Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SP3-205ENST00000465379 5489 ntTSL 1 (best)4.63□□□□□ -1.672e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.72e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.199e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RING1-202ENST00000478431 1532 ntTSL 1 (best)28.44■■■□□ 2.149e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.819e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 JTB-206ENST00000471173 754 ntTSL 326.18■■□□□ 1.789e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.59e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.929e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.929e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SLC29A2-204ENST00000541567 2272 ntTSL 1 (best)20.27■□□□□ 0.839e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.689e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 JTB-205ENST00000461365 542 ntTSL 519.24■□□□□ 0.679e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 PMF1-205ENST00000497069 837 ntTSL 318.62■□□□□ 0.573e-8■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.559e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.559e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.519e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SLC29A2-203ENST00000540386 2474 ntTSL 1 (best)17.61■□□□□ 0.419e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 DOT1L-204ENST00000457590 2907 ntTSL 517.26■□□□□ 0.359e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.349e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.039e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 DNPEP-212ENST00000488051 480 ntTSL 315.24■□□□□ 0.039e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 FAM189A1-204ENST00000560082 533 ntTSL 414.7□□□□□ -0.069e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 COA4-202ENST00000537289 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.449e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 JTB-204ENST00000428469 520 ntTSL 312.05□□□□□ -0.489e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 LPIN1-205ENST00000404113 4005 ntTSL 1 (best)10.78□□□□□ -0.689e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 LPIN1-215ENST00000475922 5432 ntTSL 29.26□□□□□ -0.939e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 DNPEP-211ENST00000462779 251 ntTSL 27.96□□□□□ -1.149e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.575e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 AAAS-220ENST00000552876 2016 ntTSL 216.44■□□□□ 0.225e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 AAAS-212ENST00000548931 1075 ntTSL 514.68□□□□□ -0.065e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.075e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 MPC2-203ENST00000458574 645 ntTSL 522.33■■□□□ 1.172e-8■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.111e-13■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RPS7-206ENST00000472966 556 ntTSL 1 (best)9.21□□□□□ -0.942e-8■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SMS-202ENST00000404933 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.311e-28■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 HSPB11-206ENST00000489675 879 ntTSL 25.38□□□□□ -1.554e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 UQCRC1-208ENST00000472438 477 ntTSL 215.71■□□□□ 0.111e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.251e-7■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 POLR2E-203ENST00000586215 756 ntTSL 217.71■□□□□ 0.432e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-8■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.986e-20■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 CXXC5-215ENST00000515038 760 ntTSL 220.21■□□□□ 0.836e-20■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.746e-20■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.436e-20■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SCARB1-209ENST00000545305 851 ntTSL 215.76■□□□□ 0.116e-20■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.347e-8■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 TRA2B-207ENST00000463328 2780 ntTSL 25.97□□□□□ -1.457e-8■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 TRA2B-215ENST00000492417 4141 ntTSL 1 (best)5.13□□□□□ -1.597e-8■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 ARMC6-208ENST00000535795 1052 ntTSL 524.59■■□□□ 1.534e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.414e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.014e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.964e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 ARMC6-213ENST00000540634 1320 ntTSL 520.08■□□□□ 0.814e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 ARMC6-205ENST00000535478 762 ntTSL 317.67■□□□□ 0.424e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.324e-6■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.826e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.696e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RUVBL1-203ENST00000472125 913 ntTSL 313.13□□□□□ -0.316e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RUVBL1-208ENST00000585057 1113 ntTSL 312.65□□□□□ -0.386e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RUVBL1-207ENST00000582176 4062 nt11.17□□□□□ -0.626e-10■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 HMG20B-209ENST00000470356 806 ntTSL 1 (best)38.11■■■■□ 3.693e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 HMG20B-201ENST00000262949 886 ntTSL 528.18■■■□□ 2.13e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 HMG20B-205ENST00000435022 616 ntTSL 527.18■■□□□ 1.943e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 HMG20B-206ENST00000453933 759 ntTSL 226.97■■□□□ 1.913e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 HMG20B-203ENST00000416526 711 ntTSL 326.33■■□□□ 1.813e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.713e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 HMG20B-204ENST00000417382 561 ntTSL 425.28■■□□□ 1.643e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.613e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.513e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.123e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 HMG20B-215ENST00000585741 363 ntTSL 319.61■□□□□ 0.733e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RAB28-205ENST00000508274 1551 ntTSL 1 (best)17.27■□□□□ 0.353e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 KMT2E-203ENST00000334884 6840 ntTSL 516.95■□□□□ 0.33e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.223e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.163e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 RAB28-207ENST00000511649 715 ntTSL 57.76□□□□□ -1.173e-11■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.282e-7■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.36e-53■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SRSF3-207ENST00000620389 2655 ntTSL 29.48□□□□□ -0.896e-53■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.226e-53■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 SRSF3-205ENST00000614136 2376 nt5.69□□□□□ -1.56e-53■□□□□ 9.8
PABPC4Q13310 LDLR-201ENST00000252444 5337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.7■□□□□ 0.11e-8■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.454e-8■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 AQP3-205ENST00000494313 1505 ntTSL 216.53■□□□□ 0.244e-8■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 AQP3-204ENST00000493581 2911 ntTSL 214.24□□□□□ -0.134e-8■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPC1B-218ENST00000484375 785 ntTSL 326.68■■□□□ 1.863e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPC1B-204ENST00000418347 563 ntTSL 426.06■■□□□ 1.763e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPC1B-219ENST00000484600 582 ntTSL 224.15■■□□□ 1.463e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPC1B-212ENST00000455009 580 ntTSL 324.09■■□□□ 1.453e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPC1B-203ENST00000417330 559 ntTSL 223.76■■□□□ 1.393e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPC1B-205ENST00000427217 545 ntTSL 323.76■■□□□ 1.393e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPC1B-206ENST00000429246 348 ntTSL 523.76■■□□□ 1.393e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPC1B-207ENST00000431816 581 ntTSL 223.76■■□□□ 1.393e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPC1B-213ENST00000458033 561 ntTSL 223.76■■□□□ 1.393e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPC1B-202ENST00000414376 572 ntTSL 419.91■□□□□ 0.783e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPC1B-209ENST00000443222 669 ntTSL 218.71■□□□□ 0.593e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPC1B-208ENST00000432343 839 ntTSL 516.11■□□□□ 0.173e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPC1B-210ENST00000445924 727 ntTSL 516.11■□□□□ 0.173e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ARPC1B-216ENST00000474880 709 ntTSL 513.26□□□□□ -0.293e-9■□□□□ 9.7
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 691.5 ms