RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262949.7

HMG20B-201, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 5

Gene HMG20B, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-201ENST00000262949 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.22■■■■■ 6.75
HMG20B-201ENST00000262949 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.24■■■■■ 5.79
HMG20B-201ENST00000262949 ABCC9O60706 1549 aa51.11■■■■■ 5.77
HMG20B-201ENST00000262949 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.75■■■■■ 5.39
HMG20B-201ENST00000262949 NACADO15069 1562 aa48.46■■■■■ 5.35
HMG20B-201ENST00000262949 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.42■■■■■ 5.34
HMG20B-201ENST00000262949 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.84■■■■■ 5.25
HMG20B-201ENST00000262949 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.72■■■■■ 5.23
HMG20B-201ENST00000262949 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.66■■■■■ 5.221e-8■■■□□ 17.2
HMG20B-201ENST00000262949 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.47■■■■■ 5.19
HMG20B-201ENST00000262949 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.44■■■■■ 5.18
HMG20B-201ENST00000262949 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.28■■■■■ 5.16
HMG20B-201ENST00000262949 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.2■■■■■ 5.15
HMG20B-201ENST00000262949 SCRIBQ14160 1630 aa46.72■■■■■ 5.07
HMG20B-201ENST00000262949 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.71■■■■■ 5.07
HMG20B-201ENST00000262949 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.14■■■■■ 4.98
HMG20B-201ENST00000262949 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.09■■■■■ 4.97
HMG20B-201ENST00000262949 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.05■■■■■ 4.96
HMG20B-201ENST00000262949 NCAPD3P42695 1498 aa44.72■■■■■ 4.75
HMG20B-201ENST00000262949 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.6■■■■■ 4.73
HMG20B-201ENST00000262949 SMARCA4P51532 1647 aa44.57■■■■■ 4.73
HMG20B-201ENST00000262949 SMARCA2P51531 1590 aa44.53■■■■■ 4.72
HMG20B-201ENST00000262949 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.71
HMG20B-201ENST00000262949 HMGXB3Q12766 1538 aa44.39■■■■■ 4.7
HMG20B-201ENST00000262949 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
HMG20B-201ENST00000262949 ERCC6Q03468 1493 aa44.21■■■■■ 4.67
HMG20B-201ENST00000262949 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.13■■■■■ 4.65
HMG20B-201ENST00000262949 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.06■■■■■ 4.64
HMG20B-201ENST00000262949 CUX2O14529 1486 aa44■■■■■ 4.63
HMG20B-201ENST00000262949 NESP48681 1621 aa43.91■■■■■ 4.62
HMG20B-201ENST00000262949 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.78■■■■■ 4.6
HMG20B-201ENST00000262949 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.69■■■■■ 4.58
HMG20B-201ENST00000262949 WIZO95785 1651 aa43.53■■■■■ 4.56
HMG20B-201ENST00000262949 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.51■■■■■ 4.56
HMG20B-201ENST00000262949 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.42■■■■■ 4.54
HMG20B-201ENST00000262949 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
HMG20B-201ENST00000262949 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.31■■■■■ 4.52
HMG20B-201ENST00000262949 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.26■■■■■ 4.52
HMG20B-201ENST00000262949 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.06■■■■■ 4.48
HMG20B-201ENST00000262949 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
HMG20B-201ENST00000262949 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.94■■■■■ 4.47
HMG20B-201ENST00000262949 CFTRP13569 1480 aa42.92■■■■■ 4.46
HMG20B-201ENST00000262949 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.9■■■■■ 4.46
HMG20B-201ENST00000262949 WDR62O43379 1518 aa42.9■■■■■ 4.46
HMG20B-201ENST00000262949 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.57■■■■■ 4.41
HMG20B-201ENST00000262949 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
HMG20B-201ENST00000262949 PRDM2Q13029 1718 aa42.43■■■■■ 4.38
HMG20B-201ENST00000262949 OSCARQ8IYS5 282 aa42.12■■■■■ 4.33
HMG20B-201ENST00000262949 ABCC8Q09428 1581 aa42.1■■■■■ 4.33
HMG20B-201ENST00000262949 IFT140Q96RY7 1462 aa42.09■■■■■ 4.33
HMG20B-201ENST00000262949 TOPBP1Q92547 1522 aa42.09■■■■■ 4.33
HMG20B-201ENST00000262949 TRIM41Q8WV44 630 aa42■■■■■ 4.31
HMG20B-201ENST00000262949 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.95■■■■■ 4.31
HMG20B-201ENST00000262949 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
HMG20B-201ENST00000262949 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
HMG20B-201ENST00000262949 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
HMG20B-201ENST00000262949 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
HMG20B-201ENST00000262949 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
HMG20B-201ENST00000262949 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.62■■■■■ 4.256e-8■■■■■ 34.8
HMG20B-201ENST00000262949 SOGA1O94964 1423 aa41.55■■■■■ 4.24
HMG20B-201ENST00000262949 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.51■■■■■ 4.24
HMG20B-201ENST00000262949 FBLN2P98095 1184 aa41.45■■■■■ 4.23
HMG20B-201ENST00000262949 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.44■■■■■ 4.22
HMG20B-201ENST00000262949 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
HMG20B-201ENST00000262949 CUX1P39880 1505 aa41.39■■■■■ 4.22
HMG20B-201ENST00000262949 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.39■■■■■ 4.22
HMG20B-201ENST00000262949 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.39■■■■■ 4.22
HMG20B-201ENST00000262949 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.39■■■■■ 4.22
HMG20B-201ENST00000262949 CHD1O14646 1710 aa41.32■■■■■ 4.21
HMG20B-201ENST00000262949 ARHGEF11O15085 1522 aa41.31■■■■■ 4.2
HMG20B-201ENST00000262949 WDR97A6NE52 1622 aa41.3■■■■■ 4.2
HMG20B-201ENST00000262949 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.2■■■■■ 4.19
HMG20B-201ENST00000262949 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
HMG20B-201ENST00000262949 GRIN2BQ13224 1484 aa41.15■■■■■ 4.18
HMG20B-201ENST00000262949 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
HMG20B-201ENST00000262949 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.11■■■■■ 4.17
HMG20B-201ENST00000262949 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.02■■■■■ 4.16
HMG20B-201ENST00000262949 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.99■■■■■ 4.15
HMG20B-201ENST00000262949 SYNJ2O15056 1496 aa40.98■■■■■ 4.15
HMG20B-201ENST00000262949 SYNJ1O43426 1573 aa40.96■■■■■ 4.15
HMG20B-201ENST00000262949 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.14
HMG20B-201ENST00000262949 PBRM1Q86U86 1689 aa40.9■■■■■ 4.14
HMG20B-201ENST00000262949 ARAP1Q96P48 1450 aa40.9■■■■■ 4.14
HMG20B-201ENST00000262949 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.87■■■■■ 4.13
HMG20B-201ENST00000262949 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.85■■■■■ 4.13
HMG20B-201ENST00000262949 TOP2BQ02880 1626 aa40.8■■■■■ 4.12
HMG20B-201ENST00000262949 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.77■■■■■ 4.12
HMG20B-201ENST00000262949 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
HMG20B-201ENST00000262949 GRIN2AQ12879 1464 aa40.59■■■■■ 4.09
HMG20B-201ENST00000262949 ADAMTS12P58397 1594 aa40.54■■■■■ 4.08
HMG20B-201ENST00000262949 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.53■■■■■ 4.08
HMG20B-201ENST00000262949 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.49■■■■■ 4.07
HMG20B-201ENST00000262949 NUP160Q12769 1436 aa40.42■■■■■ 4.06
HMG20B-201ENST00000262949 CEP170Q5SW79 1584 aa40.38■■■■■ 4.05
HMG20B-201ENST00000262949 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.23■■■■■ 4.03
HMG20B-201ENST00000262949 SHROOM2Q13796 1616 aa40.17■■■■■ 4.02
HMG20B-201ENST00000262949 KIF27Q86VH2 1401 aa40.12■■■■■ 4.01
HMG20B-201ENST00000262949 JPH4Q96JJ6 628 aa40.12■■■■■ 4.01
HMG20B-201ENST00000262949 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
HMG20B-201ENST00000262949 IGF1RP08069 1367 aa40.03■■■■■ 4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms