RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293261.7

TMEM143-201, Transcript of transmembrane protein 143, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM143, Length 2,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143-201ENST00000293261 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.96■■■□□ 2.71
TMEM143-201ENST00000293261 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.87■■■□□ 2.05
TMEM143-201ENST00000293261 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
TMEM143-201ENST00000293261 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.63■■□□□ 1.85
TMEM143-201ENST00000293261 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.43■■□□□ 1.82
TMEM143-201ENST00000293261 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.38■■□□□ 1.81
TMEM143-201ENST00000293261 ABCC9O60706 1549 aa26.26■■□□□ 1.79
TMEM143-201ENST00000293261 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.08■■□□□ 1.77
TMEM143-201ENST00000293261 NACADO15069 1562 aa25.91■■□□□ 1.74
TMEM143-201ENST00000293261 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
TMEM143-201ENST00000293261 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.68■■□□□ 1.7
TMEM143-201ENST00000293261 SCRIBQ14160 1630 aa25.64■■□□□ 1.7
TMEM143-201ENST00000293261 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.24■■□□□ 1.63
TMEM143-201ENST00000293261 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.94■■□□□ 1.58
TMEM143-201ENST00000293261 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.94■■□□□ 1.58
TMEM143-201ENST00000293261 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TMEM143-201ENST00000293261 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.84■■□□□ 1.57
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TMEM143-201ENST00000293261 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM143-201ENST00000293261 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
TMEM143-201ENST00000293261 SMARCA4P51532 1647 aa24.58■■□□□ 1.53
TMEM143-201ENST00000293261 WIZO95785 1651 aa24.53■■□□□ 1.52
TMEM143-201ENST00000293261 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.28■■□□□ 1.48
TMEM143-201ENST00000293261 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TMEM143-201ENST00000293261 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.19■■□□□ 1.46
TMEM143-201ENST00000293261 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TMEM143-201ENST00000293261 TRIM41Q8WV44 630 aa24.14■■□□□ 1.45
TMEM143-201ENST00000293261 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.14■■□□□ 1.45
TMEM143-201ENST00000293261 SMARCA2P51531 1590 aa24.12■■□□□ 1.45
TMEM143-201ENST00000293261 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
TMEM143-201ENST00000293261 CCDC88BA6NC98 1476 aa24■■□□□ 1.43
TMEM143-201ENST00000293261 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
TMEM143-201ENST00000293261 HMGXB3Q12766 1538 aa23.9■■□□□ 1.42
TMEM143-201ENST00000293261 NCAPD3P42695 1498 aa23.9■■□□□ 1.42
TMEM143-201ENST00000293261 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.87■■□□□ 1.41
TMEM143-201ENST00000293261 HRCP23327 699 aa23.8■■□□□ 1.4
TMEM143-201ENST00000293261 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.8■■□□□ 1.4
TMEM143-201ENST00000293261 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.75■■□□□ 1.39
TMEM143-201ENST00000293261 ABCC8Q09428 1581 aa23.71■■□□□ 1.39
TMEM143-201ENST00000293261 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TMEM143-201ENST00000293261 CFTRP13569 1480 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM143-201ENST00000293261 SOGA1O94964 1423 aa23.4■■□□□ 1.34
TMEM143-201ENST00000293261 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
TMEM143-201ENST00000293261 PRDM2Q13029 1718 aa23.35■■□□□ 1.33
TMEM143-201ENST00000293261 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.33■■□□□ 1.32
TMEM143-201ENST00000293261 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TMEM143-201ENST00000293261 SYNJ1O43426 1573 aa23.3■■□□□ 1.32
TMEM143-201ENST00000293261 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.28■■□□□ 1.32
TMEM143-201ENST00000293261 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.21■■□□□ 1.31
TMEM143-201ENST00000293261 TOP2BQ02880 1626 aa23.19■■□□□ 1.3
TMEM143-201ENST00000293261 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.17■■□□□ 1.3
TMEM143-201ENST00000293261 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.15■■□□□ 1.3
TMEM143-201ENST00000293261 EEA1Q15075 1411 aa23.15■■□□□ 1.3
TMEM143-201ENST00000293261 CUX1P39880 1505 aa23.1■■□□□ 1.29
TMEM143-201ENST00000293261 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.1■■□□□ 1.29
TMEM143-201ENST00000293261 NESP48681 1621 aa23.1■■□□□ 1.29
TMEM143-201ENST00000293261 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
TMEM143-201ENST00000293261 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.05■■□□□ 1.28
TMEM143-201ENST00000293261 CEP162Q5TB80 1403 aa23.04■■□□□ 1.28
TMEM143-201ENST00000293261 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.03■■□□□ 1.28
TMEM143-201ENST00000293261 GOLGA3Q08378 1498 aa22.98■■□□□ 1.27
TMEM143-201ENST00000293261 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM143-201ENST00000293261 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.88■■□□□ 1.25
TMEM143-201ENST00000293261 KIF21BO75037 1637 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM143-201ENST00000293261 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.87■■□□□ 1.25
TMEM143-201ENST00000293261 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.86■■□□□ 1.25
TMEM143-201ENST00000293261 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.85■■□□□ 1.25
TMEM143-201ENST00000293261 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TMEM143-201ENST00000293261 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.83■■□□□ 1.25
TMEM143-201ENST00000293261 TOPBP1Q92547 1522 aa22.82■■□□□ 1.24
TMEM143-201ENST00000293261 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TMEM143-201ENST00000293261 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TMEM143-201ENST00000293261 KIF27Q86VH2 1401 aa22.74■■□□□ 1.23
TMEM143-201ENST00000293261 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TMEM143-201ENST00000293261 CLIP1P30622 1438 aa22.71■■□□□ 1.23
TMEM143-201ENST00000293261 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TMEM143-201ENST00000293261 CUX2O14529 1486 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM143-201ENST00000293261 PRXQ9BXM0 1461 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM143-201ENST00000293261 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.64■■□□□ 1.21
TMEM143-201ENST00000293261 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.63■■□□□ 1.21
TMEM143-201ENST00000293261 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.61■■□□□ 1.21
TMEM143-201ENST00000293261 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM143-201ENST00000293261 WDR97A6NE52 1622 aa22.6■■□□□ 1.21
TMEM143-201ENST00000293261 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.55■■□□□ 1.2
TMEM143-201ENST00000293261 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
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TMEM143-201ENST00000293261 WDR62O43379 1518 aa22.52■■□□□ 1.2
TMEM143-201ENST00000293261 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TMEM143-201ENST00000293261 ERCC6Q03468 1493 aa22.5■■□□□ 1.19
TMEM143-201ENST00000293261 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
TMEM143-201ENST00000293261 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.47■■□□□ 1.19
TMEM143-201ENST00000293261 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
TMEM143-201ENST00000293261 ARAP1Q96P48 1450 aa22.42■■□□□ 1.18
TMEM143-201ENST00000293261 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.42■■□□□ 1.18
TMEM143-201ENST00000293261 APLP2Q06481 763 aa22.41■■□□□ 1.18
TMEM143-201ENST00000293261 CUL7Q14999 1698 aa22.4■■□□□ 1.18
TMEM143-201ENST00000293261 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TMEM143-201ENST00000293261 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TMEM143-201ENST00000293261 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.38■■□□□ 1.17
TMEM143-201ENST00000293261 IFT140Q96RY7 1462 aa22.34■■□□□ 1.17
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