Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 CYP2F2P-202ENST00000641827 1004 ntBASIC10.4□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 40.9
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AGGF1Q8N302 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.925e-7■■■■■ 40.8
AGGF1Q8N302 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.497e-7■■■■■ 40.8
AGGF1Q8N302 AC116025.1-202ENST00000570952 381 ntTSL 210.51□□□□□ -0.737e-7■■■■■ 40.8
AGGF1Q8N302 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.121e-9■■■■■ 40.8
AGGF1Q8N302 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.961e-9■■■■■ 40.8
AGGF1Q8N302 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.431e-9■■■■■ 40.8
AGGF1Q8N302 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.041e-9■■■■■ 40.8
AGGF1Q8N302 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.171e-9■■■■■ 40.8
AGGF1Q8N302 SLC41A3-208ENST00000506102 2351 ntTSL 212.34□□□□□ -0.431e-9■■■■■ 40.8
AGGF1Q8N302 SLC41A3-216ENST00000512557 3828 ntTSL 29.2□□□□□ -0.941e-9■■■■■ 40.8
AGGF1Q8N302 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.523e-8■■■■■ 40.6
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AGGF1Q8N302 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 40.6
AGGF1Q8N302 KCNQ3-207ENST00000639358 822 ntTSL 512.35□□□□□ -0.433e-8■■■■■ 40.6
AGGF1Q8N302 KCNQ3-204ENST00000521134 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 40.6
AGGF1Q8N302 KCNQ3-208ENST00000639496 4943 ntTSL 510.57□□□□□ -0.723e-8■■■■■ 40.6
AGGF1Q8N302 KCNQ3-203ENST00000519589 3464 ntTSL 29.12□□□□□ -0.953e-8■■■■■ 40.6
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AGGF1Q8N302 POLG-203ENST00000526314 700 ntTSL 315.19■□□□□ 0.023e-11■■■■■ 40.5
AGGF1Q8N302 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.013e-11■■■■■ 40.5
AGGF1Q8N302 POLG-213ENST00000631044 4668 ntTSL 514.4□□□□□ -0.13e-11■■■■■ 40.5
AGGF1Q8N302 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.173e-11■■■■■ 40.5
AGGF1Q8N302 POLG-217ENST00000636774 4151 ntTSL 513.56□□□□□ -0.243e-11■■■■■ 40.5
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AGGF1Q8N302 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-11■■■■■ 40.5
AGGF1Q8N302 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-11■■■■■ 40.5
AGGF1Q8N302 TMEM143-205ENST00000595720 1094 ntTSL 216.29■□□□□ 0.22e-11■■■■■ 40.5
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AGGF1Q8N302 TMEM143-204ENST00000593914 583 ntTSL 215.51■□□□□ 0.072e-11■■■■■ 40.5
AGGF1Q8N302 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.032e-11■■■■■ 40.5
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AGGF1Q8N302 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-11■■■■■ 40.5
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AGGF1Q8N302 JAK1-206ENST00000494904 691 ntTSL 211.52□□□□□ -0.572e-11■■■■■ 40.5
AGGF1Q8N302 CCDC85C-205ENST00000556348 556 ntTSL 510.5□□□□□ -0.732e-11■■■■■ 40.5
AGGF1Q8N302 GRIA3-209ENST00000622768 5173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.032e-11■■■■■ 40.5
AGGF1Q8N302 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.212e-11■■■■■ 40.5
AGGF1Q8N302 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.322e-11■■■■■ 40.5
AGGF1Q8N302 SRPK2-212ENST00000482897 715 ntTSL 520.67■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 40.4
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AGGF1Q8N302 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 40.4
AGGF1Q8N302 SRPK2-209ENST00000476117 703 ntTSL 28.49□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 40.4
AGGF1Q8N302 SRPK2-213ENST00000485455 436 ntTSL 35.36□□□□□ -1.552e-7■■■■■ 40.4
AGGF1Q8N302 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.62e-7■■■■■ 40.4
AGGF1Q8N302 SH3PXD2A-204ENST00000420222 3251 ntTSL 215.88■□□□□ 0.133e-8■■■■■ 40.2
AGGF1Q8N302 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 40.2
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AGGF1Q8N302 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 40.2
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AGGF1Q8N302 AP000275.2-201ENST00000431216 891 ntAPPRIS P1 TSL 58.87□□□□□ -0.997e-9■■■■■ 40.1
AGGF1Q8N302 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.682e-7■■■■■ 40.1
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AGGF1Q8N302 CCND3-209ENST00000505884 592 ntTSL 417.48■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 40.1
AGGF1Q8N302 CCND3-208ENST00000505672 932 ntTSL 217.26■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 40.1
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AGGF1Q8N302 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 40.1
AGGF1Q8N302 CCND3-220ENST00000514382 476 ntTSL 412.74□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 40.1
AGGF1Q8N302 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 40.1
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AGGF1Q8N302 SPATA3-202ENST00000423134 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.1■□□□□ 0.018e-8■■■■■ 40
AGGF1Q8N302 SPATA3-208ENST00000455816 766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.558e-8■■■■■ 40
AGGF1Q8N302 SPATA3-203ENST00000424440 1011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.568e-8■■■■■ 40
AGGF1Q8N302 SPATA3-206ENST00000452881 1618 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.628e-8■■■■■ 40
AGGF1Q8N302 SPATA3-210ENST00000612823 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.718e-8■■■■■ 40
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AGGF1Q8N302 SPATA3-205ENST00000440792 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.46□□□□□ -1.78e-8■■■■■ 40
AGGF1Q8N302 SPATA3-201ENST00000409956 436 ntTSL 33.55□□□□□ -1.848e-8■■■■■ 40
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AGGF1Q8N302 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 40
AGGF1Q8N302 DPF3-215ENST00000610283 4520 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 40
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AGGF1Q8N302 DPF3-202ENST00000381216 3229 ntTSL 1 (best)9.07□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 40
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AGGF1Q8N302 DPF3-201ENST00000366353 3687 ntTSL 27.88□□□□□ -1.152e-8■■■■■ 40
AGGF1Q8N302 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.723e-8■■■■■ 40
AGGF1Q8N302 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.643e-8■■■■■ 40
AGGF1Q8N302 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.133e-8■■■■■ 40
AGGF1Q8N302 SPIRE1-204ENST00000440472 2109 ntTSL 1 (best)8.48□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 40
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AGGF1Q8N302 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.183e-8■■■■■ 40
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