RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620944.4

NME4-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-211ENST00000620944 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.27■■■■■ 6.12
NME4-211ENST00000620944 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.49■■■■■ 5.19
NME4-211ENST00000620944 ABCC9O60706 1549 aa47.01■■■■■ 5.12
NME4-211ENST00000620944 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.99■■■■■ 4.79
NME4-211ENST00000620944 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.89■■■■■ 4.78
NME4-211ENST00000620944 NACADO15069 1562 aa44.82■■■■■ 4.76
NME4-211ENST00000620944 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.36■■■■■ 4.69
NME4-211ENST00000620944 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
NME4-211ENST00000620944 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.01■■■■■ 4.64
NME4-211ENST00000620944 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.9■■■■■ 4.621e-8■■□□□ 14.2
NME4-211ENST00000620944 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.78■■■■■ 4.6
NME4-211ENST00000620944 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.54■■■■■ 4.56
NME4-211ENST00000620944 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.48■■■■■ 4.55
NME4-211ENST00000620944 SCRIBQ14160 1630 aa43.39■■■■■ 4.54
NME4-211ENST00000620944 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.13■■■■■ 4.5
NME4-211ENST00000620944 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
NME4-211ENST00000620944 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.43■■■■■ 4.38
NME4-211ENST00000620944 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.3■■■■■ 4.36
NME4-211ENST00000620944 SMARCA4P51532 1647 aa41.4■■■■■ 4.22
NME4-211ENST00000620944 NCAPD3P42695 1498 aa41.35■■■■■ 4.21
NME4-211ENST00000620944 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
NME4-211ENST00000620944 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.33■■■■■ 4.21
NME4-211ENST00000620944 SMARCA2P51531 1590 aa41.28■■■■■ 4.2
NME4-211ENST00000620944 HMGXB3Q12766 1538 aa41.11■■■■■ 4.17
NME4-211ENST00000620944 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.03■■■■■ 4.16
NME4-211ENST00000620944 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
NME4-211ENST00000620944 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.97■■■■■ 4.15
NME4-211ENST00000620944 ERCC6Q03468 1493 aa40.64■■■■■ 4.1
NME4-211ENST00000620944 WIZO95785 1651 aa40.55■■■■■ 4.08
NME4-211ENST00000620944 NESP48681 1621 aa40.51■■■■■ 4.08
NME4-211ENST00000620944 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
NME4-211ENST00000620944 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.33■■■■■ 4.05
NME4-211ENST00000620944 CUX2O14529 1486 aa40.26■■■■■ 4.04
NME4-211ENST00000620944 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.17■■■■■ 4.02
NME4-211ENST00000620944 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.16■■■■■ 4.02
NME4-211ENST00000620944 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
NME4-211ENST00000620944 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.95■■■■□ 3.99
NME4-211ENST00000620944 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
NME4-211ENST00000620944 CFTRP13569 1480 aa39.81■■■■□ 3.96
NME4-211ENST00000620944 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.75■■■■□ 3.95
NME4-211ENST00000620944 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.73■■■■□ 3.95
NME4-211ENST00000620944 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.72■■■■□ 3.95
NME4-211ENST00000620944 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.68■■■■□ 3.94
NME4-211ENST00000620944 WDR62O43379 1518 aa39.57■■■■□ 3.93
NME4-211ENST00000620944 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.56■■■■□ 3.92
NME4-211ENST00000620944 PRDM2Q13029 1718 aa39.34■■■■□ 3.89
NME4-211ENST00000620944 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
NME4-211ENST00000620944 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
NME4-211ENST00000620944 ABCC8Q09428 1581 aa39■■■■□ 3.83
NME4-211ENST00000620944 TOPBP1Q92547 1522 aa39■■■■□ 3.83
NME4-211ENST00000620944 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.91■■■■□ 3.82
NME4-211ENST00000620944 IFT140Q96RY7 1462 aa38.9■■■■□ 3.82
NME4-211ENST00000620944 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
NME4-211ENST00000620944 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
NME4-211ENST00000620944 OSCARQ8IYS5 282 aa38.59■■■■□ 3.77
NME4-211ENST00000620944 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
NME4-211ENST00000620944 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
NME4-211ENST00000620944 SOGA1O94964 1423 aa38.53■■■■□ 3.76
NME4-211ENST00000620944 CUX1P39880 1505 aa38.53■■■■□ 3.76
NME4-211ENST00000620944 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.51■■■■□ 3.76
NME4-211ENST00000620944 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.5■■■■□ 3.75
NME4-211ENST00000620944 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.48■■■■□ 3.752e-7■■■■■ 32.9
NME4-211ENST00000620944 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.73
NME4-211ENST00000620944 WDR97A6NE52 1622 aa38.25■■■■□ 3.71
NME4-211ENST00000620944 FBLN2P98095 1184 aa38.24■■■■□ 3.71
NME4-211ENST00000620944 TRIM41Q8WV44 630 aa38.19■■■■□ 3.7
NME4-211ENST00000620944 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.19■■■■□ 3.72e-6■■■□□ 15
NME4-211ENST00000620944 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.13■■■■□ 3.69
NME4-211ENST00000620944 GRIN2BQ13224 1484 aa38.12■■■■□ 3.69
NME4-211ENST00000620944 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.09■■■■□ 3.69
NME4-211ENST00000620944 CHD1O14646 1710 aa38.09■■■■□ 3.69
NME4-211ENST00000620944 TOP2BQ02880 1626 aa38.08■■■■□ 3.69
NME4-211ENST00000620944 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.06■■■■□ 3.68
NME4-211ENST00000620944 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
NME4-211ENST00000620944 SYNJ1O43426 1573 aa38.04■■■■□ 3.68
NME4-211ENST00000620944 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.04■■■■□ 3.68
NME4-211ENST00000620944 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
NME4-211ENST00000620944 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.93■■■■□ 3.66
NME4-211ENST00000620944 SYNJ2O15056 1496 aa37.92■■■■□ 3.66
NME4-211ENST00000620944 PBRM1Q86U86 1689 aa37.92■■■■□ 3.66
NME4-211ENST00000620944 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.9■■■■□ 3.66
NME4-211ENST00000620944 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.9■■■■□ 3.66
NME4-211ENST00000620944 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.9■■■■□ 3.66
NME4-211ENST00000620944 ARHGEF11O15085 1522 aa37.9■■■■□ 3.66
NME4-211ENST00000620944 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.7■■■■□ 3.63
NME4-211ENST00000620944 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.66■■■■□ 3.62
NME4-211ENST00000620944 ADAMTS12P58397 1594 aa37.63■■■■□ 3.62
NME4-211ENST00000620944 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.63■■■■□ 3.61
NME4-211ENST00000620944 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.61■■■■□ 3.61
NME4-211ENST00000620944 GRIN2AQ12879 1464 aa37.61■■■■□ 3.61
NME4-211ENST00000620944 ARAP1Q96P48 1450 aa37.55■■■■□ 3.6
NME4-211ENST00000620944 KIF27Q86VH2 1401 aa37.44■■■■□ 3.58
NME4-211ENST00000620944 NUP160Q12769 1436 aa37.44■■■■□ 3.58
NME4-211ENST00000620944 CEP170Q5SW79 1584 aa37.4■■■■□ 3.58
NME4-211ENST00000620944 IGF1RP08069 1367 aa37.29■■■■□ 3.56
NME4-211ENST00000620944 CUL7Q14999 1698 aa37.19■■■■□ 3.54
NME4-211ENST00000620944 SHROOM2Q13796 1616 aa37.14■■■■□ 3.54
NME4-211ENST00000620944 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.14■■■■□ 3.54
NME4-211ENST00000620944 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
NME4-211ENST00000620944 JPH4Q96JJ6 628 aa37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms