RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540578.6

ANKRD12-204, Transcript of ankyrin repeat domain 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ANKRD12, Length 1,338 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD12-204ENST00000540578 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.95■■■□□ 2.7
ANKRD12-204ENST00000540578 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.19■■■□□ 2.1
ANKRD12-204ENST00000540578 ABCC9O60706 1549 aa27.06■■□□□ 1.92
ANKRD12-204ENST00000540578 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
ANKRD12-204ENST00000540578 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.53■■□□□ 1.84
ANKRD12-204ENST00000540578 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.51■■□□□ 1.83
ANKRD12-204ENST00000540578 NACADO15069 1562 aa26.44■■□□□ 1.82
ANKRD12-204ENST00000540578 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.42■■□□□ 1.82
ANKRD12-204ENST00000540578 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.31■■□□□ 1.8
ANKRD12-204ENST00000540578 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.67■■□□□ 1.7
ANKRD12-204ENST00000540578 SCRIBQ14160 1630 aa25.63■■□□□ 1.69
ANKRD12-204ENST00000540578 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.5■■□□□ 1.67
ANKRD12-204ENST00000540578 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
ANKRD12-204ENST00000540578 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.35■■□□□ 1.65
ANKRD12-204ENST00000540578 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.78■■□□□ 1.56
ANKRD12-204ENST00000540578 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
ANKRD12-204ENST00000540578 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
ANKRD12-204ENST00000540578 SMARCA4P51532 1647 aa24.65■■□□□ 1.54
ANKRD12-204ENST00000540578 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.58■■□□□ 1.53
ANKRD12-204ENST00000540578 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.54■■□□□ 1.52
ANKRD12-204ENST00000540578 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
ANKRD12-204ENST00000540578 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.51■■□□□ 1.51
ANKRD12-204ENST00000540578 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.48■■□□□ 1.51
ANKRD12-204ENST00000540578 SMARCA2P51531 1590 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD12-204ENST00000540578 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD12-204ENST00000540578 NCAPD3P42695 1498 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD12-204ENST00000540578 WIZO95785 1651 aa24.31■■□□□ 1.48
ANKRD12-204ENST00000540578 HMGXB3Q12766 1538 aa24.28■■□□□ 1.48
ANKRD12-204ENST00000540578 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ANKRD12-204ENST00000540578 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
ANKRD12-204ENST00000540578 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
ANKRD12-204ENST00000540578 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.86■■□□□ 1.41
ANKRD12-204ENST00000540578 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.71■■□□□ 1.39
ANKRD12-204ENST00000540578 CFTRP13569 1480 aa23.66■■□□□ 1.38
ANKRD12-204ENST00000540578 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.65■■□□□ 1.38
ANKRD12-204ENST00000540578 NESP48681 1621 aa23.56■■□□□ 1.36
ANKRD12-204ENST00000540578 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.5■■□□□ 1.35
ANKRD12-204ENST00000540578 PRDM2Q13029 1718 aa23.44■■□□□ 1.34
ANKRD12-204ENST00000540578 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD12-204ENST00000540578 ERCC6Q03468 1493 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD12-204ENST00000540578 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD12-204ENST00000540578 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD12-204ENST00000540578 ABCC8Q09428 1581 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD12-204ENST00000540578 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD12-204ENST00000540578 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ANKRD12-204ENST00000540578 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ANKRD12-204ENST00000540578 WDR62O43379 1518 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD12-204ENST00000540578 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
ANKRD12-204ENST00000540578 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.06■■□□□ 1.28
ANKRD12-204ENST00000540578 TOPBP1Q92547 1522 aa23.05■■□□□ 1.28
ANKRD12-204ENST00000540578 CUX1P39880 1505 aa23.03■■□□□ 1.28
ANKRD12-204ENST00000540578 TOP2BQ02880 1626 aa22.98■■□□□ 1.27
ANKRD12-204ENST00000540578 CUX2O14529 1486 aa22.97■■□□□ 1.27
ANKRD12-204ENST00000540578 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.96■■□□□ 1.27
ANKRD12-204ENST00000540578 SYNJ1O43426 1573 aa22.94■■□□□ 1.26
ANKRD12-204ENST00000540578 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.89■■□□□ 1.26
ANKRD12-204ENST00000540578 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ANKRD12-204ENST00000540578 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.87■■□□□ 1.25
ANKRD12-204ENST00000540578 TRIM41Q8WV44 630 aa22.86■■□□□ 1.25
ANKRD12-204ENST00000540578 SOGA1O94964 1423 aa22.83■■□□□ 1.25
ANKRD12-204ENST00000540578 IFT140Q96RY7 1462 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD12-204ENST00000540578 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ANKRD12-204ENST00000540578 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.74■■□□□ 1.23
ANKRD12-204ENST00000540578 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD12-204ENST00000540578 WDR97A6NE52 1622 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKRD12-204ENST00000540578 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ANKRD12-204ENST00000540578 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ANKRD12-204ENST00000540578 KIF27Q86VH2 1401 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKRD12-204ENST00000540578 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
ANKRD12-204ENST00000540578 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKRD12-204ENST00000540578 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKRD12-204ENST00000540578 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ANKRD12-204ENST00000540578 GRIN2BQ13224 1484 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD12-204ENST00000540578 EEA1Q15075 1411 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD12-204ENST00000540578 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.48■■□□□ 1.19
ANKRD12-204ENST00000540578 IGF1RP08069 1367 aa22.47■■□□□ 1.19
ANKRD12-204ENST00000540578 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.45■■□□□ 1.18
ANKRD12-204ENST00000540578 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ANKRD12-204ENST00000540578 PBRM1Q86U86 1689 aa22.41■■□□□ 1.18
ANKRD12-204ENST00000540578 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.39■■□□□ 1.18
ANKRD12-204ENST00000540578 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ANKRD12-204ENST00000540578 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.33■■□□□ 1.17
ANKRD12-204ENST00000540578 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.33■■□□□ 1.17
ANKRD12-204ENST00000540578 CUL7Q14999 1698 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD12-204ENST00000540578 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD12-204ENST00000540578 SYNJ2O15056 1496 aa22.31■■□□□ 1.16
ANKRD12-204ENST00000540578 PRXQ9BXM0 1461 aa22.28■■□□□ 1.16
ANKRD12-204ENST00000540578 ADAMTS12P58397 1594 aa22.27■■□□□ 1.16
ANKRD12-204ENST00000540578 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ANKRD12-204ENST00000540578 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ANKRD12-204ENST00000540578 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.23■■□□□ 1.15
ANKRD12-204ENST00000540578 GRIN2AQ12879 1464 aa22.19■■□□□ 1.14
ANKRD12-204ENST00000540578 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.19■■□□□ 1.14
ANKRD12-204ENST00000540578 FBLN2P98095 1184 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD12-204ENST00000540578 KIF21BO75037 1637 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD12-204ENST00000540578 OSCARQ8IYS5 282 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD12-204ENST00000540578 CHD1O14646 1710 aa22.15■■□□□ 1.14
ANKRD12-204ENST00000540578 NUP160Q12769 1436 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD12-204ENST00000540578 GOLGA3Q08378 1498 aa22.05■■□□□ 1.12
ANKRD12-204ENST00000540578 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms