RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455009.5

ARPC1B-212, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

TSL 3

Gene ARPC1B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1B-212ENST00000455009 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.84■■■■■ 5.41
ARPC1B-212ENST00000455009 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.52■■■■■ 4.56
ARPC1B-212ENST00000455009 ABCC9O60706 1549 aa42.48■■■■■ 4.39
ARPC1B-212ENST00000455009 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.98■■■■■ 4.15
ARPC1B-212ENST00000455009 NACADO15069 1562 aa40.91■■■■■ 4.14
ARPC1B-212ENST00000455009 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.78■■■■■ 4.12
ARPC1B-212ENST00000455009 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.69■■■■■ 4.1
ARPC1B-212ENST00000455009 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
ARPC1B-212ENST00000455009 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.48■■■■■ 4.07
ARPC1B-212ENST00000455009 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.93■■■■□ 3.98
ARPC1B-212ENST00000455009 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.64■■■■□ 3.94
ARPC1B-212ENST00000455009 SCRIBQ14160 1630 aa39.62■■■■□ 3.93
ARPC1B-212ENST00000455009 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.6■■■■□ 3.93
ARPC1B-212ENST00000455009 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.4■■■■□ 3.9
ARPC1B-212ENST00000455009 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.87■■■■□ 3.81
ARPC1B-212ENST00000455009 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
ARPC1B-212ENST00000455009 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.46■■■■□ 3.75
ARPC1B-212ENST00000455009 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.22■■■■□ 3.71
ARPC1B-212ENST00000455009 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
ARPC1B-212ENST00000455009 SMARCA4P51532 1647 aa37.91■■■■□ 3.66
ARPC1B-212ENST00000455009 SMARCA2P51531 1590 aa37.74■■■■□ 3.63
ARPC1B-212ENST00000455009 NCAPD3P42695 1498 aa37.71■■■■□ 3.63
ARPC1B-212ENST00000455009 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.7■■■■□ 3.63
ARPC1B-212ENST00000455009 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.58■■■■□ 3.61
ARPC1B-212ENST00000455009 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.57■■■■□ 3.6
ARPC1B-212ENST00000455009 HMGXB3Q12766 1538 aa37.56■■■■□ 3.6
ARPC1B-212ENST00000455009 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
ARPC1B-212ENST00000455009 WIZO95785 1651 aa37.18■■■■□ 3.54
ARPC1B-212ENST00000455009 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
ARPC1B-212ENST00000455009 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
ARPC1B-212ENST00000455009 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.77■■■■□ 3.48
ARPC1B-212ENST00000455009 ERCC6Q03468 1493 aa36.72■■■■□ 3.47
ARPC1B-212ENST00000455009 NESP48681 1621 aa36.71■■■■□ 3.47
ARPC1B-212ENST00000455009 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.6■■■■□ 3.45
ARPC1B-212ENST00000455009 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.53■■■■□ 3.44
ARPC1B-212ENST00000455009 CFTRP13569 1480 aa36.38■■■■□ 3.41
ARPC1B-212ENST00000455009 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.37■■■■□ 3.41
ARPC1B-212ENST00000455009 CUX2O14529 1486 aa36.36■■■■□ 3.41
ARPC1B-212ENST00000455009 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.34■■■■□ 3.41
ARPC1B-212ENST00000455009 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
ARPC1B-212ENST00000455009 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.18■■■■□ 3.38
ARPC1B-212ENST00000455009 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.18■■■■□ 3.38
ARPC1B-212ENST00000455009 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
ARPC1B-212ENST00000455009 PRDM2Q13029 1718 aa36.16■■■■□ 3.38
ARPC1B-212ENST00000455009 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.12■■■■□ 3.37
ARPC1B-212ENST00000455009 WDR62O43379 1518 aa35.99■■■■□ 3.35
ARPC1B-212ENST00000455009 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
ARPC1B-212ENST00000455009 ABCC8Q09428 1581 aa35.7■■■■□ 3.31
ARPC1B-212ENST00000455009 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.59■■■■□ 3.29
ARPC1B-212ENST00000455009 TOPBP1Q92547 1522 aa35.58■■■■□ 3.29
ARPC1B-212ENST00000455009 IFT140Q96RY7 1462 aa35.43■■■■□ 3.26
ARPC1B-212ENST00000455009 CUX1P39880 1505 aa35.28■■■■□ 3.24
ARPC1B-212ENST00000455009 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
ARPC1B-212ENST00000455009 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
ARPC1B-212ENST00000455009 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.19■■■■□ 3.22
ARPC1B-212ENST00000455009 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.17■■■■□ 3.22
ARPC1B-212ENST00000455009 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
ARPC1B-212ENST00000455009 SOGA1O94964 1423 aa35.15■■■■□ 3.22
ARPC1B-212ENST00000455009 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.1■■■■□ 3.21
ARPC1B-212ENST00000455009 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
ARPC1B-212ENST00000455009 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.07■■■■□ 3.2
ARPC1B-212ENST00000455009 WDR97A6NE52 1622 aa35.06■■■■□ 3.2
ARPC1B-212ENST00000455009 TOP2BQ02880 1626 aa35.03■■■■□ 3.2
ARPC1B-212ENST00000455009 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.03■■■■□ 3.2
ARPC1B-212ENST00000455009 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.97■■■■□ 3.192e-6■■■■□ 19.5
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ARPC1B-212ENST00000455009 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
ARPC1B-212ENST00000455009 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.88■■■■□ 3.17
ARPC1B-212ENST00000455009 OSCARQ8IYS5 282 aa34.8■■■■□ 3.16
ARPC1B-212ENST00000455009 GRIN2BQ13224 1484 aa34.78■■■■□ 3.16
ARPC1B-212ENST00000455009 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.76■■■■□ 3.15
ARPC1B-212ENST00000455009 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.73■■■■□ 3.15
ARPC1B-212ENST00000455009 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
ARPC1B-212ENST00000455009 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.7■■■■□ 3.15
ARPC1B-212ENST00000455009 PBRM1Q86U86 1689 aa34.69■■■■□ 3.14
ARPC1B-212ENST00000455009 CHD1O14646 1710 aa34.64■■■■□ 3.14
ARPC1B-212ENST00000455009 FBLN2P98095 1184 aa34.6■■■■□ 3.13
ARPC1B-212ENST00000455009 SYNJ2O15056 1496 aa34.56■■■■□ 3.12
ARPC1B-212ENST00000455009 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
ARPC1B-212ENST00000455009 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.5■■■■□ 3.11
ARPC1B-212ENST00000455009 ADAMTS12P58397 1594 aa34.42■■■■□ 3.1
ARPC1B-212ENST00000455009 KIF27Q86VH2 1401 aa34.4■■■■□ 3.1
ARPC1B-212ENST00000455009 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.38■■■■□ 3.09
ARPC1B-212ENST00000455009 GRIN2AQ12879 1464 aa34.31■■■■□ 3.08
ARPC1B-212ENST00000455009 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.27■■■■□ 3.08
ARPC1B-212ENST00000455009 TRIM41Q8WV44 630 aa34.25■■■■□ 3.07
ARPC1B-212ENST00000455009 ARHGEF11O15085 1522 aa34.21■■■■□ 3.07
ARPC1B-212ENST00000455009 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.21■■■■□ 3.07
ARPC1B-212ENST00000455009 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.21■■■■□ 3.07
ARPC1B-212ENST00000455009 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.21■■■■□ 3.07
ARPC1B-212ENST00000455009 CUL7Q14999 1698 aa34.21■■■■□ 3.07
ARPC1B-212ENST00000455009 IGF1RP08069 1367 aa34.17■■■■□ 3.06
ARPC1B-212ENST00000455009 NUP160Q12769 1436 aa34.14■■■■□ 3.06
ARPC1B-212ENST00000455009 CEP170Q5SW79 1584 aa34.1■■■■□ 3.05
ARPC1B-212ENST00000455009 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.01■■■■□ 3.04
ARPC1B-212ENST00000455009 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.91■■■■□ 3.02
ARPC1B-212ENST00000455009 ARAP1Q96P48 1450 aa33.91■■■■□ 3.02
ARPC1B-212ENST00000455009 SHROOM2Q13796 1616 aa33.9■■■■□ 3.02
ARPC1B-212ENST00000455009 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.86■■■■□ 3.01
ARPC1B-212ENST00000455009 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.84■■■■□ 3.01
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