Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 KRIT1-204ENST00000394507 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 KRIT1-221ENST00000475770 2411 ntTSL 1 (best)11.8□□□□□ -0.522e-9■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.562e-9■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 KRIT1-222ENST00000486261 4057 ntTSL 1 (best)7.07□□□□□ -1.282e-9■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.671e-7■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.961e-7■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 MGEA5-204ENST00000429860 769 ntTSL 314.05□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CLASRP-215ENST00000592056 582 ntTSL 231.82■■■□□ 2.681e-6■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.821e-6■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.621e-6■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CLASRP-202ENST00000391952 2213 ntTSL 1 (best)22.17■■□□□ 1.141e-6■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CLASRP-207ENST00000587112 867 ntTSL 1 (best)19.9■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CLASRP-212ENST00000588936 590 ntTSL 418.43■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CLASRP-213ENST00000591410 572 ntTSL 417.81■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 TELO2-202ENST00000497339 1667 ntTSL 531.49■■■□□ 2.633e-9■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.823e-9■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.769e-8■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 FOXP1-219ENST00000610810 577 ntTSL 524.25■■□□□ 1.479e-8■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CSNK1D-223ENST00000584472 586 ntTSL 424.77■■□□□ 1.562e-7■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CSNK1D-213ENST00000580446 612 ntTSL 323.75■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CSNK1D-211ENST00000579316 692 ntTSL 222.98■■□□□ 1.272e-7■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CSNK1D-219ENST00000581660 611 ntTSL 522.98■■□□□ 1.272e-7■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CSNK1D-207ENST00000578194 567 ntTSL 419.72■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CSNK1D-226ENST00000585026 563 ntTSL 517.33■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CSNK1D-210ENST00000579308 598 ntTSL 217.3■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 32.8
HNRNPMP52272 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 242.83■■■■■ 4.452e-8■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 342.83■■■■■ 4.452e-8■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.522e-8■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBAP1-205ENST00000626262 1753 ntTSL 229.59■■■□□ 2.333e-7■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.253e-7■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.53e-7■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.965e-7■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 ZMYM2-205ENST00000382883 5445 ntTSL 55.96□□□□□ -1.465e-7■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.825e-7■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 ZMYM2-201ENST00000382870 3456 ntTSL 1 (best)3.05□□□□□ -1.925e-7■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.577e-9■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 CFDP1-208ENST00000569341 454 ntTSL 35.38□□□□□ -1.557e-9■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 CFDP1-211ENST00000612761 395 ntTSL 35.37□□□□□ -1.557e-9■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 CNIH1-206ENST00000557659 856 ntTSL 217.73■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 CNIH1-202ENST00000395573 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 CNIH1-207ENST00000557690 838 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.262e-8■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 CNIH1-204ENST00000554683 787 ntTSL 316.65■□□□□ 0.262e-8■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.732e-8■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.122e-9■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.994e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-229ENST00000510129 582 ntTSL 333.5■■■□□ 2.954e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-220ENST00000505307 743 ntTSL 531.95■■■□□ 2.714e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-215ENST00000503418 662 ntTSL 431.03■■■□□ 2.564e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-216ENST00000503742 1977 ntTSL 1 (best)30.79■■■□□ 2.524e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-213ENST00000502690 599 ntTSL 427.56■■■□□ 24e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-228ENST00000508974 568 ntTSL 423.56■■□□□ 1.364e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.044e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.94e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.464e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-219ENST00000505207 527 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.454e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-211ENST00000502404 574 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.454e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-232ENST00000514755 593 ntTSL 417.37■□□□□ 0.374e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-206ENST00000357194 660 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.264e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-212ENST00000502563 680 ntTSL 316.64■□□□□ 0.254e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-227ENST00000508818 584 ntTSL 216.07■□□□□ 0.164e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-209ENST00000394804 4166 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.054e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-205ENST00000350435 711 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.044e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.014e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-223ENST00000508249 604 ntTSL 415.12■□□□□ 0.014e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-203ENST00000343106 2389 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.244e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-208ENST00000394803 2227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.274e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-222ENST00000508238 547 ntTSL 412.65□□□□□ -0.384e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.824e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-224ENST00000508474 4819 ntTSL 28.66□□□□□ -1.024e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.264e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-230ENST00000510599 484 ntTSL 26.09□□□□□ -1.434e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-225ENST00000508476 601 ntTSL 36.05□□□□□ -1.444e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-226ENST00000508635 587 ntTSL 45.48□□□□□ -1.534e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.74e-13■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 32.7
HNRNPMP52272 NEDD4L-218ENST00000587547 889 ntTSL 1 (best)13.08□□□□□ -0.329e-7■■■■■ 32.6
HNRNPMP52272 MATR3-207ENST00000504023 770 ntTSL 412.45□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 32.6
HNRNPMP52272 SIN3B-207ENST00000595900 563 ntTSL 417.4■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 32.6
HNRNPMP52272 MLLT10-206ENST00000420525 538 ntTSL 34.04□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 32.6
HNRNPMP52272 SH3PXD2A-201ENST00000315994 5504 ntTSL 1 (best)16.92■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 32.6
HNRNPMP52272 ANKRD12-204ENST00000540578 1338 ntTSL 1 (best)20.6■□□□□ 0.898e-7■■■■■ 32.6
HNRNPMP52272 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.18e-7■■■■■ 32.6
HNRNPMP52272 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 32.6
HNRNPMP52272 TAF4-203ENST00000474089 532 ntTSL 231.16■■■□□ 2.586e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 TAF4-202ENST00000436129 2440 ntTSL 220.28■□□□□ 0.846e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 FBXO46-202ENST00000586899 654 ntTSL 328.49■■■□□ 2.152e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.892e-7■■■■■ 32.5
HNRNPMP52272 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC20.11■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 32.5
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 384.2 ms