□□□ 1.41
FCHO1-207ENST00000595023 TOP2BQ02880 1626 aa23.88■■□□□ 1.41
FCHO1-207ENST00000595023 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
FCHO1-207ENST00000595023 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-207ENST00000595023 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-207ENST00000595023 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.81■■□□□ 1.48e-7■■■■■ 27.6
FCHO1-207ENST00000595023 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-207ENST00000595023 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.74■■□□□ 1.39
FCHO1-207ENST00000595023 TRIM41Q8WV44 630 aa23.74■■□□□ 1.39
FCHO1-207ENST00000595023 WDR97A6NE52 1622 aa23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-207ENST00000595023 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-207ENST00000595023 GRIN2BQ13224 1484 aa23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-207ENST00000595023 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.59■■□□□ 1.37
FCHO1-207ENST00000595023 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.58■■□□□ 1.37
FCHO1-207ENST00000595023 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-207ENST00000595023 FBLN2P98095 1184 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-207ENST00000595023 OSCARQ8IYS5 282 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-207ENST00000595023 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-207ENST00000595023 KIF27Q86VH2 1401 aa23.5■■□□□ 1.35
FCHO1-207ENST00000595023 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
FCHO1-207ENST00000595023 PBRM1Q86U86 1689 aa23.48■■□□□ 1.35
FCHO1-207ENST00000595023 SYNJ2O15056 1496 aa23.45■■□□□ 1.34
FCHO1-207ENST00000595023 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.44■■□□□ 1.34
FCHO1-207ENST00000595023 IGF1RP08069 1367 aa23.4■■□□□ 1.34
FCHO1-207ENST00000595023 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.4■■□□□ 1.34
FCHO1-207ENST00000595023 CHD1O14646 1710 aa23.38■■□□□ 1.33
FCHO1-207ENST00000595023 ADAMTS12P58397 1594 aa23.37■■□□□ 1.33
FCHO1-207ENST00000595023 EEA1Q15075 1411 aa23.36■■□□□ 1.33
FCHO1-207ENST00000595023 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.33■■□□□ 1.32
FCHO1-207ENST00000595023 GRIN2AQ12879 1464 aa23.31■■□□□ 1.32
FCHO1-207ENST00000595023 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-207ENST00000595023 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-207ENST00000595023 CUL7Q14999 1698 aa23.22■■□□□ 1.31
FCHO1-207ENST00000595023 NUP160Q12769 1436 aa23.21■■□□□ 1.31
FCHO1-207ENST00000595023 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.19■■□□□ 1.3
FCHO1-207ENST00000595023 CEP170Q5SW79 1584 aa23.17■■□□□ 1.3
FCHO1-207ENST00000595023 KIF21BO75037 1637 aa23.15■■□□□ 1.3
FCHO1-207ENST00000595023 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.14■■□□□ 1.29
FCHO1-207ENST00000595023 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.11■■□□□ 1.29
FCHO1-207ENST00000595023 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-207ENST00000595023 ARHGEF11O15085 1522 aa23.09■■□□□ 1.29
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