RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.56■■■■■ 6.64
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NME4-209ENST00000460297 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.48■■■■■ 5.03
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NME4-209ENST00000460297 SMARCA4P51532 1647 aa43.63■■■■■ 4.58
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NME4-209ENST00000460297 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.15■■■■■ 4.5
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NME4-209ENST00000460297 SMARCA2P51531 1590 aa43.02■■■■■ 4.48
NME4-209ENST00000460297 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.01■■■■■ 4.48
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NME4-209ENST00000460297 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
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NME4-209ENST00000460297 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.64■■■■■ 4.26
NME4-209ENST00000460297 NESP48681 1621 aa41.51■■■■■ 4.24
NME4-209ENST00000460297 PRDM2Q13029 1718 aa41.48■■■■■ 4.23
NME4-209ENST00000460297 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.48■■■■■ 4.23
NME4-209ENST00000460297 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.33■■■■■ 4.21
NME4-209ENST00000460297 ABCC8Q09428 1581 aa41.25■■■■■ 4.19
NME4-209ENST00000460297 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.18■■■■■ 4.18
NME4-209ENST00000460297 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.13■■■■■ 4.17
NME4-209ENST00000460297 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.05■■■■■ 4.16
NME4-209ENST00000460297 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.04■■■■■ 4.162e-6■■■□□ 15
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NME4-209ENST00000460297 SYNJ1O43426 1573 aa40.94■■■■■ 4.14
NME4-209ENST00000460297 CUX1P39880 1505 aa40.88■■■■■ 4.13
NME4-209ENST00000460297 TOP2BQ02880 1626 aa40.83■■■■■ 4.13
NME4-209ENST00000460297 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.82■■■■■ 4.12
NME4-209ENST00000460297 ERCC6Q03468 1493 aa40.77■■■■■ 4.12
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NME4-209ENST00000460297 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
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NME4-209ENST00000460297 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.68■■■■□ 3.94
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NME4-209ENST00000460297 GRIN2AQ12879 1464 aa39.14■■■■□ 3.86
NME4-209ENST00000460297 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
NME4-209ENST00000460297 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.06■■■■□ 3.84
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NME4-209ENST00000460297 CHD1O14646 1710 aa39.03■■■■□ 3.84
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