RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535795.1

ARMC6-208, Transcript of armadillo repeat containing 6, humanhuman

TSL 5

Gene ARMC6, Length 1,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC6-208ENST00000535795 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.58■■■■■ 5.69
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ARMC6-208ENST00000535795 ABCC9O60706 1549 aa45.03■■■■■ 4.8
ARMC6-208ENST00000535795 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.92■■■■■ 4.46
ARMC6-208ENST00000535795 NACADO15069 1562 aa42.71■■■■■ 4.43
ARMC6-208ENST00000535795 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.51■■■■■ 4.4
ARMC6-208ENST00000535795 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.24■■■■■ 4.35
ARMC6-208ENST00000535795 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.14■■■■■ 4.34
ARMC6-208ENST00000535795 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.99■■■■■ 4.31
ARMC6-208ENST00000535795 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.99■■■■■ 4.31
ARMC6-208ENST00000535795 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
ARMC6-208ENST00000535795 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.79■■■■■ 4.28
ARMC6-208ENST00000535795 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.77■■■■■ 4.28
ARMC6-208ENST00000535795 SCRIBQ14160 1630 aa41.24■■■■■ 4.19
ARMC6-208ENST00000535795 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.14■■■■■ 4.18
ARMC6-208ENST00000535795 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.68■■■■■ 4.1
ARMC6-208ENST00000535795 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
ARMC6-208ENST00000535795 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.53■■■■■ 4.08
ARMC6-208ENST00000535795 NCAPD3P42695 1498 aa39.48■■■■□ 3.91
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ARMC6-208ENST00000535795 SMARCA4P51532 1647 aa39.38■■■■□ 3.89
ARMC6-208ENST00000535795 SMARCA2P51531 1590 aa39.23■■■■□ 3.87
ARMC6-208ENST00000535795 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
ARMC6-208ENST00000535795 HMGXB3Q12766 1538 aa39.16■■■■□ 3.86
ARMC6-208ENST00000535795 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.03■■■■□ 3.84
ARMC6-208ENST00000535795 MROH2BQ7Z745 1585 aa39■■■■□ 3.83
ARMC6-208ENST00000535795 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
ARMC6-208ENST00000535795 ERCC6Q03468 1493 aa38.79■■■■□ 3.8
ARMC6-208ENST00000535795 NESP48681 1621 aa38.79■■■■□ 3.8
ARMC6-208ENST00000535795 CUX2O14529 1486 aa38.68■■■■□ 3.78
ARMC6-208ENST00000535795 WIZO95785 1651 aa38.52■■■■□ 3.76
ARMC6-208ENST00000535795 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.49■■■■□ 3.75
ARMC6-208ENST00000535795 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.44■■■■□ 3.74
ARMC6-208ENST00000535795 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.32■■■■□ 3.73
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ARMC6-208ENST00000535795 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.27■■■■□ 3.72
ARMC6-208ENST00000535795 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.25■■■■□ 3.71
ARMC6-208ENST00000535795 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.24■■■■□ 3.71
ARMC6-208ENST00000535795 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
ARMC6-208ENST00000535795 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.93■■■■□ 3.66
ARMC6-208ENST00000535795 CFTRP13569 1480 aa37.9■■■■□ 3.66
ARMC6-208ENST00000535795 WDR62O43379 1518 aa37.86■■■■□ 3.65
ARMC6-208ENST00000535795 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.82■■■■□ 3.64
ARMC6-208ENST00000535795 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.81■■■■□ 3.64
ARMC6-208ENST00000535795 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.64■■■■□ 3.62
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ARMC6-208ENST00000535795 TOPBP1Q92547 1522 aa37.15■■■■□ 3.54
ARMC6-208ENST00000535795 IFT140Q96RY7 1462 aa37.07■■■■□ 3.52
ARMC6-208ENST00000535795 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
ARMC6-208ENST00000535795 ABCC8Q09428 1581 aa37.03■■■■□ 3.52
ARMC6-208ENST00000535795 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37■■■■□ 3.51
ARMC6-208ENST00000535795 OSCARQ8IYS5 282 aa36.96■■■■□ 3.51
ARMC6-208ENST00000535795 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
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ARMC6-208ENST00000535795 TRIM41Q8WV44 630 aa36.79■■■■□ 3.48
ARMC6-208ENST00000535795 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
ARMC6-208ENST00000535795 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.72■■■■□ 3.47
ARMC6-208ENST00000535795 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
ARMC6-208ENST00000535795 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.67■■■■□ 3.46
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ARMC6-208ENST00000535795 SOGA1O94964 1423 aa36.6■■■■□ 3.45
ARMC6-208ENST00000535795 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.58■■■■□ 3.45
ARMC6-208ENST00000535795 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
ARMC6-208ENST00000535795 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.47■■■■□ 3.43
ARMC6-208ENST00000535795 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.47■■■■□ 3.43
ARMC6-208ENST00000535795 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.47■■■■□ 3.43
ARMC6-208ENST00000535795 CHD1O14646 1710 aa36.45■■■■□ 3.43
ARMC6-208ENST00000535795 ARHGEF11O15085 1522 aa36.39■■■■□ 3.42
ARMC6-208ENST00000535795 WDR97A6NE52 1622 aa36.38■■■■□ 3.41
ARMC6-208ENST00000535795 FBLN2P98095 1184 aa36.35■■■■□ 3.41
ARMC6-208ENST00000535795 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.32■■■■□ 3.41
ARMC6-208ENST00000535795 GRIN2BQ13224 1484 aa36.24■■■■□ 3.39
ARMC6-208ENST00000535795 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
ARMC6-208ENST00000535795 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.18■■■■□ 3.38
ARMC6-208ENST00000535795 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.16■■■■□ 3.38
ARMC6-208ENST00000535795 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
ARMC6-208ENST00000535795 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.11■■■■□ 3.37
ARMC6-208ENST00000535795 SYNJ2O15056 1496 aa36.11■■■■□ 3.37
ARMC6-208ENST00000535795 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.1■■■■□ 3.37
ARMC6-208ENST00000535795 PBRM1Q86U86 1689 aa36.1■■■■□ 3.37
ARMC6-208ENST00000535795 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.09■■■■□ 3.37
ARMC6-208ENST00000535795 ARAP1Q96P48 1450 aa36.06■■■■□ 3.36
ARMC6-208ENST00000535795 TOP2BQ02880 1626 aa36.06■■■■□ 3.36
ARMC6-208ENST00000535795 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.06■■■■□ 3.36
ARMC6-208ENST00000535795 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.06■■■■□ 3.36
ARMC6-208ENST00000535795 SYNJ1O43426 1573 aa36.06■■■■□ 3.36
ARMC6-208ENST00000535795 ADAMTS12P58397 1594 aa35.81■■■■□ 3.32
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ARMC6-208ENST00000535795 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.71■■■■□ 3.31
ARMC6-208ENST00000535795 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.71■■■■□ 3.31
ARMC6-208ENST00000535795 NUP160Q12769 1436 aa35.7■■■■□ 3.31
ARMC6-208ENST00000535795 CEP170Q5SW79 1584 aa35.68■■■■□ 3.3
ARMC6-208ENST00000535795 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.59■■■■□ 3.29
ARMC6-208ENST00000535795 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
ARMC6-208ENST00000535795 SHROOM2Q13796 1616 aa35.5■■■■□ 3.27
ARMC6-208ENST00000535795 IGF1RP08069 1367 aa35.38■■■■□ 3.25
ARMC6-208ENST00000535795 KIF27Q86VH2 1401 aa35.34■■■■□ 3.25
ARMC6-208ENST00000535795 JPH4Q96JJ6 628 aa35.31■■■■□ 3.24
ARMC6-208ENST00000535795 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
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