RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414376.5

ARPC1B-202, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

TSL 4

Gene ARPC1B, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1B-202ENST00000414376 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.32■■■■■ 4.2
ARPC1B-202ENST00000414376 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.01■■■■□ 3.52
ARPC1B-202ENST00000414376 ABCC9O60706 1549 aa36.54■■■■□ 3.44
ARPC1B-202ENST00000414376 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.93■■■■□ 3.18
ARPC1B-202ENST00000414376 NACADO15069 1562 aa34.76■■■■□ 3.16
ARPC1B-202ENST00000414376 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.42■■■■□ 3.1
ARPC1B-202ENST00000414376 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.4■■■■□ 3.1
ARPC1B-202ENST00000414376 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.4■■■■□ 3.1
ARPC1B-202ENST00000414376 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
ARPC1B-202ENST00000414376 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.14■■■■□ 3.06
ARPC1B-202ENST00000414376 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.05■■■■□ 3.04
ARPC1B-202ENST00000414376 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.97■■■■□ 3.03
ARPC1B-202ENST00000414376 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.88■■■■□ 3.01
ARPC1B-202ENST00000414376 SCRIBQ14160 1630 aa33.77■■■■□ 3
ARPC1B-202ENST00000414376 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.46■■■□□ 2.95
ARPC1B-202ENST00000414376 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
ARPC1B-202ENST00000414376 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.1■■■□□ 2.89
ARPC1B-202ENST00000414376 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.83■■■□□ 2.85
ARPC1B-202ENST00000414376 SMARCA4P51532 1647 aa32.23■■■□□ 2.75
ARPC1B-202ENST00000414376 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.06■■■□□ 2.72
ARPC1B-202ENST00000414376 NCAPD3P42695 1498 aa32.05■■■□□ 2.72
ARPC1B-202ENST00000414376 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
ARPC1B-202ENST00000414376 SMARCA2P51531 1590 aa31.98■■■□□ 2.71
ARPC1B-202ENST00000414376 HMGXB3Q12766 1538 aa31.96■■■□□ 2.71
ARPC1B-202ENST00000414376 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.9■■■□□ 2.7
ARPC1B-202ENST00000414376 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.89■■■□□ 2.7
ARPC1B-202ENST00000414376 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
ARPC1B-202ENST00000414376 WIZO95785 1651 aa31.59■■■□□ 2.65
ARPC1B-202ENST00000414376 NESP48681 1621 aa31.57■■■□□ 2.64
ARPC1B-202ENST00000414376 ERCC6Q03468 1493 aa31.44■■■□□ 2.62
ARPC1B-202ENST00000414376 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.34■■■□□ 2.61
ARPC1B-202ENST00000414376 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
ARPC1B-202ENST00000414376 CUX2O14529 1486 aa31.28■■■□□ 2.6
ARPC1B-202ENST00000414376 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.27■■■□□ 2.6
ARPC1B-202ENST00000414376 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.6
ARPC1B-202ENST00000414376 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
ARPC1B-202ENST00000414376 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.05■■■□□ 2.56
ARPC1B-202ENST00000414376 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.99■■■□□ 2.55
ARPC1B-202ENST00000414376 CFTRP13569 1480 aa30.86■■■□□ 2.53
ARPC1B-202ENST00000414376 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.84■■■□□ 2.53
ARPC1B-202ENST00000414376 WDR62O43379 1518 aa30.83■■■□□ 2.53
ARPC1B-202ENST00000414376 PRDM2Q13029 1718 aa30.8■■■□□ 2.52
ARPC1B-202ENST00000414376 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.79■■■□□ 2.52
ARPC1B-202ENST00000414376 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.78■■■□□ 2.52
ARPC1B-202ENST00000414376 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.73■■■□□ 2.51
ARPC1B-202ENST00000414376 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.68■■■□□ 2.5
ARPC1B-202ENST00000414376 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
ARPC1B-202ENST00000414376 TOPBP1Q92547 1522 aa30.28■■■□□ 2.44
ARPC1B-202ENST00000414376 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.24■■■□□ 2.43
ARPC1B-202ENST00000414376 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
ARPC1B-202ENST00000414376 IFT140Q96RY7 1462 aa30.12■■■□□ 2.41
ARPC1B-202ENST00000414376 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
ARPC1B-202ENST00000414376 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
ARPC1B-202ENST00000414376 ABCC8Q09428 1581 aa30.07■■■□□ 2.4
ARPC1B-202ENST00000414376 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
ARPC1B-202ENST00000414376 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
ARPC1B-202ENST00000414376 CUX1P39880 1505 aa29.96■■■□□ 2.39
ARPC1B-202ENST00000414376 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.88■■■□□ 2.37
ARPC1B-202ENST00000414376 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.88■■■□□ 2.37
ARPC1B-202ENST00000414376 WDR97A6NE52 1622 aa29.83■■■□□ 2.37
ARPC1B-202ENST00000414376 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.372e-6■■■■□ 19.5
ARPC1B-202ENST00000414376 CHD1O14646 1710 aa29.81■■■□□ 2.36
ARPC1B-202ENST00000414376 SOGA1O94964 1423 aa29.73■■■□□ 2.35
ARPC1B-202ENST00000414376 OSCARQ8IYS5 282 aa29.71■■■□□ 2.35
ARPC1B-202ENST00000414376 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
ARPC1B-202ENST00000414376 SYNJ1O43426 1573 aa29.62■■■□□ 2.33
ARPC1B-202ENST00000414376 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.62■■■□□ 2.33
ARPC1B-202ENST00000414376 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.62■■■□□ 2.33
ARPC1B-202ENST00000414376 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.62■■■□□ 2.33
ARPC1B-202ENST00000414376 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.62■■■□□ 2.33
ARPC1B-202ENST00000414376 PBRM1Q86U86 1689 aa29.62■■■□□ 2.33
ARPC1B-202ENST00000414376 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.61■■■□□ 2.33
ARPC1B-202ENST00000414376 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.58■■■□□ 2.33
ARPC1B-202ENST00000414376 TOP2BQ02880 1626 aa29.57■■■□□ 2.32
ARPC1B-202ENST00000414376 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.53■■■□□ 2.32
ARPC1B-202ENST00000414376 TRIM41Q8WV44 630 aa29.52■■■□□ 2.32
ARPC1B-202ENST00000414376 ARHGEF11O15085 1522 aa29.51■■■□□ 2.32
ARPC1B-202ENST00000414376 GRIN2BQ13224 1484 aa29.48■■■□□ 2.31
ARPC1B-202ENST00000414376 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
ARPC1B-202ENST00000414376 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
ARPC1B-202ENST00000414376 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.44■■■□□ 2.3
ARPC1B-202ENST00000414376 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.41■■■□□ 2.3
ARPC1B-202ENST00000414376 FBLN2P98095 1184 aa29.39■■■□□ 2.3
ARPC1B-202ENST00000414376 SYNJ2O15056 1496 aa29.38■■■□□ 2.29
ARPC1B-202ENST00000414376 ADAMTS12P58397 1594 aa29.33■■■□□ 2.29
ARPC1B-202ENST00000414376 ARAP1Q96P48 1450 aa29.28■■■□□ 2.28
ARPC1B-202ENST00000414376 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
ARPC1B-202ENST00000414376 GRIN2AQ12879 1464 aa29.17■■■□□ 2.26
ARPC1B-202ENST00000414376 CEP170Q5SW79 1584 aa29.16■■■□□ 2.26
ARPC1B-202ENST00000414376 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.15■■■□□ 2.26
ARPC1B-202ENST00000414376 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.06■■■□□ 2.24
ARPC1B-202ENST00000414376 NUP160Q12769 1436 aa29.05■■■□□ 2.24
ARPC1B-202ENST00000414376 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.04■■■□□ 2.24
ARPC1B-202ENST00000414376 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.04■■■□□ 2.24
ARPC1B-202ENST00000414376 SHROOM2Q13796 1616 aa28.99■■■□□ 2.23
ARPC1B-202ENST00000414376 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.93■■■□□ 2.22
ARPC1B-202ENST00000414376 CUL7Q14999 1698 aa28.87■■■□□ 2.21
ARPC1B-202ENST00000414376 KIF27Q86VH2 1401 aa28.82■■■□□ 2.2
ARPC1B-202ENST00000414376 IGF1RP08069 1367 aa28.77■■■□□ 2.2
ARPC1B-202ENST00000414376 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
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