RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415497.6

CCND3-205, Transcript of cyclin D3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCND3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3-205ENST00000415497 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.2■■■■■ 7.07
CCND3-205ENST00000415497 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.48■■■■■ 5.99
CCND3-205ENST00000415497 ABCC9O60706 1549 aa51.09■■■■■ 5.77
CCND3-205ENST00000415497 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.39■■■■■ 5.5
CCND3-205ENST00000415497 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.39■■■■■ 5.5
CCND3-205ENST00000415497 NACADO15069 1562 aa49.29■■■■■ 5.48
CCND3-205ENST00000415497 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.27■■■■■ 5.48
CCND3-205ENST00000415497 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.1■■■■■ 5.45
CCND3-205ENST00000415497 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.99■■■■■ 5.43
CCND3-205ENST00000415497 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.15■■■■■ 5.3
CCND3-205ENST00000415497 SCRIBQ14160 1630 aa47.93■■■■■ 5.26
CCND3-205ENST00000415497 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.8■■■■■ 5.24
CCND3-205ENST00000415497 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.76■■■■■ 5.24
CCND3-205ENST00000415497 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.29■■■■■ 5.16
CCND3-205ENST00000415497 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.61■■■■■ 5.05
CCND3-205ENST00000415497 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
CCND3-205ENST00000415497 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.22■■■■■ 4.99
CCND3-205ENST00000415497 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.1■■■■■ 4.97
CCND3-205ENST00000415497 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.88■■■■■ 4.93
CCND3-205ENST00000415497 SMARCA4P51532 1647 aa45.88■■■■■ 4.93
CCND3-205ENST00000415497 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.63■■■■■ 4.9
CCND3-205ENST00000415497 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.56■■■■■ 4.88
CCND3-205ENST00000415497 SMARCA2P51531 1590 aa45.52■■■■■ 4.88
CCND3-205ENST00000415497 NCAPD3P42695 1498 aa45.49■■■■■ 4.87
CCND3-205ENST00000415497 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.43■■■■■ 4.86
CCND3-205ENST00000415497 HMGXB3Q12766 1538 aa45.29■■■■■ 4.84
CCND3-205ENST00000415497 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.23■■■■■ 4.83
CCND3-205ENST00000415497 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
CCND3-205ENST00000415497 WIZO95785 1651 aa45.16■■■■■ 4.82
CCND3-205ENST00000415497 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
CCND3-205ENST00000415497 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
CCND3-205ENST00000415497 NESP48681 1621 aa44.3■■■■■ 4.68
CCND3-205ENST00000415497 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.23■■■■■ 4.67
CCND3-205ENST00000415497 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.18■■■■■ 4.66
CCND3-205ENST00000415497 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.18■■■■■ 4.66
CCND3-205ENST00000415497 ERCC6Q03468 1493 aa44.02■■■■■ 4.64
CCND3-205ENST00000415497 CFTRP13569 1480 aa43.99■■■■■ 4.63
CCND3-205ENST00000415497 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.94■■■■■ 4.62
CCND3-205ENST00000415497 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.77■■■■■ 4.6
CCND3-205ENST00000415497 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.67■■■■■ 4.58
CCND3-205ENST00000415497 PRDM2Q13029 1718 aa43.65■■■■■ 4.58
CCND3-205ENST00000415497 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.59■■■■■ 4.57
CCND3-205ENST00000415497 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
CCND3-205ENST00000415497 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.45■■■■■ 4.55
CCND3-205ENST00000415497 CUX2O14529 1486 aa43.43■■■■■ 4.54
CCND3-205ENST00000415497 WDR62O43379 1518 aa43.3■■■■■ 4.52
CCND3-205ENST00000415497 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
CCND3-205ENST00000415497 ABCC8Q09428 1581 aa43.02■■■■■ 4.48
CCND3-205ENST00000415497 TOPBP1Q92547 1522 aa43.01■■■■■ 4.48
CCND3-205ENST00000415497 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.97■■■■■ 4.47
CCND3-205ENST00000415497 CUX1P39880 1505 aa42.79■■■■■ 4.44
CCND3-205ENST00000415497 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.67■■■■■ 4.42
CCND3-205ENST00000415497 IFT140Q96RY7 1462 aa42.65■■■■■ 4.42
CCND3-205ENST00000415497 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.65■■■■■ 4.429e-6■■■■■ 50.1
CCND3-205ENST00000415497 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.61■■■■■ 4.41
CCND3-205ENST00000415497 TOP2BQ02880 1626 aa42.51■■■■■ 4.4
CCND3-205ENST00000415497 SYNJ1O43426 1573 aa42.51■■■■■ 4.4
CCND3-205ENST00000415497 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
CCND3-205ENST00000415497 SOGA1O94964 1423 aa42.5■■■■■ 4.39
CCND3-205ENST00000415497 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.49■■■■■ 4.39
CCND3-205ENST00000415497 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.47■■■■■ 4.39
CCND3-205ENST00000415497 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
CCND3-205ENST00000415497 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
CCND3-205ENST00000415497 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.25■■■■■ 4.354e-7■■■■■ 38.3
CCND3-205ENST00000415497 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
CCND3-205ENST00000415497 WDR97A6NE52 1622 aa42.22■■■■■ 4.35
CCND3-205ENST00000415497 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.21■■■■■ 4.35
CCND3-205ENST00000415497 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.02■■■■■ 4.32
CCND3-205ENST00000415497 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.01■■■■■ 4.31
CCND3-205ENST00000415497 GRIN2BQ13224 1484 aa41.97■■■■■ 4.31
CCND3-205ENST00000415497 PBRM1Q86U86 1689 aa41.88■■■■■ 4.3
CCND3-205ENST00000415497 TRIM41Q8WV44 630 aa41.87■■■■■ 4.29
CCND3-205ENST00000415497 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.86■■■■■ 4.29
CCND3-205ENST00000415497 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
CCND3-205ENST00000415497 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.74■■■■■ 4.27
CCND3-205ENST00000415497 KIF27Q86VH2 1401 aa41.74■■■■■ 4.27
CCND3-205ENST00000415497 OSCARQ8IYS5 282 aa41.72■■■■■ 4.27
CCND3-205ENST00000415497 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.71■■■■■ 4.27
CCND3-205ENST00000415497 FBLN2P98095 1184 aa41.71■■■■■ 4.27
CCND3-205ENST00000415497 CHD1O14646 1710 aa41.68■■■■■ 4.26
CCND3-205ENST00000415497 SYNJ2O15056 1496 aa41.66■■■■■ 4.26
CCND3-205ENST00000415497 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
CCND3-205ENST00000415497 ADAMTS12P58397 1594 aa41.57■■■■■ 4.25
CCND3-205ENST00000415497 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.55■■■■■ 4.24
CCND3-205ENST00000415497 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.54■■■■■ 4.24
CCND3-205ENST00000415497 IGF1RP08069 1367 aa41.53■■■■■ 4.24
CCND3-205ENST00000415497 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.44■■■■■ 4.22
CCND3-205ENST00000415497 GRIN2AQ12879 1464 aa41.43■■■■■ 4.22
CCND3-205ENST00000415497 CUL7Q14999 1698 aa41.38■■■■■ 4.22
CCND3-205ENST00000415497 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.29■■■■■ 4.2
CCND3-205ENST00000415497 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.24■■■■■ 4.19
CCND3-205ENST00000415497 NUP160Q12769 1436 aa41.23■■■■■ 4.19
CCND3-205ENST00000415497 CEP170Q5SW79 1584 aa41.2■■■■■ 4.19
CCND3-205ENST00000415497 EEA1Q15075 1411 aa41.14■■■■■ 4.18
CCND3-205ENST00000415497 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.08■■■■■ 4.17
CCND3-205ENST00000415497 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.04■■■■■ 4.16
CCND3-205ENST00000415497 ARHGEF11O15085 1522 aa41.02■■■■■ 4.16
CCND3-205ENST00000415497 PRXQ9BXM0 1461 aa41■■■■■ 4.15
CCND3-205ENST00000415497 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
CCND3-205ENST00000415497 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.97■■■■■ 4.15
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