RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297991.4

AQP3-201, Transcript of aquaporin 3 (Gill blood group), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AQP3, Length 1,849 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP3-201ENST00000297991 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.14■■■■□ 3.38
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AQP3-201ENST00000297991 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
AQP3-201ENST00000297991 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.94■■■□□ 2.38
AQP3-201ENST00000297991 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.92■■■□□ 2.38
AQP3-201ENST00000297991 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.73■■■□□ 2.35
AQP3-201ENST00000297991 NACADO15069 1562 aa29.65■■■□□ 2.34
AQP3-201ENST00000297991 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.5■■■□□ 2.31
AQP3-201ENST00000297991 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.14■■■□□ 2.26
AQP3-201ENST00000297991 SCRIBQ14160 1630 aa29.09■■■□□ 2.25
AQP3-201ENST00000297991 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.81■■■□□ 2.2
AQP3-201ENST00000297991 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.56■■■□□ 2.16
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AQP3-201ENST00000297991 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.88■■■□□ 2.05
AQP3-201ENST00000297991 SMARCA4P51532 1647 aa27.87■■■□□ 2.05
AQP3-201ENST00000297991 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
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AQP3-201ENST00000297991 WIZO95785 1651 aa27.62■■■□□ 2.01
AQP3-201ENST00000297991 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.56■■■□□ 2
AQP3-201ENST00000297991 SMARCA2P51531 1590 aa27.51■■■□□ 2
AQP3-201ENST00000297991 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.51■■□□□ 1.99
AQP3-201ENST00000297991 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.44■■□□□ 1.98
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AQP3-201ENST00000297991 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.05■■□□□ 1.92
AQP3-201ENST00000297991 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.67■■□□□ 1.86
AQP3-201ENST00000297991 CFTRP13569 1480 aa26.63■■□□□ 1.85
AQP3-201ENST00000297991 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.63■■□□□ 1.85
AQP3-201ENST00000297991 HRCP23327 699 aa26.62■■□□□ 1.85
AQP3-201ENST00000297991 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.51■■□□□ 1.83
AQP3-201ENST00000297991 NESP48681 1621 aa26.48■■□□□ 1.83
AQP3-201ENST00000297991 PRDM2Q13029 1718 aa26.47■■□□□ 1.83
AQP3-201ENST00000297991 ABCC8Q09428 1581 aa26.34■■□□□ 1.81
AQP3-201ENST00000297991 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.33■■□□□ 1.81
AQP3-201ENST00000297991 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.32■■□□□ 1.8
AQP3-201ENST00000297991 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
AQP3-201ENST00000297991 TRIM41Q8WV44 630 aa26.23■■□□□ 1.79
AQP3-201ENST00000297991 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.23■■□□□ 1.79
AQP3-201ENST00000297991 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.16■■□□□ 1.78
AQP3-201ENST00000297991 SYNJ1O43426 1573 aa26.15■■□□□ 1.78
AQP3-201ENST00000297991 CUX1P39880 1505 aa26.1■■□□□ 1.77
AQP3-201ENST00000297991 TOP2BQ02880 1626 aa26.1■■□□□ 1.77
AQP3-201ENST00000297991 ERCC6Q03468 1493 aa26.09■■□□□ 1.77
AQP3-201ENST00000297991 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.08■■□□□ 1.76
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AQP3-201ENST00000297991 TOPBP1Q92547 1522 aa25.99■■□□□ 1.75
AQP3-201ENST00000297991 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.97■■□□□ 1.75
AQP3-201ENST00000297991 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.9■■□□□ 1.74
AQP3-201ENST00000297991 WDR62O43379 1518 aa25.87■■□□□ 1.73
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AQP3-201ENST00000297991 EEA1Q15075 1411 aa25.7■■□□□ 1.71
AQP3-201ENST00000297991 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
AQP3-201ENST00000297991 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.68■■□□□ 1.7
AQP3-201ENST00000297991 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.67■■□□□ 1.7
AQP3-201ENST00000297991 CUX2O14529 1486 aa25.66■■□□□ 1.7
AQP3-201ENST00000297991 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.66■■□□□ 1.7
AQP3-201ENST00000297991 KIF27Q86VH2 1401 aa25.65■■□□□ 1.7
AQP3-201ENST00000297991 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
AQP3-201ENST00000297991 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
AQP3-201ENST00000297991 IFT140Q96RY7 1462 aa25.62■■□□□ 1.69
AQP3-201ENST00000297991 WDR97A6NE52 1622 aa25.61■■□□□ 1.69
AQP3-201ENST00000297991 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
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AQP3-201ENST00000297991 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.54■■□□□ 1.68
AQP3-201ENST00000297991 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
AQP3-201ENST00000297991 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
AQP3-201ENST00000297991 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.49■■□□□ 1.67
AQP3-201ENST00000297991 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.47■■□□□ 1.67
AQP3-201ENST00000297991 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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AQP3-201ENST00000297991 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.38■■□□□ 1.65
AQP3-201ENST00000297991 KIF21BO75037 1637 aa25.36■■□□□ 1.65
AQP3-201ENST00000297991 PRXQ9BXM0 1461 aa25.35■■□□□ 1.65
AQP3-201ENST00000297991 PBRM1Q86U86 1689 aa25.34■■□□□ 1.65
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AQP3-201ENST00000297991 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.33■■□□□ 1.65
AQP3-201ENST00000297991 CUL7Q14999 1698 aa25.31■■□□□ 1.64
AQP3-201ENST00000297991 GOLGA3Q08378 1498 aa25.31■■□□□ 1.64
AQP3-201ENST00000297991 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.3■■□□□ 1.64
AQP3-201ENST00000297991 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.27■■□□□ 1.64
AQP3-201ENST00000297991 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.21■■□□□ 1.63
AQP3-201ENST00000297991 ADAMTS12P58397 1594 aa25.2■■□□□ 1.62
AQP3-201ENST00000297991 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.19■■□□□ 1.62
AQP3-201ENST00000297991 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
AQP3-201ENST00000297991 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
AQP3-201ENST00000297991 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.13■■□□□ 1.61
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